| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,180 | 0 | C | T | 36.7% | 162.7 / 93.4 | 110 | intergenic (+238/‑896) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/24); new base T (19/19); total (64/46) | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ACTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAGGAGTCTTCTGTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAA > CP000730/76053‑76320 | aCTAATATTGCTGCACCTGTATCAACTAGAAGCACTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGAAAAGTTGCATCTATAGTATAAttt > 2:611076/1‑141 (MQ=255) cTAATATTGCTGCACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTATAGTATAAtttt < 1:638190/141‑1 (MQ=255) tgctgcACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGCATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAACTTCAGGTAATGATAGGTTCTGTTGCAAAGTTGAATCTGTAGTATAATTTGAACgaaa > 1:19293/1‑141 (MQ=255) tgcACCTGTATCACTTAGAACAGCTAACCAAAGTGTTAGTAATCCAGGGAATACTAACACAAAGGCAATTAATTTAATAATTATAGCAAAATATAGGTTCTGTTGCAAAGTGGAATCTATAGTATAATTTTAACAAAAAgg > 1:532232/1‑141 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |