| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,152,738 | A→T | 5.5% | I329L (ATA→TTA) | dinB → | DNA‑directed DNA polymerase IV beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,152,738 | 0 | A | T | 5.5% | 277.3 / 4.3 | 88 | I329L (ATA→TTA) | dinB | DNA‑directed DNA polymerase IV beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/46); new base T (2/3); total (39/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.88e-01 | |||||||||||
AATTGAACAAGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTACGTGTT > CP000730/1152599‑1152878 | aaTTGAACAAGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAAt < 1:207013/141‑1 (MQ=255) aaCAAGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGACGGTAGCGAATTCGATAAAGATATATGTAATATCAGTACAATAgatg > 1:209514/1‑141 (MQ=255) ccaGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATCGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGAGAATTTTATACCACCTGCTATGCGCGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCAAAGTAATATCATTACAATAgatgat > 2:70696/3‑141 (MQ=255) aGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGatat > 1:410161/1‑141 (MQ=255) gCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATAtt > 1:65374/1‑141 (MQ=255) cTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTa < 2:1036238/141‑1 (MQ=255) tGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATgg > 1:794179/1‑141 (MQ=255) ggTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGt > 1:473333/1‑141 (MQ=255) ggTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGt > 2:183220/1‑141 (MQ=255) cATTAATTCAATATGATAGTGAAGCTAGGATAGATGAAGATTTTAGTGTGAATTTTATAACACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAGAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGata < 2:870196/141‑1 (MQ=255) aTTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGatat < 2:650346/141‑1 (MQ=255) ttCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCata < 1:261224/141‑1 (MQ=255) ttCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCata < 1:261197/141‑1 (MQ=255) tCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGGTAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCatat < 2:280724/141‑1 (MQ=255) tCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCatat < 2:348763/141‑1 (MQ=255) atatGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCa < 1:221764/141‑1 (MQ=255) tatGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCAt > 1:190060/1‑141 (MQ=255) tGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATAc > 2:575412/1‑141 (MQ=255) gATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATCTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACa > 1:563270/1‑141 (MQ=255) aaGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGtata < 1:547808/141‑1 (MQ=255) gCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGt < 2:674455/141‑1 (MQ=255) gCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGt > 2:719105/1‑141 (MQ=255) cAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGa < 1:623390/141‑1 (MQ=255) cAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGCTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGa < 2:975917/141‑1 (MQ=255) atatatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCCCCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGt < 1:261293/141‑1 (MQ=255) atatatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGt < 2:445492/141‑1 (MQ=255) tatatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTg < 1:537155/141‑1 (MQ=255) tatatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTg > 1:686966/1‑141 (MQ=255) tatatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTg < 1:525203/141‑1 (MQ=255) atatGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACATTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGc < 2:1039686/141‑1 (MQ=255) atatGAACATTTTAACGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGc < 1:898900/141‑1 (MQ=255) aaCATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGtttt > 1:403355/1‑141 (MQ=255) ttttAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTAt < 1:924311/141‑1 (MQ=255) ttAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTc < 2:915568/141‑1 (MQ=255) tAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCg < 1:180294/141‑1 (MQ=255) tAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCg > 1:617156/1‑141 (MQ=255) tAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCg < 1:894336/141‑1 (MQ=255) aaTGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACATTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCg > 2:637451/1‑129 (MQ=255) aaTGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACATTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCg > 2:637526/1‑129 (MQ=255) aaTGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACATTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCg < 1:637526/129‑1 (MQ=255) aaTGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACATTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCg < 1:637451/129‑1 (MQ=255) aaTGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCga < 2:51691/141‑1 (MQ=255) ttttATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGt < 1:976223/141‑1 (MQ=255) ttttATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGt < 2:78967/141‑1 (MQ=255) tataCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGa < 1:356068/141‑1 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTAt > 1:944903/1‑124 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTAt < 2:944903/124‑1 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGCCATGGTAGAAg > 1:654897/1‑141 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAg > 1:872534/1‑141 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAg > 2:782876/1‑141 (MQ=255) taCCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAACCGATGATCTTACCGGTGATATTCCTATGCACACAACGAATAGTGCCGGCGCGCTTTGTATCCgacaaccggcagaag > 1:322318/1‑128 (MQ=255) accaccTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGc > 2:159945/1‑141 (MQ=255) accaccTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTCTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGc > 2:1017901/1‑141 (MQ=255) caccTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCaa < 1:922666/141‑1 (MQ=255) accTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCaaa > 2:977752/1‑141 (MQ=255) accTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCaaa < 1:617419/141‑1 (MQ=255) ccTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATAGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAat < 1:788910/141‑1 (MQ=255) cTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAata < 2:737243/141‑1 (MQ=255) tATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGc < 1:683742/141‑1 (MQ=255) tATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGc < 2:641758/141‑1 (MQ=255) cGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCaaaa > 2:855088/1‑141 (MQ=255) cGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCaaaa > 1:986663/1‑141 (MQ=255) gagaAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAg < 1:863619/141‑1 (MQ=255) aagaTGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGtt < 1:925668/141‑1 (MQ=255) aagaTGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGtt > 2:207054/1‑141 (MQ=255) agaTGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTta < 1:83042/141‑1 (MQ=255) aTGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTtata < 2:68006/141‑1 (MQ=255) aTGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTtata < 2:65374/141‑1 (MQ=255) ggTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATAGCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATaaa > 2:1014511/1‑141 (MQ=255) gTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAAt > 1:974837/1‑141 (MQ=255) gTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAAt > 2:806993/1‑141 (MQ=255) cGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGTGTTGTGTTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCAt < 1:575412/141‑1 (MQ=255) cGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCAt < 2:830193/141‑1 (MQ=255) aaTTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATgg < 1:830607/141‑1 (MQ=255) aTTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGt > 2:801001/1‑141 (MQ=255) tttGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATNCATGGTa > 2:816261/1‑141 (MQ=255) ttGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTaa > 2:911262/1‑141 (MQ=255) ttGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTaa > 2:537261/1‑141 (MQ=255) tGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAAt < 2:965039/141‑1 (MQ=255) aGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGa < 2:986967/141‑1 (MQ=255) tCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCa > 1:795325/1‑141 (MQ=255) tCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCa < 1:279597/141‑1 (MQ=255) aaGTAATATCATTACAATAGATCATAATAATGGTGATAGTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAATGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTc > 2:545931/1‑141 (MQ=255) gTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTcac < 2:975395/141‑1 (MQ=255) atatCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACaaa < 1:16622/141‑1 (MQ=255) cATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGttt > 2:1011311/1‑141 (MQ=255) aTTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTa > 2:629600/1‑141 (MQ=255) tACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTACg > 2:1067/1‑141 (MQ=255) aTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTACGTGtt > 2:290663/1‑141 (MQ=255) aTAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTACGTGtt > 2:745154/1‑141 (MQ=255) | AATTGAACAAGCTGATGGTACATTAATTCAATATGATAGTGAAGCCAAGATATATGAACATTTTAATGTGAATTTTATACCACCTGCTATGCGAGAAGATGGTAGCGAATTTGATAAAGATCTAAGTAATATCATTACAATAGATGATATTAATGGTGATATTCATATGCATACAACGTATAGTGATGGTGCGTTTTCTATTCGAGACATGGTAGAAGCAAATATCGCAAAAGGTTATAAATTCATGGTAATTACTGATCATTCACAAAGTTTACGTGTT > CP000730/1152599‑1152878 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |