New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | 1575673 = | 81 (0.910) | 7 (0.080) | 5/248 | NT | 8.2% | coding (1844/6201 nt) | hlgB | possible bacteriophage tail protein |
? | CP000730 | 1575710 = | 78 (0.920) | coding (1807/6201 nt) | hlgB | possible bacteriophage tail protein |
CACCAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCT > CP000730/1575533‑1575813 | cACCAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGAtt > 2:74158/1‑141 (MQ=255) cACCAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGAtt < 2:42762/141‑1 (MQ=255) acaatagttggtactgaagcagcaagtggatttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatctc < 2:931579‑M1/2‑1 (MQ=255) aCCAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTc > 1:176569/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCa > 2:122915/1‑141 (MQ=255) cAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAAGGATTCaa < 1:858552/141‑1 (MQ=255) aatagttggtactgaagcagcaagtggatttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCaa > 1:924918‑M1/138‑141 (MQ=255) aatagttggtactgaagcagcaagtggatttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagagttgatgaaagataatcTCaa > 2:483365‑M1/138‑141 (MQ=255) aGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAgcg > 1:548017/1‑141 (MQ=255) tGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGcc > 2:901711/1‑141 (MQ=255) gCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCa > 2:359080/1‑141 (MQ=255) cTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCAc > 2:1051421/1‑141 (MQ=255) tAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCCACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTACGAGTGCTAATGATTCAAAAGCGCCAcc < 2:804130/141‑1 (MQ=255) cTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAAtt < 1:93986/141‑1 (MQ=255) tcTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGt < 2:915802/140‑1 (MQ=255) tGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTc > 2:309064/1‑141 (MQ=255) aagtggatttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCa > 1:1064118‑M1/117‑141 (MQ=255) aagtggatttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCa > 1:1064285‑M1/117‑141 (MQ=255) aaGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCa < 2:693701/141‑1 (MQ=255) aGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCag < 2:196604/141‑1 (MQ=255) ttttCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAACCGCCACCTAATTGTTCCCGAgc > 1:201041/1‑141 (MQ=255) tttCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAgcg < 2:176299/141‑1 (MQ=255) tttCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAgcg < 1:528572/141‑1 (MQ=255) tttCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAgcg < 1:749614/141‑1 (MQ=255) atttttagcctggattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaactccttaaagaattccaatgacgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAgcgc > 2:154874‑M1/111‑141 (MQ=255) ttttagccttgattgaagcgggaccagataaaattaatagctatagtaaatccttaaagaattccaatggcgaaagtaaaaaagcagcagatttgatgaaagataatcTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCt > 2:668891‑M1/109‑141 (MQ=255) cTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCt > 2:358425/1‑141 (MQ=255) aaCCCAACCAGGGAGATGAGCAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCttt < 1:283027/141‑1 (MQ=255) aCCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTg > 1:404600/1‑141 (MQ=255) aCCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTg > 1:1007208/1‑141 (MQ=255) aCCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTCGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTg > 1:573213/1‑141 (MQ=255) ccAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTgag > 1:236015/1‑141 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1:931579/1‑141 (MQ=255) gggAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCt > 2:889942/1‑141 (MQ=255) tgtgTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTtcatc < 2:343433/141‑1 (MQ=255) gtAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCaaa > 2:198012/1‑141 (MQ=255) aaaTCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATc > 2:1046165/1‑141 (MQ=255) cAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCtt < 1:707412/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt > 1:738669/1‑141 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt < 2:614774/141‑1 (MQ=255) aaCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCttt < 1:105198/141‑1 (MQ=255) aCTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCtttt > 1:987324/1‑141 (MQ=255) tttGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCACATCTGCTGCTTTTTTACtt < 1:87324/141‑1 (MQ=255) gTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCg < 1:864663/141‑1 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1:219023/1‑141 (MQ=255) aTCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAAt < 1:846766/141‑1 (MQ=255) tttACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAAtttt < 2:280854/141‑1 (MQ=255) aCCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATc < 1:475650/141‑1 (MQ=255) ccGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCt > 1:568887/1‑141 (MQ=255) ttCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTcc < 2:735591/141‑1 (MQ=255) tCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTccc > 2:319286/1‑141 (MQ=255) tCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTccc > 2:319166/1‑141 (MQ=255) gATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGc < 1:148084/141‑1 (MQ=255) ttGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTAGCTTTCATCAAATCTGCTGCGTTTGAACTGGCGCCAGTGGAATTCGTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATTTGGTCCCGCtt > 1:648305/1‑141 (MQ=255) tGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTtc < 1:787743/141‑1 (MQ=255) cTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTtcaa < 2:807360/141‑1 (MQ=255) aaTGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTtcaatc < 1:442138/141‑1 (MQ=255) TCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGAGTTACTATAGCTATTTATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCt < 2:590845‑M1/141‑1 (MQ=255) | CACCAAAAAGTGCTAATCCTACTGAAGCTTTTCTAACCCAACCAGGGAGATGTGTAAATCCATCAACTAATTTTGTTAAACCTTCCGCTCCTGCTCTAATCATAGGCGTTAAATCTTTACCGACTTCGATTGCTAATGATTCAAAAGCGCCACCTAATTGTTCCAGAGCGCCTTTGAGATTATCTTTCATCAAATCTGCTGCTTTTTTACTTTCGCCATTGGAATTCTTTAAGGATTTACTATAGCTATTAATTTTATCTGGTCCCGCTTCAATCAAGGCT > CP000730/1575533‑1575813 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |