BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	freq	annotation	gene	description
RA	CP000730	2,211,273	A→G	9.0%	M1T (ATG→ACG) †	USA300HOU_2086 ←	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	CP000730	2,211,273	0	A	G	9.0%	253.0 / 3.3	119	M1T (ATG→ACG) †	USA300HOU_2086	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (44/55); new base G (14/3); total (59/60)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.18e-03
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00

Only 100 of 121 total aligned reads displayed.

TGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGTTTGGTGTTGATG  >  CP000730/2211133‑2211413

tGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCCTTGCGGTGTTGTAGTGGTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCa                                                                                                                                              <  1:993410/141‑1 (MQ=255)

 gatgtcACGGTGCGTTGTGGTGTAGGGCTGTGGTGTGGCCTTGTGGTGTTATTGTGTTGTAGACGGGTTTGGCGGTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCAt                                                                                                                                             <  2:1021864/136‑1 (MQ=14)

   gaCCCCGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTCCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTg                                                                                                                                           <  1:120887/140‑1 (MQ=255)

      cACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTATTATCAACAGGTTTGGCGGTGTGGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGCCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCgt                                                                                                                                        >  1:508548/1‑140 (MQ=14)

       aCGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggt                                                                                                                                       <  1:342797/141‑1 (MQ=255)

       aCGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggt                                                                                                                                       <  1:230448/141‑1 (MQ=255)

        cGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGGTGCGACTTGAGGTAGTGCTGTGATGTGGCGTTGCggag                                                                                                                                      >  2:813366/1‑139 (MQ=11)

         gATGCGTCTTGATGTCGTGCTATGATGTGGCCTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgt                                                                                                                                     <  1:1024200/141‑1 (MQ=255)

          aTGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCggtgtt                                                                                                                                    >  1:713556/1‑141 (MQ=255)

          aTGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTACTGAAAGGTTTGTGGTCGACCACCTAGAACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTCTTGTCGTGCTATGGTGAGGCATTGCggtgtt                                                                                                                                    >  1:775804/1‑141 (MQ=9)

           tGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGGTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgtta                                                                                                                                   <  1:311315/141‑1 (MQ=255)

              gtggtgggggaGTGCTCTGTGGTGGCATTGGGGTGTTATGGTGTTGTAGTGGGGGTTGGGGTCGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatgg                                                                                                                                <  2:411786/131‑1 (MQ=14)

              gTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatgg                                                                                                                                >  1:918163/1‑141 (MQ=255)

                 tttaTGTAGGGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgt                                                                                                                             <  1:164806/138‑1 (MQ=255)

                 ttGGTGTGGGGCTATGGTGTGGCATTGTGGTGTTATGGTGTTGTAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgt                                                                                                                             <  2:282234/141‑1 (MQ=17)

                 ttGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTCTGGTGTTATAGACAGGTTTGGTGTTGATGCCATGTTGCTTTGATTTGCTGGTACAACGGTGCGACTGGATGTTGTGCTATTATGTGGTGTTGCggtgctaaggtgt                                                                                                                             >  2:714291/1‑141 (MQ=11)

                    aTGGAGTGCTATGATGTGGCATTGTGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCggtgttatggtgttat                                                                                                                          <  1:67392/141‑1 (MQ=255)

                       tAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGCTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACGTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATGGCGGTGTTATGGTGTAATAgc                                                                                                                       >  2:102849/1‑140 (MQ=255)

                         ggtgtttgtcctgGCTTTGTGGTTTTGTGGTGTTGTTGTCGGGTTTGGGTGTCATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAgcca                                                                                                                     <  2:268096/130‑4 (MQ=2)

                         gTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTGCTTTGATGTGCGGGTGCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGAGGTGGAGTTGCGGTGTTATGGTGCTCTGGAcc                                                                                                                     >  2:104405/1‑141 (MQ=11)

                         gTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAgtcg                                                                                                                     >  2:334963/1‑138 (MQ=255)

                         gTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGGTATAGAcc                                                                                                                     >  2:189417/1‑141 (MQ=255)

                         gTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGAcc                                                                                                                     >  1:1061562/1‑141 (MQ=255)

                            cTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGCTGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACGTGATGTAGTGCTATGATGTGCCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACGGGt                                                                                                                  >  2:780650/1‑141 (MQ=14)

                              ttggtgtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATTGTCGGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGttt                                                                                                                <  1:699835/137‑1 (MQ=255)

                               tgatgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGgttt                                                                                                               >  1:812579/1‑140 (MQ=255)

                                 ttggtgCATTGGTGTGTTAGGGTGTTATTGGGTGGTTTGGGGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgat                                                                                                             <  2:355403/136‑1 (MQ=17)

                                  tgtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatg                                                                                                            >  1:407406/1‑141 (MQ=255)

                                  tgtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatg                                                                                                            >  1:343067/1‑141 (MQ=255)

                                   gtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgt                                                                                                           >  1:182736/1‑141 (MQ=255)

                                      gCATTGCTGTGTTGTGGTGTTATAGTCGGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttgatgttga                                                                                                        <  2:979217/141‑1 (MQ=255)

                                          tGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGcc                                                                                                    <  1:1026913/141‑1 (MQ=255)

                                           gCGGTGTTATTGTGTTATAGACAGGTTTTGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCa                                                                                                   <  2:507786/141‑1 (MQ=255)

                                            cGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCAt                                                                                                  <  1:953545/141‑1 (MQ=255)

                                              gtgttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTGTGATGTTGATGTCATGt                                                                                                >  2:641345/1‑141 (MQ=255)

                                                 ttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTCCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGCTATAGCCCCGCTTGAGGTTGATGCCATGGTag                                                                                             >  2:573025/1‑140 (MQ=17)

                                                 ttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTAc                                                                                             >  1:900906/1‑141 (MQ=255)

                                                 ttatggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGAGACGTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTAc                                                                                             >  1:938078/1‑141 (MQ=255)

                                                     ggtgttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTg                                                                                         >  1:146862/1‑141 (MQ=255)

                                                        tttatAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtg                                                                                      <  1:811963/140‑1 (MQ=255)

                                                        gttatTGTCAGGTTTGGCTGTGATGCTATGGTACTTTGATGTGCTGGTACCACGTTGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTTTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGAtg                                                                                      <  2:732254/141‑1 (MQ=17)

                                                          tataGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCGTGGTGCTTTGGtgtg                                                                                    >  2:706582/1‑141 (MQ=18)

                                                          tataGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCCTGTTACTTTGAtgtg                                                                                    >  1:702230/1‑141 (MQ=255)

                                                           ataGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGc                                                                                   >  1:333368/1‑141 (MQ=255)

                                                            taGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTGCTTTGATGTGcg                                                                                  >  2:521620/1‑140 (MQ=255)

                                                            taGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACGTGATGTAGTGCTATGATGTGGCTTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTGATTTGATGTGCt                                                                                  >  2:906907/1‑141 (MQ=255)

                                                              gACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTgg                                                                                >  1:916791/1‑141 (MQ=255)

                                                              gACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTgg                                                                                >  2:329189/1‑141 (MQ=255)

                                                                cAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTg                                                                              >  1:950855/1‑141 (MQ=255)

                                                                cAGGTTTGGAGTTGATGCCATGGTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGAGTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGTTGTTGATGTCATGTGACTTTGTTGTGCTGGTg                                                                              >  2:852137/1‑141 (MQ=17)

                                                                  gggttGGGGGTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCt                                                                            <  2:357227/138‑1 (MQ=255)

                                                                    tttGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATATGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTAc                                                                          >  1:671605/1‑141 (MQ=255)

                                                                     ttGGCTTTGATGCTATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTCATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACg                                                                         <  2:60706/141‑1 (MQ=255)

                                                                      tGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCAACgg                                                                        >  2:1061432/1‑140 (MQ=255)

                                                                       ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGGCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGGCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCGTGTGCTACGAt                                                                       >  1:561012/1‑141 (MQ=255)

                                                                       ggCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGAt                                                                       >  1:571580/1‑141 (MQ=255)

                                                                        ggggtGATGTCGTGTTACTTGGATGTGGTGGTACCAGGGTGCGTCTTGGTGTAGTGCTTTGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGACCTGTTGCTACGATg                                                                      <  2:535225/137‑1 (MQ=14)

                                                                        gCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGGTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGCTg                                                                      >  2:77261/1‑141 (MQ=255)

                                                                          tttGATGCCATGTTACTTTGATGTTCTTGTACCACGATTCGACTTGATGTCGTGCTATGATGTGGCATTTCGGTTTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATTTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCg                                                                    <  1:459269/140‑1 (MQ=21)

                                                                          gTTGATGGCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGTTACGCTGCg                                                                    <  2:1052256/141‑1 (MQ=14)

                                                                           gtcatgtcttggttcTTTGATGTGGTGGTCCCACGTTGCGACTTGATGGATGGCTCTGATGTGGCATTGCGGTGTTACGGTGTTATAGACCTGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGa                                                                   <  2:464103/127‑1 (MQ=14)

                                                                             gATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACt                                                                 >  1:752168/1‑141 (MQ=255)

                                                                               tggcATGTTTCTTTGTTGTGCTGGTGCCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTGGGTGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTg                                                               <  2:68912/138‑1 (MQ=14)

                                                                                gtcttGTTTCTTTGATGGGCTGGTACCAGGATGCGTCTTGGTGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGa                                                              <  2:142418/137‑1 (MQ=14)

                                                                                 ccATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGAt                                                             >  1:260540/1‑141 (MQ=255)

                                                                                  cATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGATTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATg                                                            <  2:100698/141‑1 (MQ=255)

                                                                                  cATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATg                                                            <  1:458762/141‑1 (MQ=255)

                                                                                  cATGGTACTTTGTGGTGCTGGTCCCACGTTGGGTGTTGGTCGAGTGGTAGGATGTGGGATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGGTGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATg                                                            <  2:220804/141‑1 (MQ=11)

                                                                                       tACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGGTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGAGGTAGTg                                                       >  2:116132/1‑141 (MQ=255)

                                                                                        aCTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGc                                                      >  1:258935/1‑141 (MQ=255)

                                                                                           ttgatcgggtGGTACCATGATGCGATTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTat                                                   <  2:770979/132‑1 (MQ=14)

                                                                                               tgtgCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTatgatg                                               <  1:565282/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                gcgCTGGTCCCCCGAGGCGACTTGATGGAGTACTCTGTTTTGGTATTGCGGTGTTATGGTGTTTTAGTCCGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGAtgt                                              <  2:517778/139‑1 (MQ=11)

                                                                                                 tgCTGGTACCACGATGCGACTTAATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTGCTTTGCTGTGCTGGTGTTACGATGCGACTTGGTGTAGTGCTatgtggtg                                             >  2:18418/1‑136 (MQ=14)

                                                                                                   cTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCACAGCTGCGTGATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGGTGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTggg                                           >  1:998351/1‑140 (MQ=14)

                                                                                                   cTGGTACCACGATGCAACCACTGCTGGTTCTCTGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCGACGATGGGACTTGGTGATGTGCTATGTTGTggt                                           >  2:753573/1‑140 (MQ=14)

                                                                                                    tgttgccACGATGCGACTTGGTGTAGTGCTATGATGGGGCGTTGCGGAGTTATGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCg                                          <  2:385849/136‑1 (MQ=14)

                                                                                                     ggTACCACGTGGCGCCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATGGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGt                                         <  1:22726/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                      gTACCACGATGCGTCTTGAGGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGtt                                        <  1:474242/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                       tACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACGTGATGTGGTGCTATGATGTGGCGTTg                                       >  2:586788/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                        aCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTgc                                      >  1:535418/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                        aCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTgc                                      >  1:801949/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                          cgcgttgtgatttGATGTAGTGCTATGATGTGGGTTTGCGGTGGTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTgcgc                                    <  1:290171/130‑1 (MQ=17)

                                                                                                          cACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACATGGTGTAGTGCTATGATGTGGCGTTgcgc                                    >  1:750415/1‑141 (MQ=255)

                                                                                                           aCGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCt                                   <  1:666235/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                            cGATGCGACTTGTTGTAGTGCTATGGTGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTg                                  <  1:829848/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                             gATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGt                                 <  1:913158/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                              aTGCGACGTTAGGTAGTGCCATGAGGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGCCCGGTTTGATGTTGAGGCCATGTTACTTTGATGCGCTGGTGCTACGACGCGCCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGtt                                <  1:261666/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                               tGCGACGTGATGGATTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTa                               <  1:1003574/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                 cGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTttga                                                                                                              <  1:3972/60‑1 (MQ=255)

                                                                                                                   tcTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGGGGTGTTATTGTGTTATTGACCGGTTTGGGGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGgt                           <  2:1033307/140‑1 (MQ=14)

                                                                                                                            aGTGTTAGGGTGTTGCATTGCGGTGTTGTGGTGTTATAGTCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGcc                  <  2:844977/141‑1 (MQ=17)

                                                                                                                            aGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGCCCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGcc                  <  1:813366/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                             gTGCTAAGATGTGGCAGTGGGGTGTTATTGTGTTATAGAGCGGGTTGGTGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCa                 <  2:37252/141‑1 (MQ=14)

                                                                                                                               gttATGATGGGGCCTTGGGGTGTTACGGTGTGATAGACCGGTTTTCCGTTGACGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAgg               <  2:508548/139‑1 (MQ=14)

                                                                                                                                  agggtgtgGCATTGCGGTGTTATGGTGTTTTAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGttt            <  2:534738/137‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                     atgTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGTTTGgt         <  1:361856/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                      tgtgGCGTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGTTTGgtg        <  2:258935/141‑1 (MQ=255)

                                                                                                                                          gCATTGCGGTGTTATGGAGTTATAGACCGGGTTGTTGTTGCTGCCATGTTACTGTGTTGGGGTGGTGCTACGGTGCTGCTTGATGTAGTGCTCGGAAGTGGAGTTGCGCTGTTATGGTGTTAGAAGCAGGTTTGGTGTTgg    >  2:463618/1‑140 (MQ=255)

                                                                                                                                            aTTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGTGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGTTTGGTGTTGATg  <  2:146862/141‑1 (MQ=255)

TGGTACCACGATGCGTCTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACAGGTTTGGCGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTACCACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCATTGCGGTGTTATGGTGTTATAGACCGGTTTGATGTTGATGCCATGTTACTTTGATGTGCTGGTGCTACGATGCGACTTGATGTAGTGCTATGATGTGGCGTTGCGCTGTTATGGTGTTATAGCCAGGTTTGGTGTTGATG  >  CP000730/2211133‑2211413

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 8 ≤` `ATCG/ATCG` `< 12 ≤` `ATCG/ATCG` `< 27 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`