| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,474,639 | C→G | 100% | A9129P (GCA→CCA) | ebh ← | extracellular matrix binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,474,639 | 0 | C | G | 100.0% | 242.2 / ‑6.5 | 75 | A9129P (GCA→CCA) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); major base G (26/45); minor base T (1/1); total (28/47) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
CTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAT > CP000730/1474507‑1474773 | cTTTTAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATcc < 2:97461/140‑1 (MQ=255)cTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATcc < 1:644304/140‑1 (MQ=255) ttAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCAc > 2:174324/1‑140 (MQ=255) aaaTCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATTTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACtt < 1:278931/140‑1 (MQ=255) aTCCATCTTGTTGTGCATTGTTTAATGCATTCATTTGGTCGATGTCTTGTTTATCATTTGTTTTTGCAAGTGCTACACGTTTATCACCATTTAATGTTTGTTTTGCTTTTTAATTATTTTGTGGTGGTTGTTCCTTttgt > 2:248209/1‑140 (MQ=255) ttgttgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTAt > 2:367050/1‑140 (MQ=255) tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGTTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 2:401632/140‑1 (MQ=255) tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCga < 2:188286/140‑2 (MQ=255) tgAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGc < 1:116714/140‑1 (MQ=255) gAGCATTGTTTAATTCATTCAATTGTGCTATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:442602/140‑1 (MQ=255) gAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:671128/140‑1 (MQ=255) gAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCa < 1:227202/140‑1 (MQ=255) aGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAt < 2:657479/140‑1 (MQ=255) cATTGTCTTACGCATTCAAGTGGTCGGTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATGTAATTCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAttt < 2:679868/140‑1 (MQ=255) atggTTTAATGCATTTCTTTTGTCGATTTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCAtttt < 2:552863/137‑1 (MQ=255) tttAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGttt > 2:462834/1‑140 (MQ=255) tctAAGGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGttt < 1:609191/138‑1 (MQ=255) aTGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCTCATTTTGTTTCAAt < 2:492921/140‑1 (MQ=255) aTGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAAt < 1:543937/140‑1 (MQ=255) tGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTTTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATa > 1:702322/1‑140 (MQ=255) tGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATa > 1:645451/1‑140 (MQ=255) aaTTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtc < 1:244022/140‑1 (MQ=255) aTTGGTCGATGTCATGTTTACTATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtca < 2:675694/140‑1 (MQ=255) tGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagc > 1:212530/1‑140 (MQ=255) cGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTAAACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTAGCATTTTGTTTCAACACATTTtccgcataa > 2:339250/1‑138 (MQ=255) gATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCCTCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcag < 2:440679/140‑1 (MQ=255) gATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAAGGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcag < 2:276207/140‑1 (MQ=255) aTGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTAGACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCGTTTAAAATATTTTGAAGTGTTTGATCCACTTGTTGCTTTTTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcaagattggc > 2:437042/1‑132 (MQ=255) aTGTCATGTTTACCATTTGTTATAGAAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATACCCTTGTTGATTATTCGCATTTTGTATCAATACATTTtcagcatccgg > 2:437031/1‑137 (MQ=255) tggcATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCAGTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTtcagcatcagca > 2:552245/4‑140 (MQ=255) aTGTTTCCCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAg < 1:573859/140‑1 (MQ=255) aTGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAg < 2:192504/140‑1 (MQ=255) gTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTATCCGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAGATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTAGTCCCAGTTCATTTTCAGCATCAGCAATAGCt < 1:172460/140‑1 (MQ=255) gTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCt < 2:338394/140‑1 (MQ=255) ttACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGAAATAGCTTg > 1:673010/1‑140 (MQ=255) ccATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTTTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGttt < 1:618656/140‑1 (MQ=255) tttGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTtata < 1:643949/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAGCCAGTGCTCCACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAg < 2:35576/140‑1 (MQ=255) tGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAg < 2:482280/140‑1 (MQ=255) tttAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAATGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTTGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATAAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAt > 1:200398/1‑140 (MQ=255) tAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAttt < 1:689228/140‑1 (MQ=255) gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCAttttt > 2:644129/1‑139 (MQ=255) gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTg > 1:660141/1‑140 (MQ=255) gCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCGTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTg > 1:112022/1‑140 (MQ=255) aaGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGtt < 2:261531/140‑1 (MQ=255) gTGCTCCCCCTTCATCACCATTTTAGTAATGTTGTGCATTTCAAATATTGTGAAGTGGCTGCTCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:694197/140‑1 (MQ=255) gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGTTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:161872/140‑1 (MQ=255) gTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTa < 1:417089/140‑1 (MQ=255) gCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGTTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATc < 1:240890/140‑1 (MQ=255) gCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATc < 1:367835/140‑1 (MQ=255) acGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAAt < 1:373210/140‑1 (MQ=255) ttCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTg < 1:409422/140‑1 (MQ=255) catcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCt > 2:65181/1‑140 (MQ=255) atcaCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCtt > 1:564507/1‑140 (MQ=255) caCCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTtgt > 1:392387/1‑140 (MQ=255) cATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTtgtgtg > 2:523052/1‑140 (MQ=255) cATTTAATGCTTGTTTGGCATTTAAAAGATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCCGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATATGCTagtgtg > 2:681885/1‑140 (MQ=255) aaTGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATc < 1:10323/140‑1 (MQ=255) gCTTGTCTTTCATTTAAAATATTTTGAAATGACTGATTCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTAGCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTAc > 1:533606/1‑140 (MQ=255) cTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTCCa > 2:102163/1‑140 (MQ=255) ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:572825/1‑140 (MQ=255) ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:19595/1‑140 (MQ=255) ttGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAg > 1:38043/1‑140 (MQ=255) tGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGt > 1:478114/1‑140 (MQ=255) ttttGCATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCAGCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGttt < 2:299450/140‑1 (MQ=255) ttGCAAATAAAATATTTTGAAGTGGCACATCCACTTGTTGCTTAATCCTATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGc < 1:248209/140‑1 (MQ=255) gCATTTAAAATATTTTGAAGTGTTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTc < 1:255075/140‑1 (MQ=255) cATTTAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCa > 1:492833/1‑140 (MQ=255) tttAAAATATTTTTAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATGCCTATTGTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAAc < 1:378408/140‑1 (MQ=255) tAAAATATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGt < 1:247573/140‑1 (MQ=255) aaaaTATTTTGATGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGtt < 1:320253/140‑1 (MQ=255) aaTATTTTGAAGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAg < 2:196495/140‑1 (MQ=255) tcaaGTGCATGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCCTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTc < 1:722354/138‑1 (MQ=255) aaGTGGTTTATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt < 2:702322/140‑1 (MQ=255) aaGTGGTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAt < 2:645451/140‑1 (MQ=255) | CTTTAAATCCATCTTGTTGAGCATTGTTTAATGCATTCAATTGGTCGATGTCATGTTTACCATTTGTTTTAGCAAGTGCTACACGTTCATCACCATTTAATGCTTGTTTTGCATTTAAAATATTTTGAAGTGCTTGATCCACTTGTTGCTTATTCGCATTTTGTTTCAATACATTTTCAGCATCAGCAATAGCTTGTTTATAAGCATTTTGTTTATCTGAATCTGCTTGTGTGTAATCTACAGTTTGCTCAACGTTAGCATGTTCAT > CP000730/1474507‑1474773 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |