| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 885,761 | T→C | 5.3% | T101A (ACT→GCT) | yisU ← | LysE family L‑lysine exporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 885,761 | 0 | T | C | 5.3% | 258.0 / 5.1 | 96 | T101A (ACT→GCT) | yisU | LysE family L‑lysine exporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/40); new base C (2/3); total (53/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.57e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.90e-01 | |||||||||||
TGTAAACGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTGCAAT > CP000730/885621‑885896 | tGTAAACGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGt < 2:107937/141‑1 (MQ=255) aaaCGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTtc > 1:926820/1‑141 (MQ=255) aaaCGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTtc < 1:191819/141‑1 (MQ=255) aaCGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTtct < 1:2119/141‑1 (MQ=255) aaCGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTtct > 2:1000207/1‑141 (MQ=255) gCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCa > 2:998828/1‑141 (MQ=255) cAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCAt < 1:928122/141‑1 (MQ=255) cAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCAt < 1:624511/141‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTg > 2:945970/1‑141 (MQ=255) tttATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGt < 2:496840/141‑1 (MQ=255) aTTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGa > 1:330436/1‑141 (MQ=255) ttGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAg > 1:202685/1‑141 (MQ=255) ctgcCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGt > 2:6607/1‑141 (MQ=255) gcCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGttt > 2:680526/1‑141 (MQ=255) attatataGTGGCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGTAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTAt > 2:855150/3‑141 (MQ=255) cTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCa < 1:945970/141‑1 (MQ=255) cTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCa < 1:372450/141‑1 (MQ=255) ataAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGcc > 1:1022534/1‑141 (MQ=255) taAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCa > 2:419732/1‑141 (MQ=255) t‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAAt < 1:581442/141‑1 (MQ=255) gcagcaCTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCGAATg > 1:1016284/1‑141 (MQ=255) cagcaCTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATgg > 1:745508/1‑141 (MQ=255) gcaCTACTACCAATTACACCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGATATAATTTGAGCTTCTACATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTc > 1:907277/1‑141 (MQ=255) caCTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTcc < 1:754718/141‑1 (MQ=255) caCTACTACCAATTACACCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGATATAATTTGAGCTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTcc < 2:49070/141‑1 (MQ=255) actactACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCa > 1:821203/1‑141 (MQ=255) actactACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTGTATCATGCCAAATGGCCCa > 1:951867/1‑141 (MQ=255) ctacCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGcc < 2:1035224/141‑1 (MQ=255) tacCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCa < 1:1025638/141‑1 (MQ=255) tacCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCa < 1:198065/141‑1 (MQ=255) acCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCat > 2:1011357/1‑141 (MQ=255) acCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCat > 1:1071811/1‑141 (MQ=255) cAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCatat > 2:309159/1‑141 (MQ=255) tACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACAt < 1:789360/141‑1 (MQ=255) tACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACAt < 2:302598/141‑1 (MQ=255) tCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCaa < 2:44229/141‑1 (MQ=255) ccAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAg < 2:622288/141‑1 (MQ=255) ccAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAg > 1:435564/1‑141 (MQ=255) ccAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAg < 2:233525/141‑1 (MQ=255) tGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAAt < 2:598859/141‑1 (MQ=255) tGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAAt < 2:126853/141‑1 (MQ=255) aTCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTaa > 2:170151/1‑141 (MQ=255) aTAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACt > 2:880897/1‑141 (MQ=255) tAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACta < 2:410430/141‑1 (MQ=255) gCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACtata > 1:489718/1‑141 (MQ=255) gCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACtata > 2:108057/1‑141 (MQ=255) cATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACtatat > 1:963045/1‑141 (MQ=255) aTGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACtatata > 1:883048/1‑141 (MQ=255) aTGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACtatata > 2:653089/1‑141 (MQ=255) gtgGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATataaa < 2:402871/141‑1 (MQ=255) tgGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATataaat < 1:362466/141‑1 (MQ=255) gATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATataaataa < 1:887635/141‑1 (MQ=255) gATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATataaataa < 1:916706/141‑1 (MQ=255) aGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCt > 1:458216/1‑141 (MQ=255) gTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCtt < 2:1056574/141‑1 (MQ=255) gTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCtt > 2:540973/1‑141 (MQ=255) tAATGAAACTGATAAAGCAAGACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGATTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGGCCAAGCCAGATACATGAAGAAAATGAAGCCAACGATATAAAGAATTGCTTg > 2:744884/1‑141 (MQ=255) tAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTg < 2:708282/141‑1 (MQ=255) gAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGt > 2:833859/1‑141 (MQ=255) gAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGt > 2:833979/1‑141 (MQ=255) gAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGCTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGt > 2:919648/1‑141 (MQ=255) aaCTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGTAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGt < 1:201272/60‑1 (MQ=255) aaCTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGTAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGt > 2:201272/1‑60 (MQ=255) aCTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGGCATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACa > 2:404108/1‑141 (MQ=255) tGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAgg > 2:903667/1‑141 (MQ=255) tGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAgg > 2:1042846/1‑141 (MQ=255) tGATAAAGAAAAACTTACTTGATTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAgg > 2:496369/1‑141 (MQ=255) tAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTaa > 1:830814/1‑141 (MQ=255) aaGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAg < 1:266612/141‑1 (MQ=255) aaGCAAAACTTACATGTATCATTGGAGACGTAATTTGAGTTGCTCGATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAg < 2:860320/141‑1 (MQ=255) aGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGa < 2:134612/141‑1 (MQ=255) aGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGa > 2:1044108/1‑141 (MQ=255) aGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGa > 2:771343/1‑141 (MQ=255) aGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGa > 2:1043879/1‑141 (MQ=255) aGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTAAAGGTAAAGa > 2:547733/1‑141 (MQ=255) gCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGAc < 1:109869/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGATATAATTTGAGCTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACa < 2:1029466/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGATATAATTTGAGCTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATAGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACa < 2:165525/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACa < 1:232577/141‑1 (MQ=255) cAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACa < 2:1021179/141‑1 (MQ=255) aaCTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACataa < 2:1055416/141‑1 (MQ=255) aaCTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACaaaa > 1:569038/1‑138 (MQ=255) acttacttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACataat > 2:682144/1‑141 (MQ=255) acttacttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACataat > 2:1048373/1‑141 (MQ=255) acttacttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACataat > 2:969452/1‑141 (MQ=255) acttacttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACataat < 1:309159/141‑1 (MQ=255) acttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAACATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTAGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATg > 2:861425/1‑141 (MQ=255) acttGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGACCAAGCCCTATACATCATGATAGTTAAACCAACTATATAAATAATTGCTGGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATg > 1:102154/1‑141 (MQ=255) tGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATgata > 1:230815/1‑141 (MQ=255) cATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATAc > 2:332441/1‑141 (MQ=255) aTTGGAGACATAATTTGAGGTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACt > 2:767069/1‑141 (MQ=255) gagaCATAATTTGAGTTTCTCTATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTa < 2:565245/141‑1 (MQ=255) aCATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTAGCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCa > 1:703083/1‑141 (MQ=255) tAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCGAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTg < 2:1016284/141‑1 (MQ=255) aTTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTGCa < 1:771343/141‑1 (MQ=255) tttGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTGCaa < 1:498003/141‑1 (MQ=255) ttGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTGCaat < 1:309288/141‑1 (MQ=255) | TGTAAACGCAATTTTATTGCTGCCACTATATAAT‑GCAGCACTACTACCAATTACTCCAATTGTATCTAAAATAGCATGTGGATTGAGTAATGAAACTGATAAAGCAAAACTTACTTGTTTCATTGGAGACATAATTTGAGTTTCTCCATCTGTTGAGGGTTTATCATGCCAAATGGTCCAAGCCATATACATCAAGAAAATTAAACCAACTATATAAATAATTGCTTGAAGTACAGGTAAAGACATAATAATGATAGATACTCCTACCACTGCAAT > CP000730/885621‑885896 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |