New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP000730 | = 1920358 | 81 (0.910) | 5 (0.060) | 4/250 | NT | 6.2% | coding (968/1002 nt) | menC | possible o‑succinylbenzoic acid (OSB) synthetase |
? | CP000730 | = 1920382 | 73 (0.850) | coding (944/1002 nt) | menC | possible o‑succinylbenzoic acid (OSB) synthetase |
CGCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATA > CP000730/1920245‑1920522 | cGCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAACAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTctt > 1:800083‑M2/1‑138 (MQ=255) cGCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTctt > 1:633194‑M2/1‑138 (MQ=255) cGCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGATAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTctt > 2:515334‑M2/1‑138 (MQ=255) gCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTcttt > 1:161360‑M2/1‑137 (MQ=255) cTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCtttt < 2:654923/141‑1 (MQ=255) aTAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAata < 1:247091/141‑1 (MQ=255) aTAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GG‑‑CGCCCCTCTTTTAata > 1:336605/1‑141 (MQ=255) tAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAatat > 1:629477/1‑141 (MQ=255) aaaGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATg < 1:91214/141‑1 (MQ=255) aGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGcc > 1:979643/1‑141 (MQ=255) aGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGcc > 1:979922/1‑141 (MQ=255) ggcTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGaa > 1:174918/1‑141 (MQ=255) cTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCTTGAATg > 2:741915/1‑141 (MQ=255) cTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATg > 2:64048/1‑141 (MQ=255) ttGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATgcg > 1:82437/1‑141 (MQ=255) ttGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATgcg < 1:943926/141‑1 (MQ=255) aCCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGTCCCCCTTTTAATATGCCTGAAGGCGcca > 2:102294/1‑141 (MQ=255) aCCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGcca < 2:552736/141‑1 (MQ=255) ccTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGccacc > 2:857269/1‑141 (MQ=255) cTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGccacca < 1:98308/141‑1 (MQ=255) ttCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACAt < 2:965569/141‑1 (MQ=255) ccGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCt < 1:832333/141‑1 (MQ=255) gTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTg < 2:968499/141‑1 (MQ=255) gTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTg < 1:200963/141‑1 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCAGCACATCTTga > 1:427999/1‑140 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGt < 2:309116/141‑1 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGt < 1:275995/141‑1 (MQ=255) ttAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGt > 1:423216/1‑141 (MQ=255) tcaaaaaaaGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGCGTGATATCCACTAAAGGGGGGCGAACTTCGA‑‑GG‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATCGGCCACCACATCTCGt > 2:873312/3‑141 (MQ=255) aaaaaaGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCa > 2:893191/1‑141 (MQ=255) aaaaaaGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGAGGGGCGAC‑‑TCGAATTT‑‑CGCCCCCctttagtggatataactcaattacaaccatattaatgg < 1:899112‑M2/141‑39 (MQ=255) gACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAaataa > 1:693390/1‑141 (MQ=255) aGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAAc > 1:407211/1‑141 (MQ=255) gTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAACATAATAAcc > 1:619489/1‑141 (MQ=255) aagcaagcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTgg < 1:711087/141‑1 (MQ=255) gcaTTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAAc > 2:667739/1‑141 (MQ=255) cacaTAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACAtctc > 2:617279/1‑141 (MQ=255) cacaTAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACAtctc < 2:716598/141‑1 (MQ=255) cacaTAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACAtctc < 2:252408/141‑1 (MQ=255) cacaTAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACAtctc > 1:346830/1‑141 (MQ=255) acataaacataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTcc < 2:12217/141‑1 (MQ=255) acataaacataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTcc < 2:33947/141‑1 (MQ=255) cataaacataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGAGGGGCGAC‑‑TCGA‑‑ATTTCGCCCCCctttagtggatataactcaattacaaccatattaatggttatgtttatgtgaatgcttgcttgctgac > 2:899112‑M2/1‑73 (MQ=255) ataaacataaCCGTTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGT‑ACATCTCCTgg < 2:792178/141‑1 (MQ=255) ataaacataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTg < 2:281331/141‑1 (MQ=255) acataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATa < 1:185431/141‑1 (MQ=255) cataaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATaa < 1:495572/141‑1 (MQ=255) aaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGCAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCTCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCa < 1:917907/141‑1 (MQ=255) aaCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCa < 1:203436/141‑1 (MQ=255) aCCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCAc > 2:319378/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCt > 1:718588/1‑141 (MQ=255) cATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCt < 1:609837/141‑1 (MQ=255) cATTAATATGGATGTAATTGAGTTATATCCACTAAGGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCt > 2:1006185/1‑141 (MQ=255) cttAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTCAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCtt < 1:732770/140‑1 (MQ=255) aTTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCtt < 1:208213/141‑1 (MQ=255) ttAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCttt < 2:893709/141‑1 (MQ=255) tAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTTCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTa < 2:223651/141‑1 (MQ=255) tAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTa < 2:778102/141‑1 (MQ=255) atatGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACg > 2:193680/1‑141 (MQ=255) ggTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGagca < 1:240942/141‑1 (MQ=255) gTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGCTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATATCCTGGGTAATCACCTTTACGagaaagca > 1:517692/1‑141 (MQ=255) gAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTg < 2:180406/141‑1 (MQ=255) gTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATCTGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTa > 1:294782/1‑141 (MQ=255) gTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAGCATCTCCTGGATAATCACCTTTCCGAGCAAGCACCGCTGtc > 2:124538/1‑140 (MQ=255) tataTCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTaaa < 1:923092/141‑1 (MQ=255) tatCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAAt > 2:685041/1‑141 (MQ=255) tatCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAAt > 1:328406/1‑141 (MQ=255) tatCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAAt > 2:567354/1‑141 (MQ=255) cTACAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 1:329244/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 1:880244/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 2:412605/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 2:89646/1‑141 (MQ=255) cTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGc > 1:364929/1‑141 (MQ=255) aGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTaa < 1:1038364/141‑1 (MQ=255) aGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATAAGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTaa > 1:138677/1‑141 (MQ=255) ggggggCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTctttagtggatataactcaattacaaccatattaatggttatgtttatgtgaatgcttgcttgctgacttgtctttttttaacggaacagggtcaaagccgcctttatgacgcgga < 2:641825‑M2/141‑117 (MQ=255) ggggggCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTctttagtggatataactcaattacaaccatattaatggttatgtttatgtgaatgcttgcttgctgacttgtctttttttaacggaacagggtcaaagccgcctttatgaagcgga < 1:251430‑M2/141‑117 (MQ=255) gggggCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAAc > 2:182708/1‑141 (MQ=255) gCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCata > 1:90563/1‑141 (MQ=255) gCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCata < 1:813890/141‑1 (MQ=255) gAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCATGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATAtt < 1:564364/141‑1 (MQ=255) tCGA‑‑GT‑‑CGCCCCCctttagtggatataactcaattacaaccatattaatggttatgtttatgtgaatgcttgcttgctgacttgtctttttttaacggaacagggtcaaagccgcctttatgaagcggatgacattttaaa < 1:991767‑M2/141‑129 (MQ=255) gA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACAt > 2:126460/1‑141 (MQ=255) ttt‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATg > 1:584541/3‑141 (MQ=255) gT‑‑CGCCCCTCCTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATgc < 2:196330/141‑1 (MQ=255) ccccTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATgccgcc > 2:509500/1‑141 (MQ=255) ctctTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAAt > 1:969106/1‑141 (MQ=255) tctTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATa < 2:722628/141‑1 (MQ=255) | CGCTTCATAAAGGCGGCTTTGACCCTGTTCCGTTAAAAAAAGACAAGTCAGCAAGCAAGCATTCACATAAACATAACCATTAATATGGTTGTAATTGAGTTATATCCACTAAAGGGGGGCGAAATTCGA‑‑GT‑‑CGCCCCTCTTTTAATATGCCTGAATGCGCCACCACATCTTGTTCAAAATAATAACCTGCTGGTGTAACATCTCCTGGATAATCACCTTTACGAGCAAGCATCGCTGTAAAATAGCGGCTTAAACCATATTCGTACATGCCGCCAATA > CP000730/1920245‑1920522 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |