| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,664,005 | G→A | P134L (CCT→CTT) | pbp3 ← | penicillin‑binding protein 3 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,664,005 | 0 | G | A | 90.2% | 197.0 / 11.5 | 83 | P134L (CCT→CTT) | pbp3 | penicillin‑binding protein 3 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (5/3); new base A (36/38); total (42/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.12e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.27e-01 | |||||||||||
TAAATCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAATA > CP000730/1663869‑1664142 | tAAATCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATg > 2:152075/1‑141 (MQ=255) aaaTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGc < 1:577429/141‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGc < 1:991209/141‑1 (MQ=255) aaaTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTACGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGGTCTTGTTTAATACTTCCATATGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATga > 1:332518/1‑140 (MQ=255) aaTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCa > 2:889087/1‑141 (MQ=255) aaTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCa < 1:365882/141‑1 (MQ=255) aTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCaa < 1:701325/141‑1 (MQ=255) aTCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCaa < 1:701314/141‑1 (MQ=255) agaagaCAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGTTGCAACTGAAt > 1:482134/1‑141 (MQ=255) agaagaCAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAAt > 2:113128/1‑141 (MQ=255) agaagaCAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAAt > 2:159512/1‑141 (MQ=255) aagaCAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATcc < 2:950153/141‑1 (MQ=255) agaCAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCa < 2:296450/141‑1 (MQ=255) tCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAAtct > 2:365610/1‑141 (MQ=255) tCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAAtctttc > 1:13006/1‑141 (MQ=255) tAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGAGCTTGTTTAAGACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAAtctttctt < 1:854710/141‑1 (MQ=255) gATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGt < 1:778558/141‑1 (MQ=255) ttttCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTc < 1:598802/141‑1 (MQ=255) ttttCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTc > 2:975738/1‑141 (MQ=255) ttCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTg < 2:151257/141‑1 (MQ=255) ttCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTGTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTg > 2:969098/1‑141 (MQ=255) ccGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTa < 1:247749/141‑1 (MQ=255) cGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCAGGTTCTGTaa < 1:891711/141‑1 (MQ=255) cGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCtt > 2:710440/1‑141 (MQ=255) cGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCtt > 2:76347/1‑141 (MQ=255) cGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCtt < 2:705863/141‑1 (MQ=255) cGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCATTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCtt > 2:540811/1‑141 (MQ=255) gATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTa > 1:294354/1‑141 (MQ=255) tAACAGTTGTTTATCAGATTGAGCTTGGTTAATATGTCCATCTTCTAACATAGCTTTTCCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCGTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGt > 2:857613/1‑141 (MQ=255) aGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATcc < 2:787939/141‑1 (MQ=255) tgttTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATc > 1:902546/1‑141 (MQ=255) tATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATGTTCTTAGTATCCATCTTGa < 2:3330/141‑1 (MQ=255) aTCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGAt < 1:970563/141‑1 (MQ=255) aTCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGAt > 1:873874/1‑141 (MQ=255) tCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGAtt < 2:902546/141‑1 (MQ=255) ttGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCtt < 1:162012/141‑1 (MQ=255) ttGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCtt < 1:162026/141‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTg < 1:331054/141‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTg < 1:364193/141‑1 (MQ=255) gATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTg > 1:73149/1‑141 (MQ=255) gATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTg < 1:363863/141‑1 (MQ=255) aTCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGa < 1:181570/141‑1 (MQ=255) aTCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGa > 1:174552/1‑141 (MQ=255) tCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCATCTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTGCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGAt > 1:707945/1‑141 (MQ=255) tGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAAc < 1:636830/141‑1 (MQ=255) tGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAAc > 1:948607/1‑141 (MQ=255) tttAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACtt > 1:848621/1‑141 (MQ=255) tAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACtttt > 1:1000946/1‑141 (MQ=255) aaTACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTTCTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACttttt > 2:870932/1‑140 (MQ=255) aaTACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTc < 2:909701/141‑1 (MQ=255) aTACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCa > 2:127185/1‑141 (MQ=255) aagagtggatGCTAACATAGCTTGTTCGTTTGTCATCATTGCTTTTGGTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAACTCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCCTGGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCGGc < 2:974297/132‑1 (MQ=255) aCTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGc < 1:20966/141‑1 (MQ=255) tCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTg < 1:434131/88‑1 (MQ=255) tCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTg > 2:434131/1‑88 (MQ=255) tGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCaa > 2:273383/1‑141 (MQ=255) gCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAAc > 1:724465/1‑141 (MQ=255) cTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACa > 1:452658/1‑141 (MQ=255) cTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACa > 2:584543/1‑141 (MQ=255) aGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGa > 1:691060/1‑141 (MQ=255) gCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGc > 1:244713/1‑122 (MQ=255) gCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGc < 2:244713/122‑1 (MQ=255) ttGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATtg < 1:365610/141‑1 (MQ=255) tgtgCTTTTGTCAGCGTTGCTTTTGCTTTTTCAGGAGGCAGCTGAATCCAGGAATCCTATTTTTCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATtgt < 1:854393/141‑1 (MQ=255) tGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATtgt < 2:834944/141‑1 (MQ=255) gTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATtgtg < 2:409605/141‑1 (MQ=255) ttCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTgtgt > 2:497401/1‑141 (MQ=255) ttttGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGtgttgt < 1:375672/141‑1 (MQ=255) ttttGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGtgttgt > 2:867613/1‑141 (MQ=255) tGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGtttt > 1:248849/1‑141 (MQ=255) gTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGttttt < 2:822180/141‑1 (MQ=255) tcatcaTTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTc > 2:182830/1‑141 (MQ=255) tcatTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGAc < 2:948607/141‑1 (MQ=255) tcatTGCTTTTGCTTTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGAc < 2:294354/141‑1 (MQ=255) ttgcttttgcttTTTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGAcccc < 1:510387/141‑1 (MQ=255) tttgcttttTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGta > 2:918100/1‑141 (MQ=255) ttgcttttTTAATATGCAACTTAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGTTTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGtat > 2:511287/1‑141 (MQ=255) tgcttttTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTa < 2:932655/52‑1 (MQ=255) tgcttttTTAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTa > 1:932655/1‑52 (MQ=255) tttAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAAt > 2:961362/1‑141 (MQ=255) tttAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAAt > 1:28248/1‑141 (MQ=255) tttAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAAt > 2:167527/1‑141 (MQ=255) ttAAGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAATa < 2:161348/141‑1 (MQ=255) | TAAATCTTTAGAAGACAATTCATCTAATTGTGATTTTCCGATTTTCGATAACAGTTGTTTATCATATTGATCTTGTTTAATACTTCCATCTGCTAACATAGCTTGTTCTTTTGTCATCATTGCTTTTGCTTTTTTAGGATGCAACTGAATCCAGAAATCTTTCTTATCACGTTCTGTAATTTTCTTAGTATCCATCTTGATTAGCTTTGATAACTTTTCAGCCGTATCCAACATTTCCGATTGTGTTGTTTTTCGACCCCTAGTATATGTAATA > CP000730/1663869‑1664142 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |