Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | CP000730 | 76,185 | 0 | G | A | 9.0% | 573.2 / 35.8 | 208 | intergenic (+243/‑891) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (99/90); new base A (9/10); total (108/100) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.11e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 227 total aligned reads displayed.
TTAATATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAA > CP000730/76045‑76325 | ttAATATAACTAATATNGCTGCACCTGTANCACTTAGAACAGCGAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAg > 1:1193884/1‑141 (MQ=255) aaTATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 1:272865/141‑1 (MQ=255) aaTATAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGta < 1:49149/141‑1 (MQ=255) atatAACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGtat > 2:1173903/1‑141 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |