| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,654,178 | C→T | 6.4% | T147T (ACC→ACT) | USA300HOU_2507 → | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,654,178 | 0 | C | T | 6.4% | 310.9 / 5.9 | 104 | T147T (ACC→ACT) | USA300HOU_2507 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (44/53); new base T (3/4); total (47/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.86e-01 | |||||||||||
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
TGACTGCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGATGCGATT > CP000730/2654039‑2654316 | tGACTGCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTAccc < 2:350235/141‑1 (MQ=255) ccTGCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGGTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCa < 2:1011840/140‑1 (MQ=255) cTGCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCAt > 1:298549/1‑141 (MQ=255) gCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCAttt > 1:401847/1‑141 (MQ=255) cAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCAtttt > 2:116568/1‑141 (MQ=255) cAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCAtttt > 1:780533/1‑141 (MQ=255) aGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCAttttt > 2:736614/1‑141 (MQ=255) ggtggtGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTa > 1:886586/1‑141 (MQ=255) ggaggtgCGTCAACCCTTCCTCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTa < 2:73686/138‑1 (MQ=255) tgCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGc < 2:35761/141‑1 (MQ=255) tgCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGc > 2:698159/1‑141 (MQ=255) cGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGa > 1:724541/1‑141 (MQ=255) cGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGa > 1:622895/1‑141 (MQ=255) cGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGa < 1:356072/141‑1 (MQ=255) cGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGa > 1:622767/1‑141 (MQ=255) gTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGAt > 1:738066/1‑141 (MQ=255) cAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTg > 2:137458/1‑141 (MQ=255) aCCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTc > 2:282334/1‑141 (MQ=255) aTTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCAtt < 2:533735/141‑1 (MQ=255) aTTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCAtt > 1:84525/1‑141 (MQ=255) ttCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTa < 1:442719/141‑1 (MQ=255) tcatcaAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCCACCCTGTTTCTACAATTCGATCGTTTCATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTAt < 1:488338/141‑1 (MQ=255) tcatcaAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTAt < 1:947317/141‑1 (MQ=255) tcatcaAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTAt < 1:991300/141‑1 (MQ=255) aaaGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCTCTCATATTAGTCGTCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTg < 2:126801/141‑1 (MQ=255) aGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCg > 1:625725/1‑141 (MQ=255) tCAACTTGCCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTct > 1:861031/1‑141 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTg > 2:822697/1‑135 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTg < 1:822697/135‑1 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTg < 1:822589/135‑1 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTg > 2:822589/1‑135 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTct > 1:178647/1‑141 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTct < 2:684092/141‑1 (MQ=255) tCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACAATGTTTCTAACATTAGATAGTTTAATTGTTGTGCTTGGAGGTGTTAATCCATTTTTACTTGCGATTGTCATTTTGATTGAGGAct > 1:593740/1‑141 (MQ=255) cAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTcta > 2:768659/1‑141 (MQ=255) cAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGActa > 1:539437/1‑141 (MQ=255) aCCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGTTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTAttt < 2:1031287/141‑1 (MQ=255) aCCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTAttt > 1:775293/1‑141 (MQ=255) aTTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCacaa < 1:990426/141‑1 (MQ=255) ttGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTCATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGGCTACTATTTCacaac > 2:106226/1‑141 (MQ=255) ttGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCacaac > 2:325646/1‑141 (MQ=255) tGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTc < 1:285221/141‑1 (MQ=255) aGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCAt > 2:969614/1‑141 (MQ=255) aCTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGa > 2:76066/1‑141 (MQ=255) tatTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTa < 2:139240/141‑1 (MQ=255) tatTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTATAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTa > 1:134888/1‑141 (MQ=255) atTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTAc < 2:964018/141‑1 (MQ=255) atTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTAc < 1:999250/141‑1 (MQ=255) aGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGc < 1:201361/141‑1 (MQ=255) tCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCg < 1:422127/141‑1 (MQ=255) gCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCt < 1:733766/141‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACGAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCta < 1:1046421/141‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGTGGAGTTACTCCATTTTTAATTGCAATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACGAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCta < 1:410927/141‑1 (MQ=255) ccTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCtc < 1:1030610/141‑2 (MQ=255) tATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCtaataa < 2:467099/141‑1 (MQ=255) aTTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTaataat > 2:806459/1‑141 (MQ=255) aTTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTaataat > 2:300783/1‑141 (MQ=255) ttttAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAatg > 2:166751/1‑141 (MQ=255) ttttAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAatg < 1:917231/141‑1 (MQ=255) ttAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAatgat < 1:766676/141‑1 (MQ=255) tagaaaCAGTGTTGCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAatgatg > 1:228137/5‑141 (MQ=255) aGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGc < 1:385709/141‑1 (MQ=255) gCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCt > 1:707687/1‑141 (MQ=255) gCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCt > 2:592010/1‑141 (MQ=255) gCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCt < 1:724916/141‑1 (MQ=255) cAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTc < 2:724541/141‑1 (MQ=255) acacTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAg < 2:411678/141‑1 (MQ=255) acacTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGACTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAg < 2:539437/141‑1 (MQ=255) cTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGAtt > 1:662063/1‑141 (MQ=255) tttCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCAt < 1:944274/141‑1 (MQ=255) tttCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCAt < 1:311521/141‑1 (MQ=255) ttCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATa > 2:1085392/1‑141 (MQ=255) tCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATaa < 1:518813/141‑1 (MQ=255) aaaaTTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTCCCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCa < 1:942558/141‑1 (MQ=255) aaaaTTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCa < 2:602062/141‑1 (MQ=255) tCGCTCGTTTAATTTCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAAt < 2:340212/141‑1 (MQ=255) cGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATc < 1:415019/141‑1 (MQ=255) cGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATc > 2:451789/1‑141 (MQ=255) tCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCAtt > 1:496211/1‑141 (MQ=255) tCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCAtt > 1:315445/1‑141 (MQ=255) tCGTTTAATCGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCAtt > 1:953068/1‑141 (MQ=255) cGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTa > 2:105480/1‑141 (MQ=255) gTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTAt < 2:1014765/141‑1 (MQ=255) gTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTAt < 1:53838/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTCCTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCAcc < 2:501313/141‑1 (MQ=255) aaTTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCAcc < 1:619872/141‑1 (MQ=255) ttGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTg < 2:625967/141‑1 (MQ=255) tGCTGTTCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTTAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTgg < 2:327658/141‑1 (MQ=255) tGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATGATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTgg < 2:933884/141‑1 (MQ=255) tGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTgg > 2:993280/1‑141 (MQ=255) cTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGAt < 1:785981/141‑1 (MQ=255) tgtgCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGAtg > 2:162629/1‑141 (MQ=255) gCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGAtggtg < 1:880663/141‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATggtggt < 1:282334/141‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATggtggt < 1:251530/141‑1 (MQ=255) ttGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATggtggt < 2:586348/141‑1 (MQ=255) cGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGa > 1:194854/1‑141 (MQ=255) tACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGATGCGAt < 2:650460/141‑1 (MQ=255) tACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGATGCGAt < 2:865494/141‑1 (MQ=255) aCCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGATGCGAtt < 1:928208/141‑1 (MQ=255) | TGACTGCAGGTGGTGCGTCAACCATTCATCAAAGTTTCAACTTACCGTATTGGCTGAGCGCACTCATATTAGTCGCCTTTATTTTAGCAACACTGTTTCTAAAATTCGATCGTTTAATTGCTGTGCTTGGCGGTGTTACCCCATTTTTAATTGCGATTGTCATTATGATTGCGGTCTACTATTTCACAACAAGTCATCTTGATTTTACTGCCGCTAATAATGATGCTCAGATTCATAAGCAGAAATCATTATCACCTGGATGGTGGTTTGATGCGATT > CP000730/2654039‑2654316 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |