| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,330,506 | T→A | 5.2% | P159P (CCA→CCT) | lacD ← | tagatose‑bisphosphate aldolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,330,506 | 0 | T | A | 5.2% | 415.6 / 8.2 | 130 | P159P (CCA→CCT) | lacD | tagatose‑bisphosphate aldolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/58); new base A (5/2); total (70/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.50e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
CTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACGTTT > CP000730/2330367‑2330643 | cTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATg > 2:137953/1‑141 (MQ=255)cTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATg > 1:907051/1‑141 (MQ=255) tttCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATgg < 1:1028256/141‑1 (MQ=255) tttCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATgg < 1:152753/141‑1 (MQ=255) tCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATAATAATAAAAAGAATGGaa < 2:589149/141‑1 (MQ=255) cAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAat > 1:473470/1‑141 (MQ=255) cAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAat > 1:607818/1‑141 (MQ=255) aaTACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAata > 2:398908/1‑141 (MQ=255) aCATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATAtct > 2:185065/1‑141 (MQ=255) cAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTg > 1:824757/1‑141 (MQ=255) cGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCaa < 2:240028/141‑1 (MQ=255) gTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAac < 2:887081/141‑1 (MQ=255) tAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAacac > 2:929676/1‑141 (MQ=255) aaaGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAAcaca < 2:595427/141‑1 (MQ=255) aGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACAtt > 1:662952/1‑141 (MQ=255) gCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAAGCTTTCTCGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTc > 1:934283/1‑141 (MQ=255) gCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTc > 1:734322/1‑141 (MQ=255) cGTGTNTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCt < 1:367980/141‑1 (MQ=255) cGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTTTTTTTTTTTCTCTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCt > 2:150669/1‑141 (MQ=255) cGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCt > 2:526954/1‑141 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATATTTTCAGGGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTg < 1:9385/141‑1 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTg > 1:47317/1‑141 (MQ=255) gTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTg > 1:271272/1‑141 (MQ=255) tGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGa > 2:970694/1‑141 (MQ=255) gTTCTGAGAATACTTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAAc < 2:270607/141‑1 (MQ=255) tCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCg < 1:55371/141‑1 (MQ=255) tGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGAt > 1:158757/1‑141 (MQ=255) cATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 2:760263/141‑1 (MQ=255) cATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 1:712056/141‑1 (MQ=255) tGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGc < 1:566129/141‑1 (MQ=255) tGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGc < 2:868149/141‑1 (MQ=255) gCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTTCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGct > 2:1061960/1‑141 (MQ=255) cTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATNTATGctt > 2:814271/1‑141 (MQ=255) ttCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGcttt < 2:421353/141‑1 (MQ=255) gTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGctttctt > 2:847239/1‑141 (MQ=255) tAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCtttt > 1:1021987/1‑141 (MQ=255) aaCCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTg < 1:686395/141‑1 (MQ=255) aCCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGa > 2:908189/1‑141 (MQ=255) ccTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGaa > 1:247075/1‑141 (MQ=255) cTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa < 1:1023629/126‑1 (MQ=255) cTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTa > 2:1023629/1‑126 (MQ=255) cTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAAt < 1:264605/141‑1 (MQ=255) cTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTa < 2:560865/141‑1 (MQ=255) tAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTaa > 2:177949/1‑141 (MQ=255) tAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTaa < 2:415723/141‑1 (MQ=255) ggCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAAtt > 2:316996/1‑141 (MQ=255) gCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAAttt > 1:929779/1‑141 (MQ=255) tAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATttctt < 2:526180/141‑1 (MQ=255) aaCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTCAAACGAATGGAATTTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATttcttc < 1:214676/141‑1 (MQ=255) aCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCa > 1:913347/1‑141 (MQ=255) aCTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCa > 1:31098/1‑141 (MQ=255) cTTTCGCGAATTCAACACTACCGTCATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACATATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAg > 1:169534/1‑141 (MQ=255) tttGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGca > 1:301846/1‑141 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca > 2:549642/1‑141 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca > 2:809997/1‑141 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca < 2:907051/141‑1 (MQ=255) gCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatca > 2:549999/1‑141 (MQ=255) cGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGcatcat < 1:335154/141‑1 (MQ=255) gAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATAATTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCatcatc < 2:350912/141‑1 (MQ=255) aaTTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCAtcatca > 2:261118/1‑141 (MQ=255) aaTTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCAtcatca > 2:1026/1‑141 (MQ=255) ttCAACACTACCGTTATCAGGAGTGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAc > 1:279846/1‑141 (MQ=255) ttCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAc < 2:649146/141‑1 (MQ=255) aaaCACAACAGTTAGCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAAGACTTCTAAAAAGGATGGAATATCTTCTGCAACACAGTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTGCTTTTGAATGTTAATTTCGTCGGCATCATCAAcat < 1:88398/140‑1 (MQ=255) acacTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAcatca < 1:897586/141‑1 (MQ=255) acacTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAAcatca > 2:762839/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTATTAGGGCTAAAATGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 2:322606/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 2:423287/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 1:514057/1‑141 (MQ=255) acTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATa > 2:33449/1‑141 (MQ=255) gTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaag > 1:138769/1‑141 (MQ=255) tATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaagta < 2:64368/141‑1 (MQ=255) tATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATagtaaagta < 1:877933/141‑1 (MQ=255) gAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAAtt > 2:304462/1‑141 (MQ=255) gttgtCATCGTATGTTAATACTTCTAAGAAGAAAGGAATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAAc < 2:224478/141‑1 (MQ=255) tgtCATTGTATTTTAATACTTCTAAGAAGATAGGGATGTCTTCTGCAACACATTCTGAACGGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTATGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAATGTAAGTGTTTAAAAg < 2:236109/141‑1 (MQ=255) tgtCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACac > 2:984415/1‑140 (MQ=255) gtCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGc > 2:782975/1‑141 (MQ=255) tCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCa > 2:315325/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCAt > 2:416890/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCAt > 1:22176/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCAt > 2:777385/1‑141 (MQ=255) cATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGAATCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGACTTTAACAGCAt > 2:1070689/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 2:673320/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 1:1014686/1‑141 (MQ=255) cGTATGTTAATACTTCCAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTg > 1:993197/1‑141 (MQ=255) gTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgc > 2:1075825/1‑141 (MQ=255) gTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgc < 2:607818/141‑1 (MQ=255) tATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTgcg < 1:945591/141‑1 (MQ=255) gTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCt < 2:64303/141‑1 (MQ=255) gTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTNAACAGCATTTGCGCCt < 1:885845/141‑1 (MQ=255) ttAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCtt < 1:484316/141‑1 (MQ=255) tAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTg < 1:815644/141‑1 (MQ=255) tAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTg < 2:824757/141‑1 (MQ=255) aaTACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGt < 1:316996/141‑1 (MQ=255) aCTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCt > 1:307001/1‑141 (MQ=255) tAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTaa < 1:730906/141‑1 (MQ=255) tAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTCTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTaa < 2:845446/141‑1 (MQ=255) aaaaaGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTaaa < 2:365240/141‑1 (MQ=255) gAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACGttt < 2:421967/141‑1 (MQ=255) | CTTTCAATACATCAACGTTAAAGCGTGGTTCTGAGAATAATTTCATTGCTTCGTTAACCTTTCTAGGCTTAACTTTTGCGAATTCAACACTACCGTTATCAGGAATGTTGTCATCGTATGTTAATACTTCTAAAAAGAATGGAATATCTTCTGCAACACATTCTGAACCGATTCTTTCAATGTATGCTTTCTTTTGAATGTTAATTTCTTCAGCATCATCAACATCATAGTAAAGTAAGAATTTAACAGCATTTGCGCCTTGTTCTTTTAAACGTTT > CP000730/2330367‑2330643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |