| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,809,898 | A→G | 6.5% | F91F (TTT→TTC) | accD ← | acetyl‑CoA carboxylase beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,809,898 | 0 | A | G | 6.5% | 200.7 / 3.2 | 74 | F91F (TTT→TTC) | accD | acetyl‑CoA carboxylase beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (26/41); new base G (3/2); total (30/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.86e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TACTTCCCATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGCACACATTTAAATTTTCA > CP000730/1809762‑1810033 | tACTTCCCATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTATGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCAGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGaaaa > 1:131427/1‑140 (MQ=255) tCCCATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCGTCTAGTTGTGCGGTACCAGTCACAACGGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAAATTGGGACATCTa > 2:379477/1‑140 (MQ=255) tCCCATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGTTCCTTTTCAATTTTTTTTAAATTATTTGGatgttttg > 2:135615/1‑133 (MQ=255) cctattatatatcGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTaa < 1:673300/128‑1 (MQ=255) cATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAAACTAATg > 1:101528/1‑140 (MQ=255) cTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGACAATCTAATAGAtt > 1:210567/1‑140 (MQ=255) cTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAACCTCATGGAtt > 2:364973/1‑140 (MQ=255) aaaaCGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCATCTTTTAGACCTGTCTTACGCGGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGTAAAATCTAATGGATTCg > 1:680238/1‑140 (MQ=255) gTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCagag < 2:406108/140‑1 (MQ=255) tGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAgg < 1:189763/140‑1 (MQ=255) aTCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATAGCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCa > 1:461286/1‑140 (MQ=255) aTCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCa < 2:364417/140‑1 (MQ=255) tCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATATCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCAt < 1:505152/140‑1 (MQ=255) tCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTAGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGACAACTCTCATGGATTCGCAGAGGTCAt > 2:34841/1‑140 (MQ=255) cATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTc > 1:682690/1‑140 (MQ=255) ggccAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTccc < 2:381955/137‑1 (MQ=255) gACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCt < 2:91659/140‑1 (MQ=255) gACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCt < 1:213196/140‑1 (MQ=255) aGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTTCCGTAt < 2:628583/140‑1 (MQ=255) aaCGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGa > 2:720412/1‑140 (MQ=255) aaCGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGa > 2:578696/1‑140 (MQ=255) aaCGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTCGTCCTGGGCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGa > 1:713906/1‑140 (MQ=255) aCGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGaa > 1:426767/1‑140 (MQ=255) cGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATATAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAAt > 2:658828/1‑140 (MQ=255) attgttctttccATCTAGTTGTTCTGTACCCGTCACAACTGCTTCTTTTAGTACTGTCTTTTTGTAGACCTTTTTCATCTCTTCTAGAAAACTCTTAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCCAATTCTg < 2:18237/130‑1 (MQ=255) ttCATACCATCTTGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGAAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTaaa < 1:319015/140‑1 (MQ=255) aTCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCtt < 1:257452/140‑1 (MQ=255) gTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTtcctca > 1:594852/1‑140 (MQ=255) ttGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTTAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAg < 1:62654/140‑1 (MQ=255) ttGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAg < 1:612150/140‑1 (MQ=255) tgtgCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTGGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGa < 1:663808/140‑1 (MQ=255) tgggCTGTACCTGTCACAACTGCTTCTTTAAGTCCTTTCTTTTGTTGTTTCTTTTCAATTTTTTCTATATAACTTGGAAAATCAAATGGATGCGCAGAGGTCATTCCCTGATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGa < 1:193935/137‑1 (MQ=255) gtgCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATTCATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGaa < 2:659763/140‑1 (MQ=255) gtgCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGaa > 1:154805/1‑140 (MQ=255) tgCTGTACTAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCCTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGaaa < 1:422678/140‑1 (MQ=255) tgCTGTACCAGTCACAACTGCTTATTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGaaa < 1:210061/140‑1 (MQ=255) gCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAAt < 1:408373/140‑1 (MQ=255) tACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCt < 2:267168/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCtt < 2:631772/140‑1 (MQ=255) aCCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCtt < 1:371640/140‑1 (MQ=255) ccAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTc > 1:118271/1‑140 (MQ=255) cAGTCACAACTGCTTCTTTAAGATTTTCCCTTGGTGGGTCCTTTTTGCTTATATCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGCAATTGCTTCt < 1:525355/140‑1 (MQ=255) cAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTGTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAAAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCt > 2:283747/1‑140 (MQ=255) acagcacaACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCATTCATCAGAAATTGCTTca > 2:112821/5‑139 (MQ=255) acaTCTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCTATTTTTTCTTTATAACCTTGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACg < 1:712497/140‑1 (MQ=255) acaACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACg > 1:33125/1‑140 (MQ=255) aaCTGCTTCTTTAAGCCCTGTCTTTTGTTGGTCCGTTTCAATGTTTTCGAAATAACTTGGACAACCTGATGGATGCGCAGAGGTCATTCCGTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTCCTATACGtt > 1:542661/1‑140 (MQ=255) aaCTGCTTCCTTAAGACCTATCTTTTGTTGGTCCGTTTCAATATTTTCAAAATAACTTGGAAAAGCTGATGGGTACGCAGAGGACATTCCATTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGtg > 1:542557/1‑139 (MQ=255) gCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTtata > 2:101173/1‑140 (MQ=255) gCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATCATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTtata > 1:132736/1‑140 (MQ=255) ttcttTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACg < 2:358618/140‑1 (MQ=255) ttcttTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACg < 1:606256/140‑1 (MQ=255) ttcttTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACg < 1:450595/140‑1 (MQ=255) ttAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATGCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGt < 1:70382/140‑1 (MQ=255) gACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTACTTCTATACCTTTATAAACAGTTaaa > 1:450411/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGGAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAg > 2:310348/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGGAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAg > 2:469131/1‑140 (MQ=255) aCCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAg > 1:122503/1‑140 (MQ=255) cccgTCTTTTGTTGGTCCTTTTCATTTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGATGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCAGCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGc < 2:680238/137‑1 (MQ=255) ccTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTCCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTTAAGc < 1:519350/140‑1 (MQ=255) gTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAat < 2:724186/140‑1 (MQ=255) cctttGTTGGTCCTTTTCCATCTTTCCTAAATAACTTGGAAAACCTACTGGATTCGCAGAGGTCACTCCCCTTGCGGGTACTGTATATGATCCTTCATCAGAAATTGTTTCTATACTTTTATACTTAGTTAAAGCAatat < 2:154257/138‑1 (MQ=255) cTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAatat < 1:292498/140‑1 (MQ=255) ttttGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAAGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATatg < 2:621145/140‑1 (MQ=255) tgttgGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGTAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATatgatg < 1:351578/140‑1 (MQ=255) gttgGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCTCAGTGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATAtgatga > 1:482556/1‑140 (MQ=255) ttgGTGCTATTCAATTACTTCTAAATAACTTTGAAAATCTAATGCATTCGGAGAGGTCATGCCCTTATCGAATTCTGTAATTGATTCTTGAGTGCATCTTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTATAGAAATATgatgat < 2:224987/140‑1 (MQ=255) tgGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGTATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATc < 1:38126/140‑1 (MQ=255) aTTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTTATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTATATGTTCCTTTATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGca < 1:182408/140‑1 (MQ=255) ttttCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGcacac > 1:394328/1‑140 (MQ=255) aaTAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGCACACATTTaaa < 1:416382/140‑1 (MQ=255) aaCTTGGAAAATCTAATGGATTCGCATAGGTCATTCCATTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCAGCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGAGGATCACAATTAAAGTACACATTTAAAttt < 2:542557/140‑1 (MQ=255) aaCTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTAATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATTATGAGCACAATTAAGGCACACATTCAAAttt > 2:702030/1‑140 (MQ=255) aaCTTGGAAAATCTAATGGAGTCTCAGAGGTCATTCCATTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGACGATCACAATTAAAGAACACATTTAAAttt < 2:542661/140‑1 (MQ=255) ttGGGAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGCACACATTTAAATTTTCa < 1:469131/140‑1 (MQ=255) ttGGGAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGCACACATTTAAATTTTCa < 1:310348/140‑1 (MQ=255) | TACTTCCCATTCTAAAACGTGAATCCATGACAGCAACGCCAAATTTCATACCATCTAGTTGTGCTGTACCAGTCACAACTGCTTCTTTAAGACCTGTCTTTTGTTGGTCCTTTTCAATTTTTTCTAAATAACTTGGAAAATCTAATGGATTCGCAGAGGTCATTCCCTTATCGAATTCTGTAAATGATCCTTCATCAGAAATTGCTTCTATACGTTTATACGCAGTTAAAGCAATATGATGATCACAATTAAAGCACACATTTAAATTTTCA > CP000730/1809762‑1810033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |