| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 846,387 | A→T | 5.4% | S278S (TCA→TCT) | yvcD → | hypothetical TPR domain protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 846,387 | 0 | A | T | 5.4% | 240.5 / 3.3 | 74 | S278S (TCA→TCT) | yvcD | hypothetical TPR domain protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/37); new base T (2/2); total (35/39) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.46e-01 | |||||||||||
ATTTAAAAATATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGTAATTGAAAATAGCAA > CP000730/846248‑846524 | atTTAAAAATATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCaa > 1:49297/1‑141 (MQ=255)atTTAAAAATATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCaa < 1:594946/141‑1 (MQ=255) tttAAAAATATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAAt < 1:167783/141‑1 (MQ=255) aaaTATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTATATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGGATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCaaa < 2:478885/141‑1 (MQ=255) atTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATAACAACTATTGTTGTAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTa < 2:467932/141‑1 (MQ=255) aaaCAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACaa < 2:486575/141‑1 (MQ=255) aaaCAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACaa > 2:15638/1‑141 (MQ=255) aaCAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAAt < 2:246281/141‑1 (MQ=255) aaCAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATGAGGTATTGTATTAAGTCATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAAGTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGCGGAAGTTTTATCAGTTCAAAAATACAAt > 2:493799/1‑141 (MQ=255) gTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTa > 1:284986/1‑141 (MQ=255) gTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTa > 2:132044/1‑141 (MQ=255) tGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGc < 2:266765/141‑1 (MQ=255) ccTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCTATTCAAATGTACAATGCTTTAGCatat > 2:655493/1‑141 (MQ=255) ccTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCTATTCAAATGTACAATGCTTTAGCatat > 2:301183/1‑141 (MQ=255) atgaCGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTAAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCGTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAattatt < 2:457661/141‑1 (MQ=255) gATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTTTCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAattattattat > 1:581622/1‑141 (MQ=255) aTGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAattattattatt > 2:96303/1‑141 (MQ=255) aaGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAgg > 1:188862/1‑141 (MQ=255) tttAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTgaa > 1:697156/1‑141 (MQ=255) aaTTATGTATTGTATTAATTTATTTAAAGCATTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGCGaagaag < 1:627109/141‑1 (MQ=255) aTTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAagaaga > 2:152446/1‑141 (MQ=255) tgtattAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCa < 2:240436/141‑1 (MQ=255) gtattAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCAt < 2:49297/141‑1 (MQ=255) gTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTactact < 1:267967/141‑1 (MQ=255) tATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTgg < 2:88399/141‑1 (MQ=255) aTTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTggg > 1:625548/1‑141 (MQ=255) aTTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTggg > 2:658742/1‑141 (MQ=255) tttAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGa < 1:292382/141‑1 (MQ=255) tttAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGa < 1:547651/141‑1 (MQ=255) tttAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGa < 1:480816/141‑1 (MQ=255) tttAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGa > 1:547408/1‑141 (MQ=255) attAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTATACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTAAAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGa < 2:232950/140‑1 (MQ=255) ttAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGAt < 2:267552/141‑1 (MQ=255) aaGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGACAACTAAAGTCATTACTACTTGGATaaa > 2:65586/1‑141 (MQ=255) aaGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATaaa > 1:233636/1‑141 (MQ=255) gCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAAtt > 1:528428/1‑141 (MQ=255) gCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAAtt > 2:334802/1‑141 (MQ=255) gCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAAtt > 2:227488/1‑141 (MQ=255) aGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATAATTATTGTTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGa < 1:566290/141‑1 (MQ=255) gTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGaa > 2:547392/1‑141 (MQ=255) aTCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGc < 1:54094/141‑1 (MQ=255) aTCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGc > 1:576786/1‑141 (MQ=255) aTCGCGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGc > 2:190279/1‑141 (MQ=255) tCGTGCATCACAACAATTGTTGTATCCTTTATGTATAAAAGAGAAATTTTGATCAATTTAAATGTACAACTCTTTAGCATCTAATTTTTATTATTTAGATGAAGAAGACGAAACTCACAACTACTGGGTAGAATTGATGCa > 2:654298/1‑141 (MQ=255) tGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTCGCTGAATAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAAt < 1:336292/141‑1 (MQ=255) tGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAAt < 1:49018/141‑1 (MQ=255) tGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAAt < 2:250334/141‑1 (MQ=255) tGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAAt < 1:70204/141‑1 (MQ=255) gCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAAtt < 2:145240/141‑1 (MQ=255) acaacaATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTaa > 1:486594/1‑141 (MQ=255) aacaaTTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAg < 2:462457/141‑1 (MQ=255) aacaaTTGTTGTACCCTATAAATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAg < 2:631379/141‑1 (MQ=255) aacaaTTGTTGTAACAAAAAAATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATATACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAg < 2:631378/141‑1 (MQ=255) tgtACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTg < 1:245985/141‑1 (MQ=255) aCCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCTATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGAc < 1:301183/141‑1 (MQ=255) aCCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCTATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGAc < 1:655493/141‑1 (MQ=255) cttttttatataaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATg > 1:393618/12‑141 (MQ=255) tttATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATgc > 1:69848/1‑141 (MQ=255) atataAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGcc < 1:337243/141‑1 (MQ=255) tataAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCt < 2:47441/141‑1 (MQ=255) tataAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCt > 1:285238/1‑141 (MQ=255) tataAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCt < 2:47471/141‑1 (MQ=255) tataAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCt > 2:573355/1‑141 (MQ=255) taAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTg < 1:384322/141‑1 (MQ=255) taAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTAAACTGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTg > 1:18676/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTgg > 2:354939/1‑141 (MQ=255) aaaaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTggg > 1:697963/1‑141 (MQ=255) aaaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTgaagaa < 2:333632/70‑1 (MQ=255) aaaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTgaagaa > 1:333632/1‑70 (MQ=255) aaaaGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGt > 2:302766/1‑141 (MQ=255) aatggAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGTaa < 2:86526/138‑1 (MQ=255) aaaTTTTTATAAATTCAAATGTAAAATGCTTGAGCATATAATTATTATTATTTAAGTAAAGAAGAAGAAAGTCATAACTACTGGGATAAACTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAAGTGTACATGCGCCTAGGGTAATTGaa < 2:385537/141‑1 (MQ=255) aTTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGGAATTGGACATGCGCCTTGGGTAATTGaaaa > 2:70561/1‑141 (MQ=255) atttttCAATTCAAATGTACAATGCTTAAGCACATAATAATTAATATTTAGGTGAAGAAGACGAACGTCATTACTACTAGGAAAAATTGAAGAAAATTTCTAAAGTGGAAATTTGACATGCGCCTTAGGTAATTGAAAATa > 2:62105/6‑141 (MQ=255) aTCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGTAATTGAAAATAGCaa < 2:672111/141‑1 (MQ=255) aTCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGTAATTGAAAATAGCaa < 2:306103/141‑1 (MQ=255) | ATTTAAAAATATTAAACAAAGTTGTACCTATGAATGACGATGAAAGTTTTAAATTAGGTATTGTATTAAGTTATTTAAAGCAGTATCGTGCATCACAACAATTGTTGTACCCTTTATATAAAAAAGGGAAATTTTTATCAATTCAAATGTACAATGCTTTAGCATATAATTATTATTATTTAGGTGAAGAAGACGAAAGTCATTACTACTGGGATAAATTGAAGCAAATTTCTAAAGTGGAAATTGGACATGCGCCTTGGGTAATTGAAAATAGCAA > CP000730/846248‑846524 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |