| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 1,343,619 | 0 | A | C | 5.2% | 396.3 / 10.8 | 128 | intergenic (+32/‑98) | USA300HOU_1250/USA300HOU_1251 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/64); new base C (4/3); total (60/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
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AAAATACAAGAGATAATTATTTTATTCATGCCATAGACAGAATATACATAAATACTAGTAAAGGGCTATTTCCTGAATCTGAACTCGTAGCATGGGGATAAAGAAAGTTTACTTTAAAAATTTTAACCTTCAAATGTGAAGGTTATTTTTTATTGCCCAAAACGTGCTGATGACATTTTAAAAGCAAGTATGGAATATCAGTCGACAGACTATAAACGGAGGTATATCTCATGGAAAACAATGATAGCAATGAAGTAGCTTATTTGTTAAA > CP000730/1343487‑1343757 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |