| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | CP000730 | 849,783 | (A)6→7 | coding (909/912 nt) coding (1/996 nt) |
yvcJ → yvcK → |
ATP‑binding protein hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | CP000730 | 849,777 | 1 | . | A | 92.0% | 245.2 / 14.5 | 76 | coding (903/912 nt) | yvcJ | ATP‑binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/4); new base A (28/41); total (31/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGTTGTACTTATCGGTGGTGGCACTGGCTTATCAGTTATGGCTAGGGGATTAAGAGAATTCCCAATTGATATTACGGCGATTGTAACAGTTGCTGATAATGGTGGGAGTACAGGGA > CP000730/849637‑849912 | cAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑ga‑g < 2:51999/141‑1 (MQ=255)cAATTAGTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACACACATATTGAAAGTGG‑C‑ga‑g > 2:508575/1‑141 (MQ=255) tactAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCTATCTGCAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATTATGTTTATATGCCACATACGGGCGCACATTTTTAAAGTTG‑C‑GA‑G‑aaaa > 1:47865/4‑141 (MQ=255) gTAATTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑a > 1:556299/1‑141 (MQ=255) aaTTGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑aat > 1:274538/1‑139 (MQ=255) ttGCCATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑G‑aaaa‑a‑aatga > 2:646314/1‑137 (MQ=255) ccATCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAGCGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGAc > 2:605596/1‑141 (MQ=255) aTCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACaa < 2:150603/141‑1 (MQ=255) tCGGTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAGATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACaaa < 2:313153/141‑1 (MQ=255) ggTTGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATa < 1:645546/141‑1 (MQ=255) ttGTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATaaa > 1:688360/1‑141 (MQ=255) gTACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAg > 2:781662/1‑141 (MQ=255) gTACGGGAGGAAAAAATAGATGTGTAGAATTAGCAGAATGAGTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAAAAAAA‑AA‑A‑AAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAg < 2:394466/141‑1 (MQ=255) tACGGGTGGACAACATCGATCTGTAGCATTAGCAGAACGACTAGGTAATTATCTAAATGAAGTATTTGAATATAATGTTTATGTGCATCATAGGGACGCACATATTGAAAGTGG‑C‑GA‑GAAAAA‑A‑ATGAGACAAATAAAAGt > 1:368088/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |