| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP000730 | = 2419233 | 89 (1.000) | 3 (0.040) | 3/240 | NT | 3.5% | intergenic (‑71/‑177) | odh/USA300HOU_2284 | D‑octopine dehydrogenase/hypothetical membrane protein |
| ? | CP000730 | = 2419242 | 83 (1.010) | intergenic (‑80/‑168) | odh/USA300HOU_2284 | D‑octopine dehydrogenase/hypothetical membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
CCATATCTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAGTTAAAGATAAT > CP000730/2419105‑2419382 | ccATATCTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgc < 1:526771‑M2/141‑4 (MQ=255) tatCTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatc > 2:476819‑M2/1‑135 (MQ=255) tatCTACTGCGGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTAGTTACAGAGGCGGCCCTCTTGCTATCTTTGGTTCAGGGGAAGAACAGATTATACGTAAGACAAGATAAAAATGATTCG‑AATTCATTACGcatc < 1:247324/141‑1 (MQ=255) tCTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatcat > 2:144422‑M2/1‑133 (MQ=255) cTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTCCAATTGCTATTTTCATAAACCACGCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAAATAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAAAGATGCG‑AATTCATTAtccatcatt < 2:93499‑M2/141‑10 (MQ=255) cTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatcatt < 2:429850‑M2/141‑10 (MQ=255) cTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatcatt < 1:219659‑M2/141‑10 (MQ=255) cTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatcatt < 1:998272‑M2/141‑10 (MQ=255) cTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTAcgcatcatt < 1:1022183‑M2/141‑10 (MQ=255) tACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATta < 1:215499/141‑1 (MQ=255) aCTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACACCCCTCTTTCTGTTTTTGGTTAAAATTAATAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATtat > 1:487134/1‑141 (MQ=255) aCTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATtat > 1:57310/1‑141 (MQ=255) ctgctgCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCAACAACCGCGACTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATtata > 2:593882/1‑141 (MQ=255) tgctgcCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTGGTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGCGAGGCAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCAGCATTATaa < 1:792804/141‑1 (MQ=255) tgcCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATg > 1:849712/1‑141 (MQ=255) gcCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGt > 2:900853/1‑141 (MQ=255) cGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTa > 1:1058506/1‑141 (MQ=255) gTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATTATTATAAATGTTaa > 1:583395/1‑141 (MQ=255) aaCTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGt < 2:874288/141‑1 (MQ=255) aCTGCGCCATTTCCTGAACCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGta > 2:339089/1‑141 (MQ=255) gcCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGtatatat < 1:601807/141‑1 (MQ=255) ccATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCGTAATGAATTgcatcatttttatattgtcttacgtata > 1:696574‑M2/1‑113 (MQ=255) ccATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGtatatata < 2:497815/141‑1 (MQ=255) ttCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAAccg < 1:1030892/141‑2 (MQ=255) ttCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCt < 1:1085661/141‑1 (MQ=255) tCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCtt > 2:477553/1‑141 (MQ=255) tCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCtt > 1:859030/1‑141 (MQ=255) tCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCtt > 2:143637/1‑141 (MQ=255) cTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTTTCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTaa > 2:467035/1‑141 (MQ=255) tGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTaaa > 2:600943/1‑141 (MQ=255) tGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTaaa > 2:188109/1‑141 (MQ=255) gATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAAt > 2:412552/1‑141 (MQ=255) aTCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAAtt > 2:256356/1‑141 (MQ=255) cTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAAc < 1:1068001/141‑1 (MQ=255) cAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGCTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTa < 1:803540/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAt > 1:1019363/1‑141 (MQ=255) aaTTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAt < 1:398406/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAt > 2:73083/1‑141 (MQ=255) aaTTGATATTATCAAAAACAACCCTCTTTCTATCTTAGATTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑TAATGAATTcgcatcatttttatattgtcttacgtataatttgtttttaatttta > 2:602146‑M2/1‑95 (MQ=255) aatGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAtt < 1:820077/139‑1 (MQ=255) aTTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAtt > 2:440280/1‑141 (MQ=255) ttGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTAttt > 2:197062/1‑141 (MQ=255) tATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATTTAAGCGTTTATTAACCTATTTAAAc > 1:231832/1‑141 (MQ=255) tATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAAc > 1:578009/1‑141 (MQ=255) tttCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGcc < 1:796562/141‑1 (MQ=255) tttCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGcc < 1:522100/141‑1 (MQ=255) tttCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGcc < 1:815587/141‑1 (MQ=255) tttCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATAAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGcc < 1:1079003/141‑1 (MQ=255) aTAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACg < 1:981761/141‑1 (MQ=255) aaaCAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTc > 2:422230/1‑141 (MQ=255) caacCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAACAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTccac > 2:661510/1‑141 (MQ=255) aacCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTccacc > 2:832040/1‑141 (MQ=255) aacCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCAGTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTccacc < 1:317432/141‑1 (MQ=255) ccTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAat > 2:320308/1‑141 (MQ=255) ccTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAat > 1:635779/1‑141 (MQ=255) caggtcgaTCATTGGGGAAAATGACAGACAAATGATAAGTAAGACAGTACAAAAATGATGCG‑AAGTGATTACGCACCATTGTAAATGTCAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAatta > 2:281147/8‑141 (MQ=255) ctTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAattat < 2:142107/141‑1 (MQ=255) ttCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttattt < 1:26719/141‑1 (MQ=255) ttCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttattt < 2:483467/141‑1 (MQ=255) ttCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttattt > 2:809328/1‑141 (MQ=255) aTCTTTGGTTAAAATTAAAAGCAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttatttttat > 2:637057/1‑141 (MQ=255) aTCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttatttttat > 1:962748/1‑141 (MQ=255) tCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttatttttatt > 1:734029/1‑141 (MQ=255) cTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAGATAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttatttttattt > 2:1038702/1‑141 (MQ=255) cTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttgtttttagat > 2:855837/1‑138 (MQ=255) cTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATGATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAAttatttttattt > 2:1026739/1‑141 (MQ=255) tttGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATtatttttatttt < 2:236616/141‑1 (MQ=255) tGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTAtttttattttta < 1:972474/141‑1 (MQ=255) gggtaaaattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaa < 2:583817/138‑1 (MQ=255) ggTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAACATGATGAG‑AATTCGTTACGGATTATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCAACCAATTatttttattttttt > 2:593721/1‑139 (MQ=255) ggTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaa > 1:861511/1‑141 (MQ=255) ggTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaa > 1:207893/1‑141 (MQ=255) ttaaaattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaata < 1:93499/141‑1 (MQ=255) taaaattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaataa > 2:696024/1‑141 (MQ=255) taaaattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTtaataa > 2:151270/1‑141 (MQ=255) aaaattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTaataat > 2:795759/1‑141 (MQ=255) aattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTACATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTg < 1:549172/141‑1 (MQ=255) aattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAACAGCCCTTGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTg < 2:48708/141‑1 (MQ=255) aattaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTg < 2:599690/141‑1 (MQ=255) attaaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGt > 1:881272/1‑141 (MQ=255) taaaaACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGttt < 2:438124/141‑1 (MQ=255) aaaaCAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTtaa > 1:446965/1‑141 (MQ=255) aaaaCAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTtaa < 2:290665/141‑1 (MQ=255) aaTTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACa < 2:477059/141‑1 (MQ=255) aaTTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATACATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACa < 2:758736/141‑1 (MQ=255) aTTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACAt < 1:63090/141‑1 (MQ=255) aTTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACAt > 2:818255/1‑141 (MQ=255) ataCGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGtt < 1:823040/141‑1 (MQ=255) tAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTAtta < 2:526771/141‑2 (MQ=255) aGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTAttttt > 2:1004782/1‑141 (MQ=255) cAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGAt < 1:74705/141‑1 (MQ=255) cAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGAt < 2:836732/141‑1 (MQ=255) aaTATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGAtt < 2:372092/141‑1 (MQ=255) taAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTatat < 1:397609/141‑1 (MQ=255) tgCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTtata > 2:54139/1‑141 (MQ=255) gCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAg < 1:412552/141‑1 (MQ=255) g‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAGtt > 1:593097/1‑141 (MQ=255) ttCATTAcgcatcatttttatattgtcttacgtataatttgtttttaattttaaccaaagatagaaagagggttgtttatgaaaatagcaattgtaggatcaggaaatggcgcagttacggcagcagtagatatggtgagc < 1:26817‑M2/141‑135 (MQ=255) cATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAGTTAAAGa > 1:256820/1‑141 (MQ=255) aCGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAGTTAAAGataat > 2:1008080/1‑141 (MQ=255) | CCATATCTACTGCTGCCGTAACTGCGCCATTTCCTGATCCTACAATTGCTATTTTCATAAACAACCCTCTTTCTATCTTTGGTTAAAATTAAAAACAAATTATACGTAAGACAATATAAAAATGATGCG‑AATTCATTACGCATCATTATAAATGTTAAGTATATATAACCTTAAATTAACCTATTTAAACGCCGACGTCCACCAATTATTTTTATTTTTAATAATTGTTTAATAAACATGTTTATTTTTGATTATATTTTGTTATAGTTAAAGATAAT > CP000730/2419105‑2419382 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |