| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 36,087 | 0 | A | G | 61.0% | 124.1 / 204.7 | 201 | C155C (TGT→TGC) | tpn | IS431mec transposase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (43/35); new base G (63/59); total (106/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.65e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.61e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTA > CP000730/35947‑36225 | ttATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAg < 2:138400/141‑1 (MQ=255) ttATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAg < 2:3969/141‑1 (MQ=255) taGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATTACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAgg > 1:155602/1‑141 (MQ=255) agCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGgttt > 1:34208/1‑141 (MQ=255) agCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGgttt > 1:111511/1‑141 (MQ=255) aaTACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGgtttaagttt > 1:45928/1‑141 (MQ=255) aaTACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTTAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGgtttaagttt < 1:119277/141‑1 (MQ=255) aTACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGgtttaagttta > 1:179966/1‑141 (MQ=255) tACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGgtttaagtttaa > 1:212573/1‑141 (MQ=255) tACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGgtttaagtttaa > 1:89958/1‑141 (MQ=255) cactCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTaaaa > 2:143485/4‑141 (MQ=255) ttCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGc < 2:202750/141‑1 (MQ=255) cAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCtt > 1:149545/1‑141 (MQ=255) cAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCtt < 2:192316/141‑1 (MQ=255) aaTACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCttt > 1:128429/1‑141 (MQ=255) aTACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTa < 2:137006/141‑1 (MQ=255) cTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTATTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTACGTTTACAAGCTTTAATTa > 2:133569/1‑141 (MQ=255) ttAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTAttt > 2:75452/1‑141 (MQ=255) aaaGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTa < 2:206169/141‑1 (MQ=255) aaGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTaa > 2:213303/1‑140 (MQ=255) aaGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAg > 2:214858/1‑141 (MQ=255) aTTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCAt > 2:27852/1‑141 (MQ=255) aTTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTAAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCAt > 2:118808/1‑141 (MQ=255) cTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGc < 2:80907/141‑1 (MQ=255) tttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCt < 2:207629/141‑1 (MQ=255) tttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCt > 1:31486/1‑141 (MQ=255) tttGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCt > 2:124637/1‑141 (MQ=255) gccgTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCtgcc < 2:194152/138‑4 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTTATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc > 2:46161/1‑141 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc > 2:150397/1‑141 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc < 2:72181/141‑1 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc < 2:129452/141‑1 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc < 2:42376/141‑1 (MQ=255) gCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc < 2:3190/141‑1 (MQ=255) gCTGTATNGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc < 2:169143/141‑1 (MQ=255) cTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCt > 2:51287/1‑141 (MQ=255) ttGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGtt < 1:35427/141‑1 (MQ=255) ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCCTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGtt > 1:173728/1‑141 (MQ=255) gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGa < 1:93513/141‑1 (MQ=255) ccTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTCAGTTTACAAGCTTTATTTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAgg < 2:77906/140‑1 (MQ=255) aCTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAgg < 1:74076/141‑1 (MQ=255) aCTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAgg < 1:73128/141‑1 (MQ=255) tttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTg > 1:22792/1‑141 (MQ=255) tGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGcc > 1:79653/1‑141 (MQ=255) gATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCt < 1:174622/141‑1 (MQ=255) atatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTg > 2:40603/5‑141 (MQ=255) tACGTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTATCCATTGCTACCTTCGTTGTTGGTGCCTGa > 2:188879/1‑141 (MQ=11) tACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGa > 2:128822/1‑141 (MQ=255) aCCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGAt > 2:159020/1‑141 (MQ=255) ttGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTGGCTGTACGGG‑GGAAGACTGACAAAAGGGGGAGAGCTGTAATTACTTTAACCATTGCTAGCTTCTTTGAAGGTGCCTGATCTg > 1:77935/1‑141 (MQ=2) tGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGt > 2:221374/1‑141 (MQ=255) tttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAAtt < 2:47591/141‑1 (MQ=255) tttcttACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTaact < 2:85787/141‑3 (MQ=255) ttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGa > 1:63994/1‑141 (MQ=255) ttAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGa > 1:28292/1‑141 (MQ=35) atatGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGt < 2:185630/141‑1 (MQ=255) atatGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAggc < 1:126856/141‑2 (MQ=255) gACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAc < 2:164373/141‑1 (MQ=25) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCGGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc > 1:29029/1‑141 (MQ=255) aCGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTAcc > 1:10146/1‑141 (MQ=21) gATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAtt > 2:154619/1‑141 (MQ=12) aTCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTg < 2:67249/141‑1 (MQ=12) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt > 2:221387/1‑141 (MQ=12) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt > 2:152968/1‑141 (MQ=12) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt > 2:40337/1‑141 (MQ=12) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGATACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt > 1:176157/1‑141 (MQ=255) tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGt > 1:194995/1‑141 (MQ=255) cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGtt > 1:209698/1‑141 (MQ=11) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt > 2:62394/1‑141 (MQ=12) ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt < 1:190424/141‑1 (MQ=17) tGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTa > 1:126353/1‑141 (MQ=11) gCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTaa < 2:121219/141‑1 (MQ=12) tCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATg < 2:147888/141‑1 (MQ=17) tCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATg < 2:174289/141‑1 (MQ=17) tCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTGTAAGTTTAATAGCTTTAACCCCTTTCACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATg < 1:21591/141‑1 (MQ=11) cAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATga > 1:218538/1‑141 (MQ=12) aTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATgaga < 2:76820/141‑1 (MQ=12) gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACg > 2:23411/1‑141 (MQ=12) gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACg > 1:200431/1‑141 (MQ=12) aGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt > 2:56415/1‑141 (MQ=11) ggTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt < 2:126984/141‑1 (MQ=11) ttATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg > 2:187809/1‑141 (MQ=12) ttATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGGCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg < 1:48385/141‑1 (MQ=12) ttATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCCGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg < 2:33302/141‑1 (MQ=11) tATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTGTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGa < 1:157832/141‑1 (MQ=11) ttCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATa < 2:19838/141‑1 (MQ=17) tCAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaa > 1:204790/1‑141 (MQ=12) cAGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaaa > 1:75752/1‑141 (MQ=12) cAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaaa > 2:157425/1‑141 (MQ=11) aGATATTTCGATGTACAAT‑GGCAGTCAGGTTTGAGTTTAAAAGCTTTTATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCGGTAATTGCCTTTTGAGGTTTTGCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc < 2:201132/141‑1 (MQ=11) aGATATTTCGATGT‑CATTGGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATaagc < 1:68849/141‑3 (MQ=11) gATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACg > 1:18664/1‑141 (MQ=11) atatTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGc > 1:52595/1‑141 (MQ=11) cGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc < 1:170237/141‑1 (MQ=11) aTGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTg > 1:161468/1‑141 (MQ=11) tGTACAGT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGa > 1:164544/1‑141 (MQ=11) cAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGa < 1:42506/141‑1 (MQ=11) cAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGa > 1:91004/1‑141 (MQ=32) t‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTa > 1:189167/1‑141 (MQ=11) t‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTa < 1:139627/141‑1 (MQ=31) | TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGTGATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAAT‑GACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTA > CP000730/35947‑36225 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |