| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,740,388 | G→A | 6.8% | L230L (CTA→TTA) | lytH ← | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,740,388 | 0 | G | A | 6.8% | 291.6 / 4.7 | 97 | L230L (CTA→TTA) | lytH | N‑acetylmuramoyl‑L‑alanine amidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (42/48); new base A (4/3); total (46/51) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.05e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCTTTGAT > CP000730/1740248‑1740526 | aaTTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAATACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAg < 2:927928/141‑1 (MQ=255) aTTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGTACTTTTGTTTGTCTTAACACTGGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGa < 2:10439/141‑1 (MQ=255) tttGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGAc < 2:131269/141‑1 (MQ=255) tGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCt > 1:814889/1‑141 (MQ=255) tGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTGGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCt > 1:572501/1‑141 (MQ=255) gTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCtt > 1:140299/1‑141 (MQ=255) tCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAAACCttt < 1:508081/141‑1 (MQ=255) tCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAAGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCttt > 1:22607/1‑141 (MQ=255) tATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGCGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAATACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTttct < 2:547178/141‑1 (MQ=255) aTGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAAACCTttctt > 1:125411/1‑141 (MQ=255) tGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAAACCTttcttc > 2:686782/1‑141 (MQ=255) gTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTtcttct > 2:761664/1‑141 (MQ=255) gTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTtcttct < 2:963408/141‑1 (MQ=255) aTCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGt > 2:139381/1‑141 (MQ=255) aTCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATATTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGt > 1:1025703/1‑141 (MQ=255) tCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTa < 2:194679/141‑1 (MQ=255) tCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTa < 1:949523/141‑1 (MQ=255) tAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGt < 1:754220/141‑1 (MQ=255) tAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGt < 2:951050/141‑1 (MQ=255) aaTCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTc > 2:113609/1‑141 (MQ=255) atcatcGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCt > 2:738885/1‑141 (MQ=255) tcatcGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGACATTAGTGAGGAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTa < 1:29863/141‑1 (MQ=255) atcGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAAc < 1:913581/141‑1 (MQ=255) cGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGt > 1:489427/1‑141 (MQ=255) gTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTa > 1:15961/1‑141 (MQ=255) tttCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTAt < 2:3472/141‑1 (MQ=255) tttCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTAt < 2:3483/141‑1 (MQ=255) catcaGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTg > 2:516351/1‑141 (MQ=255) catcaGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTg > 1:1077544/1‑141 (MQ=255) atcaGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGc < 2:1032313/141‑1 (MQ=255) caGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTa < 2:786580/141‑1 (MQ=255) gTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTaaa > 1:489791/1‑141 (MQ=255) ttGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAg > 1:125886/1‑141 (MQ=255) tGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGc < 2:667286/141‑1 (MQ=255) tGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTCCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGc < 2:607381/141‑1 (MQ=255) ggTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGctc < 2:122154/141‑1 (MQ=255) gTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTTGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGctct < 1:819716/141‑1 (MQ=255) gTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGctct < 1:498401/141‑1 (MQ=255) gTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGctct < 1:879465/141‑1 (MQ=255) ttACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCtt > 1:815652/1‑141 (MQ=255) ttACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGCCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCtt > 2:786111/1‑141 (MQ=255) tACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCttt > 2:853632/1‑141 (MQ=255) cTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGa > 2:207210/1‑141 (MQ=255) cTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGa < 1:194802/141‑1 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1:952596/1‑141 (MQ=255) aCCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATg > 1:778813/1‑141 (MQ=255) ccTATTTCTAATAAAACAGCGGGAACTTTTAGTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTATAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGa < 2:244103/141‑1 (MQ=255) ccTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGa > 2:386777/1‑141 (MQ=255) cTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGAt > 2:523678/1‑141 (MQ=255) aaTTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATAc > 1:751346/1‑141 (MQ=255) aTTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATAcc < 2:17523/141‑1 (MQ=255) aTTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATAcc < 1:626902/141‑1 (MQ=255) aTTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATAcc > 1:137470/1‑141 (MQ=255) aTTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAAACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATAcc < 2:514809/141‑1 (MQ=255) cTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAAt > 2:730700/1‑141 (MQ=255) aataaAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATaa > 1:229163/1‑141 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gAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCAt > 2:850717/1‑141 (MQ=255) aaCTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCAtt < 2:983964/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCAttt > 1:749653/1‑141 (MQ=255) ttttGTTTGGCTTCACACTTGATAATTTTCTTGTCTTAAAGCGCGATTAGAAAGTAGACTTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGCTTTTCATGATGCCAATAAACTGTCATCCCATGTGc < 2:207709/141‑1 (MQ=255) ttgtttgtCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCAt < 2:1000134/141‑1 (MQ=255) ttgtttgtCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCAt < 2:95618/141‑1 (MQ=255) tgtCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAgat < 1:1071834/141‑1 (MQ=255) tCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAgatga > 1:539066/1‑141 (MQ=255) tCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAgatga > 1:677050/1‑141 (MQ=255) tCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTGGAACCGCGATTAGAAAGGAAACTTTTCTTCGGAATTGTTGCGGCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAgatga > 1:973521/1‑141 (MQ=255) aaCACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCt < 1:444675/141‑1 (MQ=255) acacTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTa > 1:700380/1‑141 (MQ=255) acTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAAc > 1:678618/1‑141 (MQ=255) cTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACg < 2:229163/141‑1 (MQ=255) cTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACg < 1:914303/141‑1 (MQ=255) tGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGca > 2:409516/1‑141 (MQ=255) tGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGca < 1:850732/141‑1 (MQ=255) tGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGca > 2:797001/1‑141 (MQ=255) ttgtcttgAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACNTATCTGCTAAAGCTCTTTGAATANCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGtat < 2:50608/141‑1 (MQ=255) ttgtcttgAACCGCGATTAGAAAGTAATCCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGtat < 2:860678/141‑1 (MQ=255) cttgAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTc > 2:192029/1‑141 (MQ=255) tgAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCaa < 2:634587/141‑1 (MQ=255) aCCGCGATTAGAAAGTAAACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAATGCATCATTATGTATACTCAAATa > 1:383148/1‑141 (MQ=255) gATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCAt < 2:776682/141‑1 (MQ=255) gAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCt < 2:312523/141‑1 (MQ=255) tAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCTTTGat < 1:399576/141‑1 (MQ=255) | AATTTGTCTATGTAATTGATCTTTAATCATCGTTTCATCAGTTGGGTTACTAATATAACCTAATTCTAATAAAACAGCAGGAACTTTTGTTTGTCTTAACACTTGATAATTTTCTTGTCTTGAACCGCGATTAGAAAGTAGACCTTTCTTCTGAATCGTAGCGTCTAACGTATCTGCTAAAGCTCTTTGATTATCATGATACCAATAAACTGTCATTCCATTTGCATTAGATGATTCTAACGCATCATTATGTATACTCAAATAGGCATCGCCTTTGAT > CP000730/1740248‑1740526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |