| Predicted mutation | |||||||
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| RA | CP000730 | 618,351 | T→C | 5.3% | D1151D (GAT→GAC) | sdrD → | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 618,351 | 0 | T | C | 5.3% | 373.1 / 6.1 | 139 | D1151D (GAT→GAC) | sdrD | Ser‑Asp rich fibrinogen/bone sialoprotein‑binding protein SdrD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (58/71); new base C (5/3); total (65/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
ACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATACTACGAAGAAGAAACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTC > CP000730/618211‑618491 | aCAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATCCTCCGAAGAAGAAACATAAGATAGCGACTCAGATACGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCgat < 1:414491/141‑1 (MQ=255)aCAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATACTACGAAGAAGAAACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCgat < 2:256555/141‑1 (MQ=255)aCAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATACTACGAAGAAGAAACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCgat < 1:353194/141‑1 (MQ=255) aaTTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATACTACGAAGAAGAAACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCgattc < 1:165062/141‑1 (MQ=255) 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(MQ=17) tAGTGATTCAGACGAGGATAACGATGCAGATGCAGACAGCGATTCAGAGGCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGcgactcagattcagacagcgactcagattcagacag < 2:360575/141‑1 (MQ=21) tGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGActcagattcagacagcgactcagattcagacagcga < 1:323550/141‑1 (MQ=255) ttCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCagattcagacagcgactcggattcagacagcgactc > 1:108481/1‑141 (MQ=255) aaGACTCTGAGAGCGATTCTGATTCAGACAGCGATGCAGATTCATATGGCGATTCAGACTCAGACATAGACTCAGATAGTGATTCAGCCTCAGATAGCGACTCAGattcagacagcgactcagattcagacagcgactcag < 2:20540/140‑1 (MQ=18) gACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATtcagacagcgactcagactcagacagcgactcagac > 2:603991/1‑141 (MQ=255) aCTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCgactcagact > 1:1609249/1‑141 (MQ=255) cTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCagacagcgactcagactcagacagcgactcagactc > 2:88240/1‑141 (MQ=255) agcGGATAGCGATTCAGATTGAGACATAGAAATAGAGTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGTGACTCAGATAGTGATGCAGAATCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCgactcagactc < 2:1289176/139‑1 (MQ=18) cGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTTATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGAGCCAGATTCAGACAGAGactcagactcag > 2:177418/1‑141 (MQ=255) ggATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGActcagactcgga > 2:441342/1‑141 (MQ=255) tAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAg < 1:164518/141‑1 (MQ=255) | ACAATTACGGATCATGATGATTTCACACTTGATAATGGATACTACGAAGAAGAAACATCAGATAGCGACTCAGATTCGGACAGCGACTCAGATTCAGACAGAGACTCAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCGGATAGCGATTCAGATTCAGACAGCGATTCAGATTCAGATAGCGATTCAGATTCAGACAGAGACTCAGATAGTGATTCAGACTCAGATAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGATTCAGACAGCGACTCAGACTCAGATAGTGATTC > CP000730/618211‑618491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |