| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,752,055 | G→A | 5.2% | F283F (TTC→TTT) | betB ← | betaine‑aldehyde dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,752,055 | 0 | G | A | 5.2% | 286.2 / 3.9 | 97 | F283F (TTC→TTT) | betB | betaine‑aldehyde dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (47/44); new base A (2/3); total (50/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.74e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
CATTTCAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCTTACCA > CP000730/2751920‑2752193 | cATTTCAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAata > 1:153541/1‑141 (MQ=255) tttCAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGTTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATc > 1:592556/1‑141 (MQ=255) ttCAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATcc > 1:367066/1‑141 (MQ=255) cAGTATCAGCATCAAAACCATTACGTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATccac > 2:228174/1‑141 (MQ=255) cAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTTTTTTTTTCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATccac > 2:215658/1‑141 (MQ=255) gTATCAGCATCAAAACCATTATCTAACTTGATTTTTTTTACGCGATCAATAAGTGCTTGCGCAAATTTGTCTTTAATACTGTGTTGTACTAATATCTTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGTAAATATacacac > 2:142089/1‑139 (MQ=255) tATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAt < 2:32350/141‑1 (MQ=255) tATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAt < 2:32326/141‑1 (MQ=255) aTCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt < 2:903793/141‑1 (MQ=255) aTCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt < 2:213923/141‑1 (MQ=255) aTCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt < 2:748251/141‑1 (MQ=255) aTCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt < 2:993750/141‑1 (MQ=255) cAGCATCAAAACCATTACCTAGTTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTa < 2:310539/141‑1 (MQ=255) gCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGACATATCCACCATTTAAc > 2:18106/1‑141 (MQ=255) tCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCt < 2:436509/141‑1 (MQ=255) aaaaCCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTg < 1:733990/141‑1 (MQ=255) aaaaCCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTg < 2:944685/141‑1 (MQ=255) aaaCCATTGCCTAATTTTATTTGGTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCGTGATCCTTCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTgg < 2:373185/141‑1 (MQ=255) aTTACCTAATTTGATTTTTTTTTTTTTTTTTATAAGTGCTTGCGCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTATTATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCTTTTTACGCTTGGTCTAc > 2:347364/1‑141 (MQ=255) aTTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGAAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTAc < 1:518144/141‑1 (MQ=255) ccTAATTTGATTTTTTTCACTCTTTCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTTcc > 2:167150/1‑141 (MQ=255) ccTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGcc < 1:1002822/141‑1 (MQ=255) ccTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGcc < 1:672790/141‑1 (MQ=255) ccTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCGCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACGTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGcc > 2:167174/1‑141 (MQ=255) ttGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCa > 1:964765/1‑141 (MQ=255) tttttttCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCCTTTAACGCTTGGTATACTGCCAATTCAAAAt > 1:52870/1‑141 (MQ=255) tttttttCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAAt > 1:208183/1‑141 (MQ=255) tttttttCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAAt < 2:784231/141‑1 (MQ=255) tttttttCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAAt > 1:443194/1‑141 (MQ=255) tttCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGc < 1:474803/141‑1 (MQ=255) cACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt < 1:154789/105‑1 (MQ=255) cACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCAtt > 2:154789/1‑105 (MQ=255) cACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGcatc > 1:105942/1‑141 (MQ=255) cttgATCATTAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGcatcat > 2:316758/4‑141 (MQ=255) cgcgATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACACACTTGACCTGCATGGAAATATACACCATTTAACGCTTGGTCTCCTGCCAATTCAAAATAAGcatcat > 1:490554/1‑141 (MQ=255) cgcgATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGcatcat > 1:490557/1‑141 (MQ=255) cgcgATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGcatcat > 1:793227/1‑141 (MQ=255) gcgATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCatcatc < 1:709118/141‑1 (MQ=255) aTCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCaaa < 1:495623/141‑1 (MQ=255) tCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAg < 1:33053/141‑1 (MQ=255) tCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAg < 2:796612/141‑1 (MQ=255) tCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGAAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAg < 2:570125/141‑1 (MQ=255) aTAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATa > 1:228900/1‑141 (MQ=255) aaGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAAt > 1:590465/1‑141 (MQ=255) gTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGt > 1:211203/1‑141 (MQ=255) tgctCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGa > 2:204262/1‑141 (MQ=255) tgctCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGa < 2:105942/141‑1 (MQ=255) tgctCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGa > 2:531003/1‑141 (MQ=255) tCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCATGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCa > 2:450634/1‑141 (MQ=255) tttAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAg > 1:798666/1‑141 (MQ=255) tttAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGAAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAg > 1:821119/1‑141 (MQ=255) tttAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGAAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAg > 1:820947/1‑141 (MQ=255) ttAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGt < 1:1006513/141‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAg < 2:142122/141‑1 (MQ=255) cTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAg > 2:870270/1‑141 (MQ=255) cTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACAATTTAACGCTTGGTTTATTGCCTCTTTCAAATCAGCATCCTCAAAGATAATGTTTGGATTTTTCCCGCCAAGTTCCAAg > 1:99256/1‑141 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tAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGt < 1:428828/141‑1 (MQ=255) tAATATGCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTACATGGAAATATCCACCATTTAACGCATGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGt < 2:755224/141‑1 (MQ=255) atTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACa > 1:66369/1‑141 (MQ=255) ttCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACat < 2:470883/141‑1 (MQ=255) ttttGTTCCTGCTGAACATACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGTCAATTCAAATTCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACatt < 2:397859/139‑1 (MQ=255) ttGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACattat > 1:564573/1‑141 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cAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTc < 2:243811/141‑1 (MQ=255) aaCTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCat < 1:399564/141‑1 (MQ=255) cTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCataa > 1:41057/1‑141 (MQ=255) ttGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCataat > 1:194627/1‑141 (MQ=255) gACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAatat < 1:780925/141‑1 (MQ=255) gACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATATTTCGAGCCACGTACAAAGGCAATCTTCGTAATATCATTCGCAGCATCTTTCATAatat > 1:98872/1‑141 (MQ=255) aCCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCGAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATg > 1:425175/1‑141 (MQ=255) ccTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGc > 2:631783/1‑141 (MQ=255) cTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCt < 1:228174/141‑1 (MQ=255) cTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCt < 1:215658/141‑1 (MQ=255) cTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAAGTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCt < 1:853793/141‑1 (MQ=255) aTGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCTTAcc < 2:458097/141‑1 (MQ=255) tGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCTTACCa > 1:1052201/1‑141 (MQ=255) | CATTTCAGTATCAGCATCAAAACCATTACCTAATTTGATTTTTTTCACGCGATCAATAAGTGCTTGCTCAAATTTGTCTTTAATACTGTTTTGTACTAATATTCTTGATCCTGCTGAACAAACTTGACCTGCATGGAAATATCCACCATTTAACGCTTGGTCTACTGCCAATTCAAAATCAGCATCATCAAAGATAATGTTTGGATTTTTACCGCCAAGTTCCAAGGCAATATTCGTAACATTATTAGCAGCATTTTTCATAATATGCTTACCA > CP000730/2751920‑2752193 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |