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1:819309/1‑137 (MQ=17) gATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑A‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctt < 2:578689/141‑6 (MQ=11) atatGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑A‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaaaaagctta > 2:120466/1‑135 (MQ=11) tatGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAAtt < 1:892083/141‑1 (MQ=255) aTTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACaaa > 1:101587/1‑141 (MQ=40) tGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATg > 1:440845/1‑141 (MQ=40) tCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑A‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTg > 1:62098/1‑102 (MQ=255) tCTGAAATATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGt < 2:556521/141‑1 (MQ=40) cTGAAATATTAAG‑A‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTa < 2:758004/141‑1 (MQ=255) aaaTATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACAt < 1:56346/141‑1 (MQ=40) aaTATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATc < 1:844064/141‑1 (MQ=40) aaG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGCTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 1:652324/1‑141 (MQ=255) | ATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAG‑G‑GAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAA > CP000730/76182‑76460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |