BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	CP000730	36,087	A→G	68.6%	C155C (TGT→TGC)	USA300HOU_0026 ←	IS431mec transposase

Read alignment evidence...
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*	CP000730	36,087	0	A	G	68.6%	741.5 / inf	700	C155C (TGT→TGC)	USA300HOU_0026	IS431mec transposase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (116/104); new base G (251/224); total (369/331)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.98e-01

Only 100 of 702 total aligned reads displayed.

TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTA  >  CP000730/35947‑36225

     atataGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTc                                                                                                                                       >  2:248883/1‑141 (MQ=255)

      tataGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCa                                                                                                                                      >  2:183741/1‑141 (MQ=255)

      tataGAGCGTAAATACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTTATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCATTCa                                                                                                                                      >  1:173981/1‑141 (MQ=255)

           agCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgttt                                                                                                                                 >  1:219628/1‑141 (MQ=255)

              gTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgtttaag                                                                                                                              <  1:339037/141‑1 (MQ=255)

                aaaTACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTACTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgtttcagtt                                                                                                                            <  2:241662/141‑1 (MQ=255)

                 aaTACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGCTCCTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgtttaagttt                                                                                                                           <  1:225617/141‑1 (MQ=255)

                  aTACATTCAATACCTTTTAAATTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTTATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGgtttaagttta                                                                                                                          <  2:101272/141‑1 (MQ=255)

                  aTACACTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGgtttaagttta                                                                                                                          >  1:35596/1‑141 (MQ=255)

                             cccTTTTAAGGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAAt                                                                                                               <  2:372421/140‑1 (MQ=255)

                              ccTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTTATTCCTTGGTTTTCTTATTTGAATATGACGCT‑GATCTTCCTCAATGAGCTGATTCAGATATTTCGATGTACAAGGGCAGTCAGGTTTAAGTTGAAAAGCTTTAAtt                                                                                                              <  2:192428/141‑1 (MQ=11)

                              ccTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAAtt                                                                                                              <  2:283442/141‑1 (MQ=255)

                               cTTTTAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGAACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAATGCTTTAATTa                                                                                                             >  1:105968/1‑141 (MQ=255)

                                ttttAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCCGATATTTCGATTTACACTGACAGTCAGGTTTAAGTTTGAAATGTTTAATTat                                                                                                            >  1:47636/1‑140 (MQ=14)

                                  ttAAAGTATTCTTTGCCGTATTGATACTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTattt                                                                                                          <  1:273089/141‑4 (MQ=255)

                                    aaaGTATTCTTTGCTGGATGGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTa                                                                                                        <  1:84790/141‑1 (MQ=255)

                                      aGTTTTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGc                                                                                                      <  2:203875/141‑1 (MQ=255)

                                      aGTATTCTTTGCTGTATTGATAATTTGATACCTTGTCTTTCTTCATTTAATATGACGGT‑TATCTTGCTCAATGAGGTTATTCATATATTTCTATTGACAATGGTAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTaac                                                                                                      <  2:132574/141‑3 (MQ=11)

                                            cTTTGGCGTATTGATACTTTGATATCTTGGTTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GTTCTTGCTTAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGc                                                                                                <  1:130041/141‑1 (MQ=14)

                                             tttGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCt                                                                                               >  1:202503/1‑141 (MQ=40)

                                                gCTTTATTGATACGTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTAcc                                                                                            <  2:810/141‑1 (MQ=255)

                                                 cTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCt                                                                                           <  2:30937/141‑1 (MQ=255)

                                                  tGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCtt                                                                                          >  2:303786/1‑141 (MQ=255)

                                                  tGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGATCACTCAGGGTTTGCAGATAGTGCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAATAGATTTAATTACTTTAACCATTGCTACCtt                                                                                          >  2:63327/1‑141 (MQ=14)

                                                   gTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTc                                                                                         >  1:143180/1‑141 (MQ=255)

                                                    tATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCg                                                                                        <  1:149196/141‑1 (MQ=255)

                                                     aTTGATATTTTGATCTCTTGTCTTTCTTACTTTAATATG‑CGCTCTATTTAACTCAATGGTCTTATTCAGATATTATGATGTAAAATGCTAGTCAAGTTTTATTTTAACAGCATTACATAATTTAGCCATTACTACCTTCga                                                                                       <  2:138743/141‑2 (MQ=255)

                                                      ttGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGCACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGtt                                                                                      <  2:343239/141‑1 (MQ=255)

                                                      ttGATACTTTGAGATCATGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GAACTGGCTAAATAAGGTTATGCAGATATATCGATGGAGAATGACAGGCAGGATGATGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCAGCCTTCGtt                                                                                      >  2:158315/1‑141 (MQ=255)

                                                        gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGa                                                                                    >  2:356328/1‑141 (MQ=255)

                                                        gATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGa                                                                                    >  1:124709/1‑141 (MQ=255)

                                                          tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                  >  2:149755/1‑141 (MQ=255)

                                                          tACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAg                                                                                  >  2:21375/1‑141 (MQ=255)

                                                           aCTTTTATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTCAACCGGTTGCTACCTTCGTTGAAgg                                                                                 <  2:382379/141‑1 (MQ=14)

                                                           aCTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAgg                                                                                 <  1:365260/141‑1 (MQ=255)

                                                            cTTTGATATCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGt                                                                                >  2:362424/1‑141 (MQ=255)

                                                             tttGATATCTTGTCTTTCTTACTTCAATAGGACGGT‑GATCTTGCCAACCGACAGTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTg                                                                               <  1:186782/141‑1 (MQ=11)

                                                             tttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTg                                                                               >  2:120836/1‑141 (MQ=255)

                                                              ttGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGc                                                                              <  2:323950/141‑1 (MQ=255)

                                                                 atatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTg                                                                           >  1:231003/5‑141 (MQ=255)

                                                                 atatcTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTg                                                                           >  1:212375/5‑141 (MQ=255)

                                                                 aTACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTg                                                                           >  1:170699/1‑141 (MQ=255)

                                                                 aTACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTg                                                                           >  2:5919/1‑141 (MQ=255)

                                                                    ccTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATc                                                                        <  1:328255/141‑1 (MQ=255)

                                                                     cTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCt                                                                       <  2:226577/141‑1 (MQ=255)

                                                                       tggctttcttACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGt                                                                     <  1:324105/138‑1 (MQ=255)

                                                                       tGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTGCAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGt                                                                     <  1:266602/141‑1 (MQ=255)

                                                                       tGTCTCTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGt                                                                     <  1:195259/141‑1 (MQ=255)

                                                                               ttACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGCTATTTAGATGTACATTGGCAGTCTGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTATCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGTCTGATCTGTATTTATCt                                                             >  2:258232/1‑141 (MQ=14)

                                                                               ttACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTGCTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCt                                                             >  1:73470/1‑141 (MQ=255)

                                                                                   tttAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTGTGGTGAAAAGCTTTAAGTACGTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTg                                                         <  1:289090/141‑1 (MQ=11)

                                                                                        tatGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAggct                                                    >  1:62446/1‑139 (MQ=255)

                                                                                        tatGACGGT‑GATCGTGCTCAATGAAGTTATTCAGATATTTCGATGTAAAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAggct                                                    <  2:72941/141‑3 (MQ=11)

                                                                                         atGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGAAATCTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATCGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGttt                                                   <  1:375147/141‑1 (MQ=11)

                                                                                         aggACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGttt                                                   <  1:41543/139‑1 (MQ=255)

                                                                                          tGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGAGGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTACTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTa                                                  >  2:115522/1‑141 (MQ=11)

                                                                                            aCGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTAcc                                                >  1:318938/1‑141 (MQ=255)

                                                                                              ggT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCaa                                              <  2:38620/141‑1 (MQ=11)

                                                                                              ggT‑GATCTTGCCCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCaa                                              <  1:160996/141‑1 (MQ=16)

                                                                                               gT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCaat                                             >  1:67579/1‑140 (MQ=12)

                                                                                                t‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAt                                            >  1:383931/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                t‑GATCTTGCTCAATGAGGTTAGTCATATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAAt                                            >  2:281298/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                  gATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAAtt                                           >  1:118667/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                   agcTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTg                                          >  2:200002/3‑141 (MQ=11)

                                                                                                    tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt                                         >  2:274036/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                    tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGt                                         >  2:330382/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                    tCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGt                                         >  1:282387/1‑141 (MQ=11)

                                                                                                     cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTACCTTATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGtt                                        >  1:304893/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                     cTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTTAGGTTTACCAAATTGtt                                        >  1:350123/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                      ttGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGttt                                       >  1:101446/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                        gCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTaa                                     <  1:332565/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                        gCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTaa                                     >  2:40599/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                          tCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATg                                   <  1:93811/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                           cAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTACTTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATga                                  <  2:176999/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                            aaTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATgag                                 <  2:333547/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                            aaTGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATgag                                 <  2:298027/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                               gAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACg                              <  2:163330/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                aGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTCCCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt                             >  1:89725/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                aGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGt                             <  1:77736/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                 ggTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGtt                            >  1:247633/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                  ggtttttagagATTTCGTTGTACAATGGCATGCAGGTTTAAGTGTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGAAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                           <  1:112245/134‑1 (MQ=11)

                                                                                                                  gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                           <  2:263279/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                  gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                           <  1:393218/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                  gTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGttt                           <  2:109176/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                   ttATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg                          <  1:5919/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                   ttATTCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTAAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTg                          >  1:138467/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                      ttCAGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTCAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTACCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATa                       >  2:90366/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                         aGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAAc                    >  1:315601/1‑141 (MQ=12)

                                                                                                                         aGATATTTCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTCTTTAATGAGACGTTTGATAAAc                    <  2:289010/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                                            tatTTCGATGTACAATGGTAGTCATGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCa                 <  2:34815/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                            tatTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAACTTGTTTAATGAGACGTTTGATGAACGCa                 >  1:157947/1‑141 (MQ=11)

                                                                                                                                tCGATGTACCATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATg             <  1:238377/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                                                tCGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTTCCAAATTGTTTAATGAGACGTTTAATAAACGCATATg             >  2:316878/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                                                 cGATGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTCATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGc            <  1:310558/141‑1 (MQ=12)

                                                                                                                                  gATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTGATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCt           >  1:255306/1‑141 (MQ=11)

                                                                                                                                  gATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCt           <  2:141450/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                                    tGTACAATGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGa         >  1:298276/1‑141 (MQ=17)

                                                                                                                                       aCAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTATTTTAGCCATTGCTGCCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAACTACCTTTTGAGGCTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATg      <  2:124070/141‑1 (MQ=11)

                                                                                                                                         aaTGGCAGTCAGTTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGAt    <  2:52803/141‑1 (MQ=9)

                                                                                                                                         aaTGGCAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAACCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGAt    >  1:181174/1‑141 (MQ=14)

TTTTTATATAGAGCGTAAATACATTCAATACCTTTTAAAGTATTCTTTGCTGTATTGATACTTTGATACCTTGTCTTTCTTACTTTAATATGACGGT‑GATCTTGCTCAATGAGGTTATTCAGATATTTCGATGTACAATGACAGTCAGGTTTAAGTTTAAAAGCTTTAATTACTTTAGCCATTGCTACCTTCGTTGAAGGTGCCTGATCTGTAATTACCTTTTGAGGTTTACCAAATTGTTTAATGAGACGTTTGATAAACGCATATGCTGAATGATTA  >  CP000730/35947‑36225

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 22 ≤` `ATCG/ATCG` `< 32 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`