| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 2,110,918 | 0 | T | C | 7.7% | 291.3 / 12.3 | 104 | intergenic (‑164/+68) | USA300HOU_1973/USA300HOU_1974 | hypothetical protein/hypothetical bacteriophage protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (49/47); new base C (3/5); total (52/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.15e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
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tATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTa > 1:340494/1‑141 (MQ=255) tATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTa > 2:701044/1‑141 (MQ=255) tAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCAGTCCTTCTACGTAata > 1:901357/1‑141 (MQ=255) gCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAAtata > 2:151906/1‑141 (MQ=255) aTTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACt < 2:132104/141‑1 (MQ=255) tttAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACtt < 2:94169/141‑1 (MQ=255) ttAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTg > 2:164866/1‑141 (MQ=255) aataaCTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTGTc < 1:708128/141‑1 (MQ=255) ataaCTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTGTCt > 2:728769/1‑141 (MQ=255) taaCTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTGTCtt < 2:960881/141‑1 (MQ=255) cTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTGTCTTACt > 1:113063/1‑141 (MQ=255) | GTAGTATCAAGACGCATCTATACTTGATGTGTAGTAATGTATTTACTATTAGTTTGAACATGTTCATACCTCATAAATAAAAAGACACATCACATAGTGATGCGCCTCTTGTTCATGCGTCGTATTAGCATTTAATAACTTTAAATATTAATCTGATACTAACATAATAAACTGTTTTAATGCGGACTTACATAGGGTAAAAGTCCGCTACACATAACCAATATACTTTGCTAACTTATCGATCAGTGCATTCCTTCTACGTAATATACTTGTCTTACT > CP000730/2110779‑2111057 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |