| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 111,560 | T→C | 9.9% | R210R (CGT→CGC) | USA300HOU_0110 → | possible staphylococcal tandem lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 111,560 | 0 | T | C | 9.9% | 199.8 / 11.0 | 71 | R210R (CGT→CGC) | USA300HOU_0110 | possible staphylococcal tandem lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/28); new base C (2/5); total (38/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.26e-01 | |||||||||||
AGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTGA > CP000730/111424‑111700 | aGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCaaaa < 1:342344/141‑1 (MQ=255)aGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCAGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTaaaa > 2:461140/1‑141 (MQ=255) ttttGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAGata < 1:667751/141‑1 (MQ=255) tGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGa > 1:92312/1‑141 (MQ=255) tGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGa > 1:595766/1‑141 (MQ=255) tGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGa < 2:613170/141‑1 (MQ=255) gcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAgatatgatat > 2:164281/1‑141 (MQ=255) gcAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAGATATGatat < 2:544542/141‑4 (MQ=14) ttttttttcAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGTCTATATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAGATATGAtata > 2:35358/9‑141 (MQ=11) cAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATa < 2:411197/141‑1 (MQ=255) ataGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAGATATGATATAccga < 1:508147/141‑3 (MQ=14) aGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATGATATAATCCAGAGGTGCAGAGTTATTCGGCTAAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGCAAAAGATATGATATAccgacg < 2:453738/141‑5 (MQ=11) gCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACcaacaa > 1:699214/1‑141 (MQ=255) ttttAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATaa > 2:85998/1‑141 (MQ=255) tttAAAAATTTAAAGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCGAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATTATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATaaa < 2:457341/141‑1 (MQ=255) tAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAgc < 1:220657/141‑1 (MQ=255) aaGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAgcgc > 1:215956/1‑141 (MQ=255) aGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGcc < 1:440127/141‑1 (MQ=255) aTTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGATTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGa < 2:414608/141‑1 (MQ=255) ttAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAg < 2:527341/141‑1 (MQ=255) aTGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtg < 1:337316/141‑1 (MQ=255) tGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtgt < 1:263745/141‑1 (MQ=255) aTTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCtgttgt > 1:177298/1‑141 (MQ=255) ataAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGa < 2:358477/141‑1 (MQ=255) ataAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGa > 1:464596/1‑141 (MQ=255) taAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGTAAAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGa > 1:458472/1‑141 (MQ=255) aGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAgg < 2:320763/141‑1 (MQ=255) tGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTAc > 1:630916/1‑141 (MQ=255) agaTATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAgg > 1:294124/1‑141 (MQ=255) gaTATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGa > 2:653197/1‑90 (MQ=255) gaTATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGa < 1:653197/90‑1 (MQ=255) gaTATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAggg < 2:402328/141‑1 (MQ=255) aaTCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGt < 1:506804/141‑1 (MQ=255) ccAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTtca > 2:37798/1‑141 (MQ=255) ccAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGACGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAATGTACAGGGAATTTAAAAGGTtca > 2:92468/1‑141 (MQ=255) agagGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGcc < 2:148937/99‑1 (MQ=255) agagGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGcc > 1:148937/1‑99 (MQ=255) agagGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTtcatc > 1:567262/1‑141 (MQ=255) ggTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTAAGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGt < 2:245191/141‑1 (MQ=255) gCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTgg > 1:296712/1‑141 (MQ=255) gCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTgg > 1:157139/1‑141 (MQ=255) gCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAAATTAAAAGGTTCATCAGTTgg > 2:440830/1‑141 (MQ=255) cGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGat > 2:74488/1‑141 (MQ=255) gAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGata < 2:616663/141‑1 (MQ=255) gAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGAGGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAATATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGata > 2:417917/1‑141 (MQ=255) gTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGAtata > 1:469563/1‑141 (MQ=255) tATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATaaa < 1:21109/141‑1 (MQ=255) tCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATaaaaaa > 2:620957/1‑141 (MQ=255) tCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGa > 1:452297/1‑141 (MQ=255) cAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGaa < 2:445423/141‑1 (MQ=255) cAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGaa < 2:177298/141‑1 (MQ=255) aaTTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATTCCAACAAATAAAGCGCCGAATCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtt < 1:136057/141‑1 (MQ=255) aaTTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAACTACGTAAACGTTATGACATACCAACTTATCTAGCTTCGAAGCGGTTGTTTAAATGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACtt < 1:136149/141‑1 (MQ=17) tAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACttttt > 2:459610/1‑141 (MQ=255) aCTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTa > 1:444847/1‑141 (MQ=255) cTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTg < 1:341355/126‑1 (MQ=255) cTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTg > 2:341355/1‑126 (MQ=255) cTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTag < 1:337342/141‑1 (MQ=255) tgatgaTTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGaa > 2:57246/1‑141 (MQ=255) tgatgaTTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGaa > 2:57306/1‑141 (MQ=255) gatgatTAT‑ATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTGAGAGAATa > 2:569053/1‑141 (MQ=255) gatTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATaaa > 2:489820/1‑141 (MQ=255) tataATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAAt < 2:294124/141‑1 (MQ=255) ataATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATg < 1:389812/141‑1 (MQ=255) cAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttac < 1:358080/141‑1 (MQ=255) ttACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttt > 2:514951/1‑141 (MQ=255) ttACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttt > 1:210601/1‑141 (MQ=255) tACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttacttta > 1:662134/1‑141 (MQ=255) aCGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATAtttactttac > 1:72411/1‑141 (MQ=255) cGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATttactttact > 2:401702/1‑141 (MQ=255) gTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTg < 2:699214/141‑1 (MQ=255) tAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTGa > 2:173164/1‑141 (MQ=255) | AGTTTTTTGCGCAATATAGCAATTTTAAAGATTTAATGAATTATAAAGATGGAGATATATCATATAATCCAGAGGTGCCGAGTTATTCAGCTCAATATCAATTAACTAATGATGATTATAATGT‑AAAACAATTACGTAAAAGATATGACATACCAACAAATAAAGCGCCGAAGCTGTTGTTGAAAGGTACAGGGAATTTAAAAGGTTCATCAGTTGGATATAAAAAAATTGAATTTACTTTTTTAGAGAATAAAAATGAAAATATTTACTTTACTGA > CP000730/111424‑111700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |