| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | 2361955 = | 103 (1.160) | 6 (0.070) | 6/240 | NT | 6.1% | coding (351/1293 nt) | secY1 | Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase SecY |
| ? | CP000730 | 2361978 = | 90 (1.090) | coding (328/1293 nt) | secY1 | Sec family Type I general secretory pathway preprotein translocase SecY | |||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
AAGAAAGCAGTTCCTGCTGTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACAATACCCATTGCAAA > CP000730/2361815‑2362095 | aaGAAAGCAGTTCCTGCTGTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCt < 2:577241/141‑1 (MQ=255) tgaaacgattttctatttttgcaatgggtattgtaccctacatcactgcatcaatcgtaatgcaattattacaaatggatattgtccctaaattctcagaatgggcaaaacaaggtgaagtaggtagaagaaagtTAAATa < 1:1034111‑M1/6‑1 (MQ=255) gCAGTTCCTGCTGTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATaa > 2:891303/1‑141 (MQ=255) aaacgattttctatttttgcaatgggtattgtaccctacatcactgcatcaatcgtaatgcaattattacaaatggatattgtccctaaattctcagaatgggcaaaacaaggtgaagtaggtagaagaaagtTAAATAAc < 2:625767‑M1/8‑1 (MQ=255) aGTTCCTGCTGTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTTAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACg < 2:683882/141‑1 (MQ=255) ggaactgctgTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACGTTTGAGATAAATATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAAGTGCTAAATAACGa > 2:1002693/5‑141 (MQ=255) aactgctgTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGt > 1:133699/3‑141 (MQ=255) aactgctgTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGt > 2:893769/3‑141 (MQ=255) tttctatttttgcaatgggtattgtaccctacatcactgcatcaatcgtaatgcaattattacaaatggatattgtccctaaattctcagaatgggcaaaacaaggtgaagtaggtagaagaaagtTAAATAACGAGTAAc > 2:6144‑M1/127‑141 (MQ=255) gctgTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACg < 2:965245/141‑1 (MQ=255) tCAAAACTAGGGCTATTAATAAATAACTCATAAGTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTNACGatat > 2:812853/1‑141 (MQ=255) cAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTAtt < 1:115781/141‑1 (MQ=255) aaaaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTAttt < 2:34629/141‑1 (MQ=255) aaaaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTAttt < 1:631966/141‑1 (MQ=255) aaaaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTAttt < 2:3221/141‑1 (MQ=255) aaaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTa > 2:245055/1‑141 (MQ=255) aaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTaa > 1:1013481/1‑141 (MQ=255) aaCTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTaa > 1:326806/1‑141 (MQ=255) cTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACt < 1:601920/141‑1 (MQ=255) cTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACt < 1:465397/141‑1 (MQ=255) aGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACttt > 2:516703/1‑141 (MQ=255) atgggtattgtaccctacatcactgcatcaatcgtaatgcaattattacaaatggatattgtccctaaattctcagaatgggcaaaacaaggtgaagtaggtagaagaaagtTAAATAACGAGTAACGTTa > 2:239918‑M1/113‑131 (MQ=255) gCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTttctt > 2:960177/1‑141 (MQ=255) gCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTttctt > 2:111117/1‑141 (MQ=255) taaCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCa < 1:210171/141‑1 (MQ=255) taaCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCa < 2:406185/141‑1 (MQ=255) taaCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCa < 2:406181/141‑1 (MQ=255) aaCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCAc > 1:827605/1‑141 (MQ=255) aCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCAcc > 1:674156/1‑141 (MQ=255) aCTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCAcc < 1:259000/141‑1 (MQ=255) cTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCt > 1:122403/1‑141 (MQ=255) cTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCt > 2:745785/1‑141 (MQ=255) tCATGATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGGGATAATTATTAAATTGGAATGCCATTCCTATGGATTGGTTAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATCACGAGTGACGTTAGCTAACTTTCTTCTTCCTACTTCACCtg < 2:971375/141‑2 (MQ=255) cATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTg > 1:625767/1‑141 (MQ=255) aTAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGt > 2:105176/1‑141 (MQ=255) aaTTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGttt > 2:607013/1‑141 (MQ=255) aCTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGccc > 2:303145/1‑141 (MQ=255) aCTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGccc > 1:794995/1‑141 (MQ=255) atgattgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCGTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCa < 2:528677/140‑1 (MQ=255) attgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGACATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCAACTTGTTTTGCCTATTc > 2:170616/1‑141 (MQ=255) ttgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCt > 1:22721/1‑141 (MQ=255) tgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATATCGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTCCCCCTTGTTTTGCCCATTCTg < 2:646667/141‑1 (MQ=255) tgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTg < 1:692171/141‑1 (MQ=255) tgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTg < 1:781715/141‑1 (MQ=255) tgatAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTg < 1:781712/141‑1 (MQ=255) atAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTgag > 1:689911/1‑141 (MQ=255) atAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTgag > 1:304632/1‑141 (MQ=255) atAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTgag > 1:245888/1‑141 (MQ=255) tAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTgaga < 1:306658/141‑1 (MQ=255) tAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTgaga > 1:798775/1‑141 (MQ=255) aaTCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGaa < 1:67097/141‑1 (MQ=255) aTCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAAt < 2:119398/141‑1 (MQ=255) aTCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAAt > 1:692270/1‑141 (MQ=255) cAGGGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCGATACCTATAGAGTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTGTGTAACTTTTTTCTACGTACTTTTCCTTGTTTGGCTTATTCTGAGAAttt > 2:591360/1‑141 (MQ=255) aGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTa > 1:73813/1‑141 (MQ=255) gcACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAACTGCTAAAGCAATTGCTAACTAACGACTACCGTTACTCAAATTTCTTCTAACTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGCATTTAggg > 1:267533/1‑141 (MQ=255) gcACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAggg < 2:1060738/141‑1 (MQ=255) aCCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGAc > 1:202752/1‑141 (MQ=255) ccTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACa > 1:620306/1‑141 (MQ=255) cTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACaa < 2:307496/141‑1 (MQ=255) cTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACaa > 2:514897/1‑141 (MQ=255) gaTAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCa < 1:515454/141‑1 (MQ=255) aTAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCAt > 2:872776/1‑141 (MQ=255) gagtaAAGTGGAAAGGCAAACATATAGAATGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAACAACGAGGAACGTTATTTAACTTTCTTCTCCCTACTTCACCTTGTTATGCCCATTCTGAGAATTTCGGGACAATATCCATTTGta < 2:175930/138‑1 (MQ=255) ttaAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATCCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGtaat > 2:958696/1‑141 (MQ=255) taAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGtaata < 1:465941/141‑1 (MQ=255) gAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCAt > 1:359922/1‑141 (MQ=255) gAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCAt < 2:143168/141‑1 (MQ=255) aaTGCCACACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCAtt > 1:859063/1‑141 (MQ=255) tGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTAc < 1:62872/141‑1 (MQ=255) gCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACg < 2:46200/141‑1 (MQ=255) gCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACg > 2:917825/1‑141 (MQ=255) gCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACg < 2:711616/141‑1 (MQ=255) gCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACg > 2:479364/1‑141 (MQ=255) ccATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGa > 1:744965/1‑141 (MQ=255) cATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGAt < 2:940115/141‑1 (MQ=255) ccTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGAt > 1:424553/1‑141 (MQ=255) ccTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGAt > 1:263176/1‑141 (MQ=255) tataGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGc < 2:912735/141‑1 (MQ=255) tataGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGc < 2:912625/141‑1 (MQ=255) aTTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGa < 1:903801/141‑1 (MQ=255) aTTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGa < 1:738291/141‑1 (MQ=255) ttGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGAt < 1:156845/141‑1 (MQ=255) ggtgaagtaggtagaagaaagtTAAATAACGTTACTCGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTTCATTACGATTGATGCAGTGATGt < 2:303399‑M1/119‑1 (MQ=255) tgaagtaggtagaagaaagtTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCa > 1:8130‑M1/21‑63 (MQ=255) tgaagtaggtagaagaaagtTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCa < 2:8130‑M1/43‑1 (MQ=255) tAAATGCTAAATAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAgg < 2:620757/141‑1 (MQ=255) tAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAgg < 2:488665/141‑1 (MQ=255) aaTGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGt < 2:794995/141‑1 (MQ=255) aTGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTa > 1:310386/1‑141 (MQ=255) tGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTAc < 1:516703/141‑1 (MQ=255) gCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACa < 1:245055/141‑1 (MQ=255) gCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACa < 2:1066725/141‑1 (MQ=255) aaaTTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACAATACCCa < 1:206599/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCTATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACAATACCCAt < 1:862589/141‑1 (MQ=255) aTTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACACTACCCAtt > 2:753045/1‑141 (MQ=255) tGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGGGAATTTAGGGATAATATCCATTTGTAATAAATGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGTGTACAATACCCATTGc < 2:749813/141‑1 (MQ=255) tGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTCCAATACCCATTGc > 1:921203/1‑141 (MQ=255) tGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGAGTGATGCAGTGATGTAGGGCAAAATACCCAttcc > 2:1024671/1‑139 (MQ=255) cTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACAATACCCATTGCaa > 2:879228/1‑141 (MQ=255) | AAGAAAGCAGTTCCTGCTGTCAAAACTAGTGCTATTAATAAATAACTCATAATTGACTGATTGATAATCAGCGCACCTTTGAGATAATTATTAAATTGGAATGCCATACCTATAGATTGGATAAATGCTAAAGAAATTGCTAAATAACGAGTAACGTTATTTAACTTTCTTCTACCTACTTCACCTTGTTTTGCCCATTCTGAGAATTTAGGGACAATATCCATTTGTAATAATTGCATTACGATTGATGCAGTGATGTAGGGTACAATACCCATTGCAAA > CP000730/2361815‑2362095 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |