Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	1339251	1339335	85	2 [1]	[1] 3	USA300HOU_1241/USA300HOU_1242	hypothetical protein/hypothetical protein

AAGGTAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAATTATTCTTTCATTTTAACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAATT  >  CP000730/1339290‑1339476                                               |                                                                                                                                             aaGGTAAAGGTCAAAAGACCTTTAACACATAAAAAAGGAATGTGGTATTTATGACAAGAGAAAAAAAAAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAaaataaa                                                <  2:58201/141‑1 (MQ=255)                                               aTTTATGACTAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAATTATTCTTTCATTTTAACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAAtt  >  1:76484/1‑141 (MQ=255)                                               aTTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAATTATTCTTTCATTTTAACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAAtt  >  2:79959/1‑141 (MQ=255)                                               |                                                                                                                                             AAGGTAAAGGGCAAAAGACCTTTACCACATTAAATAGGGAGGTGGTATTTATGACAAGAGAATTAAGGAAAAAATTAACTCTCTATCTTAACATTGCAACTTTAATATTATTTATTATTAATTTAACTAGAAAAAAATAAATTATTCTTTCATTTTAACAAAAATTATGAACCAGTTTAAAGAAATT  >  CP000730/1339290‑1339476

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑