| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,272,132 | G→C | 5.0% | intergenic (+28/‑38) | clpQ → / → clpY | T01 family HslV component of HsIUV peptidase/T01 family HslU component of HsIUV peptidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,272,132 | 0 | G | C | 5.0% | 245.4 / 3.5 | 75 | intergenic (+28/‑38) | clpQ/clpY | T01 family HslV component of HsIUV peptidase/T01 family HslU component of HsIUV peptidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/33); new base C (2/2); total (39/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 | |||||||||||
AACGCCATGCATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCAAT > CP000730/1271995‑1272267 | aaCGCCATGCATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCaa < 1:909454/141‑1 (MQ=255) gCATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAAtttt > 1:722901/1‑141 (MQ=255) cATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTTGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGACCAATTAATTTTa < 1:309334/141‑1 (MQ=255) cATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTa < 1:459463/141‑1 (MQ=255) cATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTaa > 2:838529/1‑141 (MQ=255) aagaaATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAAt < 1:252696/141‑1 (MQ=255) aagaaATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCCTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATACTCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAAt < 1:222606/141‑1 (MQ=255) agaaATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATg < 1:420421/141‑1 (MQ=255) aaaTGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGat < 1:1031418/141‑2 (MQ=255) aTGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAAt > 1:862117/1‑141 (MQ=255) ggCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTa > 1:150180/1‑141 (MQ=255) ggCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTa > 1:75318/1‑141 (MQ=255) gCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTaa > 1:315089/1‑141 (MQ=255) atatGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTTATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATg < 1:670354/141‑1 (MQ=255) atGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGa < 2:476670/141‑1 (MQ=255) atGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGa < 1:986112/141‑1 (MQ=255) agCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAg < 2:131220/141‑1 (MQ=255) gCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGc > 1:1076423/1‑141 (MQ=255) cTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCt < 2:357886/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTgg < 1:971818/141‑1 (MQ=255) tGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTgg < 1:994110/141‑1 (MQ=255) aaGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTTGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGACCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAAt > 1:475761/1‑141 (MQ=255) aaGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAAt > 2:602573/1‑141 (MQ=255) aGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATa > 1:345210/1‑141 (MQ=255) cGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGAtt > 1:23549/1‑141 (MQ=255) tttGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCaaa < 1:625168/141‑1 (MQ=255) tgtgTCTTGACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATCAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAg < 1:942492/141‑1 (MQ=255) gtgtCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGTTACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGa < 2:421774/141‑1 (MQ=255) gtgtCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGa > 2:296057/1‑141 (MQ=255) gtgtCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGa > 2:381594/1‑141 (MQ=255) gtgtCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGa > 2:624112/1‑141 (MQ=255) gtCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGaaa > 1:580570/1‑141 (MQ=255) cTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATc < 2:163130/141‑1 (MQ=255) aCCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTAt > 2:612340/1‑141 (MQ=255) ccAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATc < 2:990919/141‑1 (MQ=255) ccAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATc < 1:642419/141‑1 (MQ=255) ccAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATc < 2:826526/141‑1 (MQ=255) catcgagcgtatTGCTGTCGAAACGCCATAATAATGAGCGCAAGATTGAGAACTACGAGCAATGAATTTTAGCTACCAGACGGAGGAATGACCTTAATGGATACAGCTGGAATAGGATTATCGCCAAAGGAACGCGTACCt < 2:374658/132‑1 (MQ=255) gATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCtaaat > 2:717235/1‑141 (MQ=255) gATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAAGTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCACATGTGTTCGTATCtaaat < 1:1071897/141‑1 (MQ=255) gATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAACCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCtaaat < 1:585703/141‑1 (MQ=255) ataataTTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCtaaatt > 1:1274/1‑141 (MQ=255) aataTTGTTGGCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCtaaattaa > 2:768156/1‑141 (MQ=255) tatTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCtaaattaaat > 2:470764/1‑141 (MQ=255) gttgtCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAAt > 1:54183/1‑141 (MQ=255) gtCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACa > 2:740252/1‑141 (MQ=255) aaaCACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGt > 2:41449/1‑141 (MQ=255) aaCACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGtt > 1:856317/1‑141 (MQ=255) aaCACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGtt > 1:345143/1‑141 (MQ=255) acacTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTg < 1:78209/141‑1 (MQ=255) cacTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTgg > 2:276430/1‑141 (MQ=255) cacTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTgg < 1:921456/141‑1 (MQ=255) cacTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAACGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTgg > 2:415418/1‑141 (MQ=255) cacTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTGAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTgg < 2:801277/141‑1 (MQ=255) tataATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACa > 1:974094/1‑141 (MQ=255) tataATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGACCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATATATCGTTGGACa > 1:996687/1‑141 (MQ=255) ataataATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACaa > 1:452453/1‑141 (MQ=255) taataaTCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACaaa > 2:445328/1‑141 (MQ=255) ataatCAGAGCACGATAAATAATTACGATCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATcattttgtccaac < 1:233282/141‑13 (MQ=255) ataatCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATcattttgtccaac < 1:86595/141‑13 (MQ=255) ataatCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAat < 2:100809/141‑1 (MQ=255) cAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGc > 1:570358/1‑141 (MQ=255) aagagCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTATCTTCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGc < 1:420337/140‑1 (MQ=255) agagCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCt > 2:279457/1‑141 (MQ=255) gCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTaaa > 2:476656/1‑141 (MQ=255) aCGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACg < 1:137645/141‑1 (MQ=255) cGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTCACTCAAAAAGAAATCGTATCCAAATAAAATGAATACATCGCTGGCCACAATGCAGGTAAACGt > 1:322252/1‑141 (MQ=255) cGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGt > 1:593019/1‑141 (MQ=255) cGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGt < 2:809283/141‑1 (MQ=255) ataatTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTg < 1:803742/141‑1 (MQ=255) taatTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTgg < 1:85637/141‑1 (MQ=255) aatTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGc > 2:1036799/1‑141 (MQ=255) atTACGACCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATATATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCa < 2:487244/141‑1 (MQ=255) ttACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCaa > 2:925863/1‑141 (MQ=255) tACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCAAt > 2:975975/1‑141 (MQ=255) | AACGCCATGCATCGCATTTGTCTGCTGAAGAAATGGCATATGAGAGCTTGAAAGTAGCGGCTGATATTTGTGTCTTTACCAACGATAATATTGTTGTCGAAACACTATAATAATCAGAGCACGATAAATAATTACGAGCAATTAATTTTAGTTAAAAGACGGAGGAATGAAATTAATGGATACAGCTGGAATAAGATTAACTCCAAAAGAAATCGTATCTAAATTAAATGAATACATCGTTGGACAAAATGATGCTAAACGTAAAGTGGCAAT > CP000730/1271995‑1272267 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |