| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 321,451 | A→G | 6.1% | N178D (AAT→GAT) | bsh3 → | C59 family penicillin amidase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 321,451 | 0 | A | G | 6.1% | 279.4 / 7.3 | 99 | N178D (AAT→GAT) | bsh3 | C59 family penicillin amidase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/55); new base G (4/2); total (42/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.97e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.87e-01 | |||||||||||
AATGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGATTTACTTCAAC > CP000730/321313‑321590 | aaTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAACTCATCCAGACTTAAAt < 2:1079244/141‑1 (MQ=255)aaTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAAt > 1:597684/1‑141 (MQ=255)aaTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAAt > 1:289148/1‑141 (MQ=255)aaTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAAt > 1:630230/1‑141 (MQ=255) aTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATTCAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGGGAAGTGGTTATAAAAGATAACCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAGAtt < 2:706443/141‑1 (MQ=255) aTGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAAtt < 2:398092/141‑1 (MQ=255) aTGACATCGGAGAAGTTACGCCATTGCATAATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAAtt < 2:214411/141‑1 (MQ=255) tGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTg > 1:850052/1‑141 (MQ=255) cATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCa > 2:529683/1‑141 (MQ=255) gtcatgTTCCGCCATTGCTATATCATGTTTCCGTTCTAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGCGTATACTGCTTATAAAAGATAATCTTCTTGGTGTCTTAACAAAGCTTCTGGACTTAATTTGGCATtata < 2:402794/136‑1 (MQ=255) gTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATTCAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGGGAAGTGGTTATAAAAGATAACCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAGATTGGCATtata < 2:447146/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATtata < 1:170938/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGAGGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCACtata < 1:1005488/141‑1 (MQ=255) tGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAg > 1:1071414/1‑141 (MQ=255) gAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGt < 1:302432/141‑1 (MQ=255) gAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGt > 2:522109/1‑141 (MQ=255) ttCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAAtt < 1:239453/141‑1 (MQ=255) ttCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAAtt < 2:650593/141‑1 (MQ=255) gCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAg < 1:440907/141‑1 (MQ=255) cATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAatat > 1:841352/1‑141 (MQ=255) aTTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAatata > 1:541446/1‑141 (MQ=255) aTTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAatata < 2:796724/141‑1 (MQ=255) ttATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAatatat > 2:622054/1‑141 (MQ=255) tATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATTCAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGGGAAGTGGTTATAAAAGATAACCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAGATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATc > 1:324399/1‑141 (MQ=255) tATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATc < 1:241958/141‑1 (MQ=255) aTCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCa < 2:133307/141‑1 (MQ=255) tCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCaa < 1:464298/141‑1 (MQ=255) cATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAat > 1:586773/1‑141 (MQ=255) cATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGGCGAAGTTTCAATTC‑ATTAGGGCGTAGTAGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGTCATTATAGTAATTTAAGAGAATATATCaaa > 2:500195/1‑140 (MQ=255) tattCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCGATAtt < 2:337014/139‑1 (MQ=255) gTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGAATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATAtt > 1:1018340/1‑141 (MQ=255) tttCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATAttt < 1:364442/141‑1 (MQ=255) tttCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATAttt < 2:817283/141‑1 (MQ=255) tttCCGAGTCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGCTATAAAAGATAATGCTAGTGGTGTCGTAACAAGTCGTCCAGACTTAAATTTTCATTATAGTAATTGAAGACAATATATCAATAttt < 2:864343/141‑1 (MQ=255) ccGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTtctc < 1:864768/141‑1 (MQ=255) aTGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCtt > 2:707474/1‑141 (MQ=255) tGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTa > 2:656700/1‑141 (MQ=255) gCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTAt < 2:773245/141‑1 (MQ=255) cTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAAGCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcag < 2:423394/141‑1 (MQ=255) tGGACATACAGTCGAAGTTTCAATTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAACCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATAcaga > 2:1064795/1‑140 (MQ=255) gACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaa > 2:544271/1‑141 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc < 1:533233/141‑1 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc < 1:188334/141‑1 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc < 2:228973/141‑1 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc < 2:551644/141‑1 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc > 1:263063/1‑141 (MQ=255) tACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagc < 2:244160/141‑1 (MQ=255) aCAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagca < 1:498209/141‑1 (MQ=255) cAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCcagcaacagcaa > 1:981682/1‑141 (MQ=255) gTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAACAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACCAATCATCCAGACTTCAATTGGCACTATAGTCATCTAAGAAAATATATCAATATTTCTCCTGATCCAGCAACAGCAAAt < 1:158475/141‑1 (MQ=255) gTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAAt > 2:174107/1‑141 (MQ=255) gAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTa < 1:649390/141‑1 (MQ=255) aaGTTTAATTTAGAAGAGGGTGAGGTGGTTATACAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAGTATTTTGCCTTATCCGGCAACAGCAAATTTa < 2:322961/141‑1 (MQ=255) aGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTAtt > 2:86211/1‑141 (MQ=255) ggttCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTCTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACACTATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGAAAAATTATTg > 2:915218/3‑141 (MQ=255) gTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATCGGTGACTTAACAAATCATCAAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATATATTg > 2:359320/1‑141 (MQ=255) aTTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAgg < 2:324880/141‑1 (MQ=255) aTTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAgg < 2:128276/141‑1 (MQ=255) a‑aaGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGCTCTCCTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTa > 1:1062830/1‑141 (MQ=255) aaGAGGGGGAAGTGGTTATAAAAGATAACCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAGATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAAGTTATTGGAAGGTGTaa > 2:825696/1‑141 (MQ=255) agGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGa < 1:328849/141‑1 (MQ=255) agGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGa < 2:204125/141‑1 (MQ=255) agGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGa < 2:817242/141‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGAtt < 2:730995/141‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGAtt < 2:819779/141‑1 (MQ=255) ggTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTATTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGAtt < 2:948928/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTg < 2:904691/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAAAGATTg > 1:454/1‑141 (MQ=255) gTGAAGTGGTTATAAAAGATAAGCCTATTGGTGTCTTAACAAGTCATCCAGACTTGAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCGGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTg < 1:1008019/141‑1 (MQ=255) tGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGa < 1:431074/141‑1 (MQ=255) tataAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAgg > 1:760875/1‑141 (MQ=255) ataAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTCACGATTGAACCTTTAGGc < 2:495300/141‑1 (MQ=255) ataAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGc < 1:975895/141‑1 (MQ=255) aaaaGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCaa < 1:619137/141‑1 (MQ=255) aGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGa < 1:825959/141‑1 (MQ=255) aacccTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAGATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAAGTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCa > 1:995466/4‑141 (MQ=255) ccTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACa > 1:810294/1‑59 (MQ=255) ccTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACa < 2:810294/59‑1 (MQ=255) ccTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGt < 2:586773/141‑1 (MQ=255) aTTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACa > 1:225310/1‑141 (MQ=255) aTTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACa > 1:420157/1‑141 (MQ=255) tGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACAtt < 1:128410/141‑1 (MQ=255) ggTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTCATTTAAGATAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATCGGAAGGTGTAACGATTGAGCCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACAttt < 2:88892/141‑1 (MQ=255) tgtCTTAACAAATCATCCAGACTTAAACTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTGATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGCAGCAGGTACATTTgg > 2:250487/1‑141 (MQ=255) cTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGAtt > 2:416903/1‑141 (MQ=255) ttAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTg > 2:72701/1‑141 (MQ=255) tAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTAAAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGc < 2:355004/141‑1 (MQ=255) aaaaTCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAg < 1:970602/140‑1 (MQ=255) aaTCATCCAGACTTAGATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAAGTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGt > 2:8013/1‑141 (MQ=255) atcatcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATGGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTg > 1:44150/1‑141 (MQ=255) atcatcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAAAATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTg < 1:688548/141‑1 (MQ=255) tcatcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTgg < 1:983042/141‑1 (MQ=255) catcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGa < 2:630230/141‑1 (MQ=255) catcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGa > 2:872050/1‑141 (MQ=255) atcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGAt > 2:1021946/1‑141 (MQ=255) atcCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGAAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGAt > 2:974829/1‑141 (MQ=255) ccAGACTTAAATTCGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGAAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAAACTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGAttt > 2:374041/1‑141 (MQ=255) aGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGATTTAc > 1:706314/1‑141 (MQ=255) cTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGATTTACTTc < 2:316583/141‑1 (MQ=255) aaaTTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGATTTACTTCAAc > 1:143121/1‑141 (MQ=255) | AATGACATCGGTGAAGTTCCGCCATTGCATTATCATGTTTCCGATGCAACTGGACATACAGTCGAAGTTTCATTTA‑AAGAGGGTGAAGTGGTTATAAAAGATAATCCTATTGGTGTCTTAACAAATCATCCAGACTTAAATTGGCATTATAGTAATTTAAGACAATATATCAATATTTCTCCTTATCCAGCAACAGCAAATTTATTGGAAGGTGTAACGATTGAACCTTTAGGCAATGAAGCAGGTACATTTGGATTGCCAGGTGGATTTACTTCAAC > CP000730/321313‑321590 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |