| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,787,555 | G→A | 5.2% | intergenic (+101/‑139) | USA300HOU_2639 → / → USA300HOU_2640 | hypothetical protein/BglG family transcriptional antiterminator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,787,555 | 0 | G | A | 5.2% | 235.9 / 2.9 | 77 | intergenic (+101/‑139) | USA300HOU_2639/USA300HOU_2640 | hypothetical protein/BglG family transcriptional antiterminator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/38); new base A (2/2); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.88e-01 | |||||||||||
TCTAAACAAACACCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGTTAAA > CP000730/2787416‑2787694 | tCTAAACAAACACCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGc > 1:558037/1‑141 (MQ=255) acaaacaCCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAAt < 1:111192/141‑1 (MQ=255) aaacaCCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTc < 2:8390/141‑1 (MQ=255) gacacCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTTTGTAAGTATCAGATGCATAAATTCAGAAAAACCGCAGTGAGATCTTTTCCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCg < 2:114209/140‑1 (MQ=255) aacaCCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCg > 2:176292/1‑141 (MQ=255) acCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCAc < 1:430178/141‑1 (MQ=255) acCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCAc > 1:173423/1‑141 (MQ=255) cTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCActc > 2:431433/1‑141 (MQ=255) cTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTCCTTTATTTGCATAATTCGCActc > 1:265388/1‑141 (MQ=255) tCAAGCACATTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCATTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCActct < 1:299188/141‑1 (MQ=255) tCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAACACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCActct < 2:691833/141‑1 (MQ=255) tCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCActct < 2:661716/141‑1 (MQ=255) aaGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGt > 2:251393/1‑141 (MQ=255) cacaATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTaa > 2:221262/1‑141 (MQ=255) caATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTaaaa < 1:567586/141‑1 (MQ=255) aaTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGACAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAAt < 1:281290/141‑1 (MQ=255) aaTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATTTTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTACATAATTCGCACTCTGTTAAAAt > 2:164061/1‑141 (MQ=255) aaTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATTTTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTACATAATTCGCACTCTGTTAAAAt > 2:164135/1‑141 (MQ=255) aTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATc > 1:165906/1‑141 (MQ=255) aTCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTCCTATTTGAAATATCTTACTTCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATc > 2:613876/1‑141 (MQ=255) cACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCat > 1:124728/1‑141 (MQ=255) ccTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCatat < 1:675/141‑1 (MQ=255) ccTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCatat > 2:22746/1‑141 (MQ=255) aTTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTCTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGtt < 1:587115/141‑1 (MQ=255) cATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCttt > 1:513044/1‑141 (MQ=255) cATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCttt < 2:638697/141‑1 (MQ=255) ccTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTc > 1:391282/1‑141 (MQ=255) aTACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGGGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTg > 2:242667/1‑141 (MQ=255) tACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGa > 1:710304/1‑141 (MQ=255) cacaAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACATCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAACAGTTCGCTTTAATGTCATTGACgtatg < 2:19506/141‑1 (MQ=255) caAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTGTATTTTAGATATCTGACTGCTGTTCTTTATTGGCATGATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAGAAGTGCGCTTTTATGTCATGGACgtaggga > 2:242195/1‑137 (MQ=255) caAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACgtatgta < 1:159018/141‑1 (MQ=255) gTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATaa > 2:492168/1‑141 (MQ=255) aTGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCa < 1:159402/141‑1 (MQ=255) cATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAACAGTGCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGt < 2:415635/141‑1 (MQ=255) tAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTCCTATTTGAAATATCTTACTTCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGttt < 1:613876/141‑1 (MQ=255) aaTTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTtaa < 1:176292/141‑1 (MQ=255) aTTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTtaat > 1:131642/1‑141 (MQ=255) aGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAataata < 2:30446/141‑1 (MQ=255) aGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAataata > 2:382385/1‑141 (MQ=255) gAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTTTTTTTTTTTTATCTTACTGCTGTTCTTTATTTTAATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATATAAGTTCGCTTTAATTTCATTGACAAATGTATAAGCTCTCATGTTTTATTatat > 2:680424/1‑141 (MQ=255) gAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAatat > 2:556462/1‑141 (MQ=255) gAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAatat > 1:427147/1‑141 (MQ=255) aaaCAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTaa < 1:598012/141‑1 (MQ=255) aCAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATa > 1:146762/1‑141 (MQ=255) agcatTCAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCTCACTCTGTTAAAATCATATATAAGTTCGCTTTAATGGCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATaca < 2:4420/141‑1 (MQ=255) cagTGAGATATTTTTTTTTTTTTTATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTT‑AAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACAccc > 2:660227/1‑141 (MQ=255) cagTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACAcc < 1:121941/141‑1 (MQ=255) ggtatTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTGAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTAGAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTaaa > 2:586398/3‑141 (MQ=255) gaTATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATNTTAATACACCCTTaaa < 1:407290/141‑1 (MQ=255) atatTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAACCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTaaaa > 2:302883/1‑141 (MQ=255) cTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTac < 2:185292/141‑1 (MQ=255) tATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCTCTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTaca < 1:585532/141‑1 (MQ=255) aTTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTacac < 1:240700/141‑1 (MQ=255) tttGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTACATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACg < 1:164061/141‑1 (MQ=255) tttGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTACATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACg < 1:164135/141‑1 (MQ=255) ttttatatCTTACTGCAGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATTTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGaa > 2:692536/5‑141 (MQ=255) gAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGaaa > 2:611678/1‑141 (MQ=255) gAAATATATTACAGCTGTTCTTTATTTGCATAATTAGAAATCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGCCATTGACGTATGTATAAACTCTCATGTTTAATAATATTAAAAAAAAAAAAAAAACGCTTACACGaaa < 2:140964/141‑1 (MQ=255) tatCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAAtt < 2:5995/141‑1 (MQ=255) tatCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGATAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAAAGCTAAAAAAAAAAAtt < 2:558037/141‑1 (MQ=255) atCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAAttt < 2:226508/141‑1 (MQ=255) tCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTa > 2:183857/1‑141 (MQ=255) tCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTa > 2:280743/1‑141 (MQ=255) tCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTa > 1:282981/1‑141 (MQ=255) cTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAg < 2:411418/141‑1 (MQ=255) cTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAg > 1:312478/1‑141 (MQ=255) tgctgTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAagg < 1:131909/141‑1 (MQ=255) tCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAAACATATAAAAGCTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCAAATTTAATAATATTAATACACCCATAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTAc < 2:343564/141‑1 (MQ=255) tttATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACAt < 1:677025/141‑1 (MQ=255) ttATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATg > 2:545542/1‑141 (MQ=255) ttATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATg > 1:647622/1‑141 (MQ=255) tATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATCAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGt < 1:674221/141‑1 (MQ=255) tATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGt < 1:674288/141‑1 (MQ=255) aTTTGCATAATTCGCACTCTGTT‑AAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGTTa < 1:660227/141‑1 (MQ=255) tttGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGTTa < 2:381189/141‑1 (MQ=255) tGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGTTaaa > 1:671391/1‑141 (MQ=255) | TCTAAACAAACACCTCAAGCACAATCACCTAAAAATTAATCATTTGCCTGATACGTCCACAAGTACCAGATGCATAAATTCAGAAAAACAGCAGTGAGATATTTTTCTATTTGAAATATCTTACTGCTGTTCTTTATTTGCATAATTCGCACTCTGTTAAAATCATATAAAAGTTCGCTTTAATGTCATTGACGTATGTATAAGCTCTCATGTTTAATAATATTAATACACCCTTAAAAACGCTTACACGAAAAATTTAGAAAGGAGGTACATGTTAAA > CP000730/2787416‑2787694 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |