| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 830841 = | 91 (1.030) | 4 (0.050) | 4/234 | NT | 5.0% | intergenic (+10/‑404) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA |
| ? | CP000730 | 830871 = | 68 (0.850) | intergenic (+40/‑374) | raiA/secA1 | possible ribosome‑associated inhibitor protein Y/Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase subunit SecA | |||||
ATTATTAACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAGTGCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/830989‑830841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTAT > CP000730/830871‑831009 ATTATTAACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACA > 1:1000775/1‑141 TTATTAACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAA < 1:44660/141‑1 TATTAACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCTACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAG < 1:579594/141‑1 AACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAGTGCT > 2:913849/1‑141 CTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAGTGCTTT > 2:722100/1‑141 CTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACATGTGCAAAAACACAAGTGCTTT > 1:17562/1‑141 TAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGTTTTTGCACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGAC < 1:942240/141‑1 TTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGTTTGTGCACAAGTGCTTTTTTATTCTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAA < 1:950009/141‑1 TTGTGCAAAAACACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAA > 2:680015/1‑141 TGTGCAAAAACACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAAT > 2:492373/1‑141 ttttttattttTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTC > 2:722026/12‑141 CACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAG < 2:1022790/141‑1 CACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAG < 1:200755/141‑1 CACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAG > 2:725838/1‑141 CACAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAG < 1:1004034/141‑1 CAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAATCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTC < 1:392638/141‑1 CAAGTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTC < 2:300412/141‑1 ttttttTTTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCT > 2:517554/7‑141 GTGCTTTTTTATACTCCAAAAGCAGATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGAGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTAGGTCAGTCTAT < 2:53718/141‑1 TTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTAT > 2:672854/1‑141 TTTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTAT > 1:584824/1‑141 ATTATTAACTTAACATTCAAATATATACATCCATTAACATTAGCATAGTCACTATGTTTCATTCAACAAATTACATTATCGAACTATGAAATAGTCATAATTTGCTTTTGGAGTATAAAAAAGCACTTGTGCAAAAACACAAGTGCTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP000730/830989‑830841‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cacaagtgctttTTTATACTCCAAAAGCAAATTATGACTATTTCATAGTTCGATAATGTAATTTGTTGAATGAAACATAGTGACTATGCTAATGTTAATGGATGTATATATTTGAATGTTAAGTTAATAATAGTATGTCAGTCTATTGTAT > CP000730/830871‑831009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |