| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 1,421,615 | 0 | C | G | 5.1% | 308.4 / 5.7 | 94 | intergenic (+51/+89) | oppD/phoU | M3 family oligoendopeptidase F/possible PnaS family phosphate:sodium (Na+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (46/43); new base G (3/2); total (49/45) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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CAGCCACTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAATTGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGATG > CP000730/1421475‑1421755 | cAGCCACTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAATTGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTAc < 2:268404/141‑1 (MQ=255) aGCCACTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAAATGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTACt < 1:244250/141‑1 (MQ=255) ccACTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAATTGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTACTaa > 2:679715/1‑141 (MQ=255) aCTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAATTGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTACTAAtt > 1:185955/1‑141 (MQ=255) 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2:539781/9‑136 (MQ=255) tCA‑C‑ATTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACttt < 2:714723/141‑1 (MQ=255) ca‑c‑aTTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTc > 1:1078102/1‑141 (MQ=255) ca‑c‑aTTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTc > 1:625832/1‑141 (MQ=255) c‑aTTGCTAATTGTGAGCATCTTGGTTTTTTTGCGAGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGCGATTTTATATTTATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAg < 2:657912/141‑1 (MQ=255) c‑aTTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAg < 1:152041/141‑1 (MQ=255) c‑aTTACTAAAAGTGAGAAACTTGGTTTTTTTTAGGGTGTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTACGTTATTGTTCGTAATGTTTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCaa > 2:390557/1‑140 (MQ=255) aCTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGAt < 1:249497/141‑1 (MQ=255) aCTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGAt < 1:347962/141‑1 (MQ=255) cTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGATg < 2:188369/141‑1 (MQ=255) cTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGATg < 2:592633/141‑1 (MQ=255) | CAGCCACTTAAATCTACAATTCAATATATTTCTGATTTAGTCGATGAAGTTGAAAAATTAACAGATGAAATTGAGCAAGCAAATAACTAAGATGCGAGACAATTTATAGTAGAACAATATAAACCAAGATTTTCA‑C‑ATTACTAATTGTGAGAATCTTGGTTTTTTTGAGGGTTTATGAATAATAGAAATATATATTTATCGTAAGGGATTTTATAGTAATAACTTTAAGTTATTGTTCGTAATGTGTACCTGTTAAATAAAAATAAACACTTTCAGCGATG > CP000730/1421475‑1421755 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |