| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 39,378 | C→A | 100% | D586Y (GAT→TAT) | mecA ← | penicillin binding protein 2 prime |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 39,378 | 0 | C | A | 100.0% | 204.7 / ‑6.5 | 74 | D586Y (GAT→TAT) | mecA | penicillin binding protein 2 prime |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base A (43/29); minor base T (0/2); total (43/31) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
AATAGCCATCATCATGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATCTTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAATATTGCCATT > CP000730/39241‑39513 | aaTAGCCATCATCATGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATAtatt > 1:681225/1‑140 (MQ=255) catcatcatGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTTAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTAt < 1:457702/140‑1 (MQ=255) catcatcatGTTTATATAATCTTTATCATATGAAATAAACGACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTACTTCATATTTAGTTATTCAGTACCGGATGTACCAATGAAGTTTGCATATAATCTATAATTATATCATTTAt > 2:264266/1‑140 (MQ=255) catcatGTTTGGATCATCTTTATCATACGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTAtgtg < 1:452672/140‑1 (MQ=255) atcatGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATgtgt > 1:301581/1‑140 (MQ=255) tGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTTAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCAAATTAAGTTTACATAAGATCTATAAATCTATTCTTTATGTGTttta > 1:183651/1‑140 (MQ=255) tGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTttta > 1:655994/1‑140 (MQ=255) tGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTGATGTGTttta > 1:669755/1‑140 (MQ=255) ttGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGTCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATCAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTtttattt < 2:293575/140‑1 (MQ=255) tCTTTATCATATGCTATAAACCACCCAATTTGTCTGACAGTTTCTACTTGTTTCATTTTGAGTTCTTCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTAAGACttg > 2:460462/1‑140 (MQ=255) tCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACttg > 2:317930/1‑140 (MQ=255) ttATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACttgttg > 1:578900/1‑140 (MQ=255) tATCATATTATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGc < 1:655928/140‑1 (MQ=255) tATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGc < 1:182680/140‑1 (MQ=255) tatGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCTTAcc > 1:574459/1‑140 (MQ=255) tatGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTGCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGAACTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTAGTTGCATAcc > 2:204799/1‑140 (MQ=255) tGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATATGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCAt > 1:253476/1‑140 (MQ=255) tGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAAAATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCAt > 1:108736/1‑140 (MQ=255) gATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATc < 2:247038/140‑1 (MQ=255) tataAACCATCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTAACGTGGGCGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAg < 1:529041/140‑1 (MQ=255) tataAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTTAGCTCTGCAGTACCGTATTTGCCAATTAATTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTTTTTACGACTTGATGCATACAATCAg > 1:426459/1‑140 (MQ=255) ataAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGt < 2:681225/140‑1 (MQ=255) caccCAATTTGTCTGCCAGTTTGTCATAGCTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATACGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAg > 2:187361/1‑140 (MQ=255) accCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGa > 2:385610/1‑140 (MQ=255) cccAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTCTTTACGACTTGTTTCATACCCTCAGTTAATAGAt > 2:222849/1‑140 (MQ=255) cccAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGAt > 1:548715/1‑140 (MQ=255) cccAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGAt > 1:195091/1‑140 (MQ=255) ccAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGCCTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGAtt > 1:25271/1‑140 (MQ=255) ttggTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCAAAAGGCGTTGTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAGTAGGTTGata > 2:666205/4‑140 (MQ=255) ttGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGatat > 2:3108/1‑140 (MQ=255) ttGTCTGCCAGTTTCTCCTTATTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATACGTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATGGatat > 2:399378/1‑140 (MQ=255) gCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCtt > 1:701393/1‑140 (MQ=255) tttCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGaa > 1:69844/1‑140 (MQ=255) tttCCCCTACTTGCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGGCTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCCTTGGac > 2:84845/1‑139 (MQ=255) ttCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGaaa > 1:550993/1‑140 (MQ=255) gTTTCATTTTGTGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATAttt < 2:411362/140‑1 (MQ=255) ttttGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTttcttc > 1:663098/1‑140 (MQ=255) tttGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTcc < 2:486395/140‑1 (MQ=255) tGAGTTCTGCAGTACCGGTTTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCaa < 2:557556/140‑1 (MQ=255) tgTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAAc < 2:640364/139‑1 (MQ=255) gTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTGTCGTCCaacct < 2:518722/140‑4 (MQ=255) ttCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACtt < 2:127020/140‑1 (MQ=255) ttCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACtt < 2:467075/140‑1 (MQ=255) tcagCAGTGCCGGATTTGCCACTTAAGTTTGCATAAGTTCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGAGATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAATCttt < 2:510951/137‑1 (MQ=255) tCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTATTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACttt > 1:213007/1‑140 (MQ=255) cTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTg > 1:477678/1‑140 (MQ=255) tGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATCATATTGTTCTTCCAAACTTTGt < 2:701393/140‑1 (MQ=255) gCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGtt < 2:268998/140‑1 (MQ=255) aGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGtttt < 1:225509/140‑1 (MQ=255) aGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGATAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGtttt > 1:182362/1‑140 (MQ=255) gTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATTTTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGttttt < 1:394302/140‑1 (MQ=255) gTACCGGATTTACCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGttttt < 2:409740/140‑1 (MQ=255) tACCGGATTTGCTAAGTAAGTTTGCATAATATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCTAACTTTGTTTTTc < 2:426459/140‑1 (MQ=255) ccGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCgt < 2:301581/140‑1 (MQ=255) cGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCgtg > 1:565874/1‑140 (MQ=255) gATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACGTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTTTTCCAGAATTTGTTTTTCgggtt > 2:613624/1‑139 (MQ=255) aTTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCt > 1:551557/1‑140 (MQ=255) tttGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCtt < 2:408629/140‑1 (MQ=255) tttGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCtt < 2:285086/140‑1 (MQ=255) tttGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCtt < 2:462385/140‑1 (MQ=255) tGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCtttt > 1:652789/1‑140 (MQ=255) ccAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAACCTTTGTTTTTCGTGTCTTTtaa > 2:112121/1‑140 (MQ=255) cAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAAATTTGTTTTTCGTGTCTTTtaat > 2:379716/1‑140 (MQ=255) tAAGTTTTCATAATATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGt < 1:640551/140‑1 (MQ=255) tAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTACTAAGt < 2:570223/140‑1 (MQ=255) ttGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGt > 2:678048/1‑140 (MQ=255) tGCATAAGATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTg > 1:40195/1‑140 (MQ=255) cATAATATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCACACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCg < 2:333205/140‑1 (MQ=255) cATAAGTTCTATAAATTTTTTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCg < 2:46425/140‑1 (MQ=255) cATAAGATCTATAAATATATTTTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACGATTAGTTAATAGATTGATATTTTTTTTGGAAATAATATTTTTATTACAAATTTTTTTTTTTGTGTTTTTTAATAAGGAAGGtcaa > 1:254461/1‑137 (MQ=255) tAAGATTTACAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCCTACCATCGTTTTATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGtt < 2:360927/140‑1 (MQ=255) gATCTATAAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCCGTTCATGGCTTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTTTTCCAAACATTGTTTTTCGTGTATTTTAATAAGTgcaatgggttact > 1:457748/1‑128 (MQ=255) ataAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCCGTTGCTAGATTTATATTTTCTTGGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTTTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAATATTGc > 1:169755/1‑140 (MQ=255) ataAATATATTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAATAttcc > 1:479920/1‑138 (MQ=255) ataAATATATTCTTTATGTGCTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGACTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTCATTAAGTGAGGTGCGTTAATATTGc > 1:443747/1‑140 (MQ=255) atatatTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAATATTGCCatt > 1:433003/1‑140 (MQ=255) | AATAGCCATCATCATGTTTGGATTATCTTTATCATATGATATAAACCACCCAATTTGTCTGCCAGTTTCTCCTTGTTTCATTTTGAGTTCTGCAGTACCGGATTTGCCAATTAAGTTTGCATAAGATCTATAAATATCTTCTTTATGTGTTTTATTTACGACTTGTTGCATACCATCAGTTAATAGATTGATATTTTCTTTGGAAATAATATTTTTCTTCCAAACTTTGTTTTTCGTGTCTTTTAATAAGTGAGGTGCGTTAATATTGCCATT > CP000730/39241‑39513 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |