| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 4,449 | C→A | 6.2% | Q171K (CAA→AAA) | recF → | recombination protein RecF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 4,449 | 0 | C | A | 6.2% | 362.4 / 2.3 | 130 | Q171K (CAA→AAA) | recF | recombination protein RecF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (63/56); new base A (3/7); total (67/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.00e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
AAAAGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGA > CP000730/4310‑4588 | aaaaGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCa > 1:617501/1‑141 (MQ=255)aaaaGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCa > 1:144555/1‑141 (MQ=255) aaaGGCTCTCCTCAAATACGACAACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCaa < 1:712817/141‑1 (MQ=255) aGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCaaaa < 2:717797/141‑1 (MQ=255) tcctcAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGa > 1:1012497/1‑141 (MQ=255) cctcAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGAc > 1:403407/1‑141 (MQ=255) cctcAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGAc > 1:1054547/1‑141 (MQ=255) cctcAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAATTACAATTAGGCCAAAAAAAGGAc > 1:1023526/1‑141 (MQ=255) ctcAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAGAAAGGACt > 2:725486/1‑141 (MQ=255) cAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTa > 1:323047/1‑141 (MQ=255) aaTAAGACGACGCTTTATAGATATGGTGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTaaa > 2:657872/1‑140 (MQ=255) aGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATg < 1:534354/141‑1 (MQ=255) gacgacGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGt > 1:1004005/1‑141 (MQ=255) cacgacgCTTTATAGATATGGAGTTGCGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGt < 1:516672/140‑1 (MQ=255) acgacgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTaaacatgat > 2:898191/1‑134 (MQ=255) acgacgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGtt > 2:457624/1‑141 (MQ=255) acgacgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAACCACGATTATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGtt > 1:1040718/1‑141 (MQ=255) gacgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTgg < 1:651332/141‑1 (MQ=255) gacgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTgg < 1:677415/141‑1 (MQ=255) cgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGaa > 1:533701/1‑141 (MQ=255) cgCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGaa < 1:585194/141‑1 (MQ=255) cTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTCGATCAATACCAACGAATTTTAAACAAAAAAAATAATAACTTCATGTAGTTACGATGATGCCAAAAAAAGGACTTAAGAATGTTTTAAGt < 2:469914/141‑1 (MQ=255) cTTTATAGATATGGACTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGt > 1:789204/1‑141 (MQ=255) cttATAGATAAGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTCTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTa < 1:340597/140‑1 (MQ=255) taGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCGAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTaa > 2:245109/1‑141 (MQ=255) aGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTaaa < 1:51614/141‑1 (MQ=255) aGATATGGAGTTGGGCAACATTTTGGCGGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAAAGTAGGAAGTATTaaa > 1:515176/1‑141 (MQ=255) acggagtatgcccAAATCTTTGCTGTTTACTTAATGGATTGAGGACAAAACCAACGTATTTTAAAGCAAAATAATAATTACTTAAAGCAGTTAACAGTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcag < 2:655566/130‑1 (MQ=255) tgaaGTTGGTCCAAATTTCTTCTGTTTACTGCAAAGATTTAGCTCAATACCCACGAATTTTAAAGCAAAAGAATAATTCCTTAAAGCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagc < 2:616948/138‑1 (MQ=255) tGGAGTTGGGCCAAATTTTTGATGTTTACTTAAAAGACTTAGCTCAATACCAACGTAATTTAAAGCAAAAGAATAAGTACTTAAAGCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagc < 2:300087/141‑1 (MQ=255) tGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagc < 2:945670/141‑1 (MQ=255) tGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagc > 1:478200/1‑141 (MQ=255) tGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAAGGTTGGAAGTATTAAATcagc > 1:577900/1‑141 (MQ=255) gggAGTGGGGCCAAGTTTCTGCTGTTTACTTAAATGATGAAGCTCAATACCAAGGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTAAAATTAGGACAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagc < 2:481019/140‑1 (MQ=255) ggAATTAGGCCAAATTTCTGCTGATTACTTAAAAGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagca < 2:916888/141‑1 (MQ=255) gAGTTGGGCTAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagcag < 1:263085/141‑1 (MQ=255) gAGTTGGCCCAAATTTCTGCTGTTAAATTAAATAATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATcagcag < 2:362069/141‑1 (MQ=255) ggTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCC‑AAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGtt < 2:132244/140‑1 (MQ=255) aGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGt < 1:367448/141‑1 (MQ=255) aGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGt < 2:429726/141‑1 (MQ=255) gTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGtt < 1:689368/141‑1 (MQ=255) gTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGtt < 1:129429/141‑1 (MQ=255) gggCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCGGTTACCATTAGGCCAAAACAAGGACTTAACAGCGTTGGCAGTATTAAGTGAGCAGTTTGc > 1:161467/1‑141 (MQ=255) gCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTg > 1:399665/1‑141 (MQ=255) tCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCa > 1:279217/1‑141 (MQ=255) tCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCa > 1:959880/1‑141 (MQ=255) ctgctgTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTCCAATTAGGCAAACAAAAGGACTTAACAATGTTGAAAGTATTAAATGAGCAGTTTTCTGAATTTGCaa > 1:402644/1‑141 (MQ=255) tgctgTTTACTTAAATGATTCAGCTCAATACCAACGTATTTTAATGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAGAGAAGGACTTAACAATGTTGGCAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAAt > 2:581655/1‑141 (MQ=255) ggtgtgTACTTAAATGACTTAGCTCAAGACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATg < 2:893125/139‑1 (MQ=255) gctgTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCACTg > 1:232289/1‑141 (MQ=255) ctgTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGAAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTAAAAATAGGCAAAAGAAAGGAATTAACAATCTTGGAAGTATGAAATCAGCAGATTGCTGAATATGCAATGa > 2:615863/1‑141 (MQ=255) cTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTaaa > 2:629323/1‑140 (MQ=255) cTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAAc > 1:276803/1‑141 (MQ=255) tttAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACg > 1:621397/1‑141 (MQ=255) ttAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCACAAGCATTTTTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGt > 1:672550/1‑141 (MQ=255) tAGCTCCATACCAACGTATGTTAAAGCAAAAGAATGATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTg < 2:1016346/141‑1 (MQ=255) aGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCGGCAGTTTGATGAATATACAATGAAATTAAATGATAAACGTGc > 2:205866/1‑141 (MQ=255) aGCTCAATACCAACGTAATTTAAAGAAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTAGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGc < 2:691982/141‑1 (MQ=255) gCTCAATACCAACGTATTTTACAGCAAAAGAATAATTACTTAACGCAGTTACAATTAGGACAAAAAAAGGACTTAACAATGTGGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGATGAATATGCAATGAAAGTAACTGCAAAACgggaa > 2:123714/1‑137 (MQ=255) cTCAATAACAACTTTATTTAAAGCAAAAGAATAATTACGTAAAGCAGTTAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGcac < 2:602281/141‑1 (MQ=255) cAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCCCAt > 1:301509/1‑141 (MQ=255) cAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAACAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACTTGCACAt > 1:726960/1‑141 (MQ=255) caaaCGTGTTTTAAAGCAAAAAAATAAGTACTTAAAGCAGTTACAATTAAGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTAt < 2:176673/139‑1 (MQ=255) cAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTAtt < 2:689207/141‑1 (MQ=255) cAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGACCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTAtt > 2:748947/1‑141 (MQ=255) cGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCaa > 2:512160/1‑141 (MQ=255) tATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGGTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAaga < 2:975940/141‑1 (MQ=255) aTTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAagag < 2:1004005/141‑1 (MQ=255) ttttAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGc < 2:415571/141‑1 (MQ=255) ttAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGGCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTa < 1:457624/141‑1 (MQ=255) tAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTag > 1:1007976/1‑141 (MQ=255) tAAAGCAAAAGAATAATTAATTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTag > 1:563863/1‑141 (MQ=255) aaaGCAAAAGAATAAATACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACTTGCACATTTTATTCAAGAGCTaga < 2:66343/141‑1 (MQ=255) aaGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTAAACTTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTagag > 2:212477/1‑141 (MQ=255) aggaaaaGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGTCAAAAAATGGACTTAACAATGTTTGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGt < 2:59733/138‑1 (MQ=255) caaaGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAAGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAGATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAAATGATAAACGTGCACCTTTTATTCAAGTGTTagcgcgct > 2:262488/2‑135 (MQ=255) aaaGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGtt > 1:116356/1‑141 (MQ=255) aGAATCATTACTTAAAGCAGTTAAAATTAGGCAAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGGATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATTCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAg < 2:26640/141‑1 (MQ=255) taatTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAACGAATGCTACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTaa > 1:1038214/1‑141 (MQ=255) aaaatACTTACAGCAGTTACAATTAAGACAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATGAAATCAGCAGTTTGCTGAATATCCAACGAAAGAAACTGATAAACGTCCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTaa < 1:836853/137‑1 (MQ=255) aatTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTaaa > 1:426139/1‑141 (MQ=255) atTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATACAATGAAAATAACTGATAAACGTGAACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAAc > 2:114304/1‑141 (MQ=255) ttACTTAAAGCTGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGACAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAGGAGCGATTTTCGTTAGCTAAAcc < 2:1025378/141‑1 (MQ=255) ttACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAAcc < 1:949265/141‑1 (MQ=255) aCTTAGAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGa < 1:638246/141‑1 (MQ=255) aaaGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGGCGTTAGCTAAACCGATTCa > 1:1031708/1‑141 (MQ=255) aaGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCAt < 2:403407/141‑1 (MQ=255) gCAGTTACAATTAGGTCAAAAAAAGTACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTATACCGATTCATGc < 2:129660/141‑1 (MQ=255) gCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAACCCGATTCATGc > 2:626385/1‑141 (MQ=255) ttACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGt > 1:893296/1‑141 (MQ=255) aCAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTAt > 2:770348/1‑141 (MQ=255) cAATTAGGCCAAAAAATGGCCTTAAGAATGTTGGAAGTATGAAAGCAGGAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACTTGAACTTTTTATTAAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTAta < 2:29438/141‑2 (MQ=255) aaTTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATca < 2:734713/141‑1 (MQ=255) aaTTAGGACAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATca < 2:226485/141‑1 (MQ=255) aTTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATcac < 2:143820/141‑1 (MQ=255) ggCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTGTTCAAGAGCTAGGGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAAt > 1:302544/1‑141 (MQ=255) agCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATGCATGCTGGTATCACAAAt < 2:553469/140‑1 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAGGAGCTAGAGGCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:291344/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGCTTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:813167/1‑141 (MQ=255) ccAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGa > 1:535388/1‑141 (MQ=255) | AAAAGGCTCTCCTCAAATAAGACGACGCTTTATAGATATGGAGTTGGGCCAAATTTCTGCTGTTTACTTAAATGATTTAGCTCAATACCAACGTATTTTAAAGCAAAAGAATAATTACTTAAAGCAGTTACAATTAGGCCAAAAAAAGGACTTAACAATGTTGGAAGTATTAAATCAGCAGTTTGCTGAATATGCAATGAAAGTAACTGATAAACGTGCACATTTTATTCAAGAGCTAGAGTCGTTAGCTAAACCGATTCATGCTGGTATCACAAATGA > CP000730/4310‑4588 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |