Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	CP000730	1454332	1454447	116	3 [1]	[1] 3	arlS	sensor histidine kinase

TTTCAATTATTTTTTGCTTATTTTTTAACCTTGTCTTAACTTTAATTTTCTTATTCTTCACATCATATTTGATTGCATTATCAATAAAGATTAAAAATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATG  >  CP000730/1454411‑1454588                                      |                                                                                                                                             tttCAATTATTTTTTGCTTATTTTTTAACCTTGTCTTAACTTTAATTTTCTTATTCTTCACATCATATTTGATTGCATTATCAATAAAGATTAAAAATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGAtttt                                       >  2:56834/1‑141 (MQ=255)                                      aaCTTTAATTTTCTTATTCTTCACATCATATTTGATTGCATTATCAATAAAGATTAAAAATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATg  <  2:13548/141‑1 (MQ=255)                                      aaCTTTAATATTCTAATTCATAAGATTATATTTGATTGCATTATCAATAAAGATTAAAAATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATg  <  2:47347/141‑1 (MQ=255)                                      |                                                                                                                                             TTTCAATTATTTTTTGCTTATTTTTTAACCTTGTCTTAACTTTAATTTTCTTATTCTTCACATCATATTTGATTGCATTATCAATAAAGATTAAAAATAATTGTTCGAATTGATGAGGTTTCATTTTAATTTCTAGATTTTTAGATGTCAGATCCGTATCAAATTGATAATCAGGATG  >  CP000730/1454411‑1454588

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑