| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | CP000730 | 2319448 = | 129 (1.180) | intergenic (+2101/+15) | rhbC/asp23 | possible Iuc family aerobactin synthesis protein/alkaline shock protein 23 | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
CCTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACAAAAAACAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCTT > CP000730/2317324‑2317604 | ccTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACaaaaaa < 1:1197418/141‑1 (MQ=255) cTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACAAAAAAc < 1:1383673/141‑1 (MQ=255) cTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACAAAAAAc > 1:390462/1‑141 (MQ=255) cTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACAAAAAAc > 1:1296343/1‑141 (MQ=255) 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1:1077292/141‑1 (MQ=33) aaaaaCAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCgg > 2:870754/1‑141 (MQ=33) aaaCAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTc < 2:1280953/141‑1 (MQ=32) aaCAGGCTGGGACATAAATCCCAAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCt < 2:393622/141‑1 (MQ=17) aCAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCtt > 2:634947/1‑141 (MQ=32) | CCTTTGTATCGAGAAAATAATTAAGGTTATAGAATTTTATTAATCGTGAGCTCAAGGATTACATTAACTTATTAAATACAATCTATACAAATGAGAGAATAATACATTTTCCATATTCAAATTATTAAAAATCACAAAAAACAGGCTGGGACATAAATCCCTAAAAAAACAGCAGTAAGATAATTTTC‑AATTAGAAAATATCTTACTGCTGTTCTCTATTTATACAATACTTCGTATTGAATGGCTTCGCTTTCCTAGGGTGCCGTCTCAGCCTCGGTCTT > CP000730/2317324‑2317604 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |