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| * | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 49.9% | 23.8 / inf | 509 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 512 total aligned reads displayed.
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aGATATGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATaaaaaagct > 1:425542/1‑137 (MQ=11) gATCTGCATTGAGCTATCCTGCTATATCTTAAATATTAAGAGCACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATaaaaaagctt < 1:219792/141‑6 (MQ=11) tatGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAt‑t < 2:894517/141‑1 (MQ=40) tacgCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAt‑t < 1:233734/138‑1 (MQ=255) aTCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCAAAAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTa > 2:850658/1‑141 (MQ=1) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 1:868053/1‑141 (MQ=39) gAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAg < 1:60448/141‑1 (MQ=40) cGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGaa < 2:1029571/141‑1 (MQ=40) gtggtgTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGACCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCATATTGATGAGACTTACATCACAATAAATGGaaa > 1:31362/1‑141 (MQ=14) gtgtAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATg < 1:1050366/141‑1 (MQ=40) tgtAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATTAGTTTTCGAACAAAAAGC‑ATAAAGCCGTAATCTGCAAGTTACGTCTTGATGACACCTACATCAAAATAAAACGAAAATg > 1:1037368/1‑141 (MQ=2) | GTATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGC‑ATAAAAAGCTAAT‑TACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCATT > CP000730/76213‑76492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |