BRESEQ :: Evidence

New junction evidence
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*	?	CP000730	512620 =	63 (1.140)	48 (1.260) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	30/178	NT	52.6%	intergenic (+688/‑173)	recR/rrs1	recombination protein RecR/16S ribosomal RNA
*	?	CP000730	1998278 =	NA (NA)	48 (1.260) +TTATCTTGTCCATTTTATTTTTTAACCAAAATTTGATTAA	30/178	NT	52.6%	intergenic (‑6/+5)	USA300HOU_t0050/rrf4	tRNA‑Val/5S ribosomal RNA

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GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

tcacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaa                                                                                                                                             <  2:364963‑M1/1‑1 (MQ=255)

gggCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTa                                                                                                                                             >  2:619730/1‑140 (MQ=255)

 cacacctgttcccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaaa                                                                                                                                            >  1:630620‑M1/139‑140 (MQ=255)

  gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaa                                                                                                                                           >  1:362037/1‑140 (MQ=255)

  gCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaa                                                                                                                                           >  1:59025/1‑140 (MQ=255)

   cGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAAGAACTTGAATTACAAACGAAAATTAATATTaaaa                                                                                                                                          >  1:110740/1‑140 (MQ=255)

    gTTCATTACGGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  2:611713/140‑1 (MQ=255)

    gTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCTTTTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTaaaaa                                                                                                                                         <  1:324261/140‑1 (MQ=255)

       cAGTACAGATGACAAAGGTTTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGtt                                                                                                                                      <  1:162669/140‑1 (MQ=255)

         ttcccaggcagaacacagaagtgaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgatgccaggcagttttttaatcaaatttgggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTAt                                                                                                                                    >  2:25465‑M1/131‑140 (MQ=255)

           cccatgccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttgggtaaaaaataaaatggccaagataaAAAAAgttactg                                                                                                                                  <  2:495133‑M1/12‑4 (MQ=255)

             catgccgagcacggaagttaagcgccttagcggcgatggtagtcgaacttacgttccgccagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGAc                                                                                                                                >  2:477837‑M1/127‑140 (MQ=255)

                 ccgaacacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTaa                                                                                                                            <  1:518096‑M1/18‑1 (MQ=255)

                    aaaGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGCAAATTAATTTTCAAAAGTTATTGACTTAAATg                                                                                                                         >  2:323238/1‑140 (MQ=255)

                     acacagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  1:172774‑M1/119‑140 (MQ=255)

                     acacagaagttaacctccttagcgtctatagtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaagtttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGt                                                                                                                        >  2:277776‑M1/119‑140 (MQ=255)

                      aGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGtt                                                                                                                       >  1:168224/1‑140 (MQ=255)

                       ggTTTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCCGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAATAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAATGTTATTGACTTAAATGTta                                                                                                                      <  1:433737/140‑1 (MQ=255)

                        cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAtgttga                                                                                                                     >  1:15446‑M1/116‑138 (MQ=255)

                        cagaagttaagctccttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtaaaacgttgccaggcagttttttaatcaaaataaggtaaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAtgttga                                                                                                                     >  2:661150‑M1/116‑138 (MQ=255)

                              tttttACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAAt                                                                                                               >  1:621822/1‑140 (MQ=255)

                                      gttgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGCATTACTAAAGAAAATTAATTCATAAAATTTATTGAATTAAATGTTAATAAAATGTAtaatt                                                                                                       >  2:233924/1‑140 (MQ=255)

                                      gttattAAGCAGTTTGAAAACCTGTATACTACATATGAGTTGAGGAAAAAAACACAATGCAACGTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAAGTAATTTTAAAAATTTATTGACTTCAATGTTAATAAAATAGAtaatt                                                                                                       >  2:140827/1‑140 (MQ=255)

                                      cttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatt                                                                                                       >  1:640451‑M1/102‑140 (MQ=255)

                                      cttagcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaaaaaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaatt                                                                                                       <  1:291663‑M1/39‑1 (MQ=255)

                                        tgttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCACATTCCAAAAAAACTTGAATTACTATCGACGTCCAATTGAAAAAAGTTATTGAATGTATAATTAATAAAATGTAtaattaa                                                                                                     >  1:650661/1‑140 (MQ=255)

                                         agcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                    <  2:548103‑M1/42‑1 (MQ=255)

                                         agcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcaattttttaataaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTAtaattaat                                                                                                    <  1:195366‑M1/42‑1 (MQ=255)

                                          ttAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATaattaatt                                                                                                   <  1:351198/140‑1 (MQ=255)

                                          gcgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGATGAAAAAATGTATaattaatt                                                                                                   <  2:159140‑M1/43‑1 (MQ=255)

                                           cgtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTc                                                                                                  <  1:271463‑M1/44‑1 (MQ=255)

                                            gtcgatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaaaaaaatggacaagatcaAAAAAGTTATTAACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  1:123347‑M1/45‑1 (MQ=255)

                                            aaGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCt                                                                                                 <  1:374279/140‑1 (MQ=255)

                                               gatggtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaatcaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGt                                                                                              <  2:481927‑M1/48‑1 (MQ=255)

                                                   gtagtcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTCTTGAAATAAATGATGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:450810‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                   gtagtcgaacttacgatccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTAATTGACCTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGt                                                                                          <  1:493585‑M1/52‑1 (MQ=255)

                                                     gAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTaa                                                                                        <  2:652425/140‑1 (MQ=255)

                                                      aaaGCCTGTATAGTATTTTTTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTTTTGTCGGTAAg                                                                                       <  2:264003/140‑1 (MQ=255)

                                                      aaaGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAg                                                                                       >  2:391759/1‑140 (MQ=255)

                                                       tcgaacttacgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGa                                                                                      >  1:459225‑M1/85‑140 (MQ=255)

                                                        aGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGaa                                                                                     >  2:217821/1‑140 (MQ=255)

                                                               ataGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAGCGACAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGTAAAATGaa                                                                              >  2:181191/1‑140 (MQ=255)

                                                               acgttccgctagaggagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGaa                                                                              >  1:565712‑M1/77‑140 (MQ=255)

                                                                taGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             >  2:205230/1‑140 (MQ=255)

                                                                cgttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaagataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAAc                                                                             <  2:449896‑M1/65‑1 (MQ=255)

                                                                 gttccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACa                                                                            <  1:556153‑M1/66‑1 (MQ=255)

                                                                  ttccgctagagtagaacgttgccgggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACAt                                                                           >  2:535453‑M1/74‑140 (MQ=255)

                                                                    ccgctagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTg                                                                         >  1:11575‑M1/72‑140 (MQ=255)

                                                                       tatttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaa                                                                      <  2:567844/140‑1 (MQ=255)

                                                                        tagagtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGaaaa                                                                     >  1:470853‑M1/68‑140 (MQ=255)

                                                                         tttGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTACATGTTAATAAAAGGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAAc                                                                    <  2:572491/140‑1 (MQ=255)

                                                                          ttgctgAAGCAAAGAAAACAATTCAATGTAAAAAATAACTTTAATTATCAACAAAAATTTTTTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAAGAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACt                                                                   <  1:585774/140‑1 (MQ=255)

                                                                           agtagaacgttgccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTg                                                                  <  2:204596‑M1/76‑1 (MQ=255)

                                                                            tttgAGGAAACCAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa                                                                 >  2:475634/2‑140 (MQ=255)

                                                                            gttgAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTAGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGa                                                                 >  2:438184/1‑140 (MQ=255)

                                                                                aGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGa                                                             >  2:95313/1‑140 (MQ=255)

                                                                                 gtcaaacaaaACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGAc                                                            <  1:558523/138‑1 (MQ=255)

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                                                                                    ttgctaggtagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAAGTTTTATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAat                                                         >  2:220478‑M1/56‑140 (MQ=255)

                                                                                      gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat                                                       <  1:632628‑M1/87‑1 (MQ=255)

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                                                                                      gccaggcagttttttaatcaaattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATGGACTTAAATGTTGATAAAATGTAGAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAatat                                                       <  2:66254‑M1/87‑1 (MQ=255)

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                                                                                                  atacaacaaatttaggttaaaaaataaaatgaaaaagaaaaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTAAACCACAATATGTCAACGTTAAt                                           >  2:642614‑M1/42‑140 (MQ=255)

                                                                                                     ttAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTcc                                        <  2:566754/140‑1 (MQ=255)

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                                                                                                       aaGAAATAACTTGAATTAATAACTAAAATTAATTTTAAAAAGTTTTTGAATTAAAAGTTAATTAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaa                                      <  1:288697/140‑1 (MQ=38)

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                                                                                                         gAAATAACTTGAATTAGTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaa                                    >  1:331128/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                          aattttggttaaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAACTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCaaaaa                                   <  2:495307‑M1/107‑1 (MQ=255)

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                                                                                                                   taaaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACta                          >  1:202741‑M1/25‑140 (MQ=255)

                                                                                                                     aaaaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                        >  1:111889‑M1/23‑140 (MQ=255)

                                                                                                                     aTTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACtata                        <  1:302624/140‑1 (MQ=255)

                                                                                                                       aaataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAg                      >  2:518096‑M1/21‑140 (MQ=255)

                                                                                                                        aataaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGt                     >  1:548103‑M1/20‑140 (MQ=255)

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                                                                                                                           aaaatggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATTATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTAc                  >  1:105427‑M1/17‑140 (MQ=255)

                                                                                                                             aatggaaaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaa                >  2:579506‑M1/15‑140 (MQ=255)

                                                                                                                              atggaaaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACaaa               >  1:143649‑M1/14‑140 (MQ=255)

                                                                                                                               aaaaTTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAAc              >  2:550715/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                ggacaagataaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATACATGACGGAAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACa             <  1:206370‑M1/129‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                        taaAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTGATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAg     >  1:192283‑M1/4‑140 (MQ=255)

GGGCGTTCAGTACAGATGACAAAGGTGTAATTTTTACTGTTGTTAAGCAGTTTGAAAGCCTGTATAGTATTTATTTGTTGAGGCAAACAAAACAACTCAACTTAAGAAATAACTTGAATTACTAACGAAAATTAATTTTAAAAAGTTATTGACTTAAATGTTAATAAAATGTATAATTAATTCTTGTCGGTAAGAAAAATGAACATTGAAAACTGAATGACAATATGTCAACGTTAATTCCAAAAAACGTAACTATAAGTTACAAACATTATTTAGTAT  >  CP000730/512481‑512759

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 13 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.