| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,608,820 | 0 | A | T | 5.9% | 386.9 / 12.0 | 119 | intergenic (‑671/+159) | USA300HOU_2470/USA300HOU_2471 | dehydrogenase/hypothetical protein |
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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aaGCCACATCCAATATAGGGCGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGa < 2:73037/141‑1 (MQ=255) aGCCACATCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGAc < 1:619214/141‑1 (MQ=255) aGCCACATCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGAc > 2:1139160/1‑141 (MQ=255) cacgtCCTATATTGGATGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAg > 1:343596/5‑141 (MQ=255) cgtCCTATATTGGATGGGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAggg > 2:289541/3‑141 (MQ=255) caTCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAggg > 2:776488/1‑141 (MQ=255) caTCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAggg > 1:1511258/1‑141 (MQ=255) aTCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAgggg > 1:1318533/1‑141 (MQ=255) tCCTATATTGGATGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCa < 1:982579/89‑1 (MQ=255) cAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAGGGgtag > 2:1027545/1‑141 (MQ=255) | ACGTAATTTTAAACAAGTTGAAAATGAAGGATTCTAATATCATTTCGTTTATATATAGCAGACATGATAGAATTTTATATGTAAATCTTGTAGGTAATCGTTTTAAAAATAATATAAGTATGACT‑AAAGCCACATCCAATATAGGACGTGGCTTTTAGTATCGTTCCAGATTTGTGGGGAGTTAGGGTTTACTTAATTAAAGGGGTCTGCCCTCAATTGCTCACCAACGAGGGCAAGTTACATCAATCACACTTCAATTGCCGCCGACTAGGGGTAG > CP000730/2608683‑2608959 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |