| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,944,670 | G→A | 100% | intergenic (‑251/‑713) | splA ← / → USA300HOU_1807 | S1B family serine protease SplA/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,944,670 | 0 | G | A | 98.7% | 299.6 / ‑4.8 | 99 | intergenic (‑251/‑713) | splA/USA300HOU_1807 | S1B family serine protease SplA/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (24/73); total (25/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.43e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TAAATTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCGGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACAATATGCAGTC > CP000730/1944537‑1944804 | taAATTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCGGAAAtt > 2:56001/1‑140 (MQ=255) aaaTTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTa < 2:18703/140‑1 (MQ=255) tattcttTTACATGAATCAAATCATATATTTCAATACGCTTCAAACAACAAATAAAGCAATTAAAATTGAAATTTTAGAACTATTTTTGTATTAAATATTCATTATTAAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATGAg > 2:283724/2‑140 (MQ=255) aaTTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAg < 2:195204/140‑1 (MQ=255) aaTTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAg < 1:219231/140‑1 (MQ=255) attattTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAgg > 2:340236/1‑140 (MQ=255) attattTTACATGAATTGAATCATTGAGTTAAATATTATTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATCATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAgg < 2:542732/140‑1 (MQ=255) attattTTACATGAAGTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATAAAGCAATTAAAAGTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTGAAATTGTAATATTTATTAAGAAATTAgt > 2:267259/1‑139 (MQ=255) ttattTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGt < 2:56961/140‑1 (MQ=255) tgattTAACATTAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGt < 2:581074/138‑1 (MQ=255) tattTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTg < 2:644403/140‑1 (MQ=255) attTTACATGAATTGATTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGa < 1:317886/140‑1 (MQ=255) attTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGa < 2:287695/140‑1 (MQ=255) ttttACATGAATTGACTCATTTATTTAATTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGAt < 1:518712/140‑1 (MQ=255) ttttACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGAt < 2:344817/140‑1 (MQ=255) ttttACATGAAGTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGAt < 2:289136/140‑1 (MQ=255) tgttAGATGTAATGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCTATACAACGCCATTAAAATTGATTTGTTAGGATTAGTTTGGTCTTATATATTACTCATTTAATTAAAAGTGTTATATTTATTCAGAAAGTAGGTGAt < 2:251163/138‑1 (MQ=255) tttACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATAACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAAAAATTATTCAGAAAGTAGATGAtt > 1:645318/1‑140 (MQ=255) aCATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTCAAAACTAAATTTTTCGCTATTAATATTGACTTTTCTGGCTCTTTATAGTCTTAGTTTGTAATGATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGaa < 1:531616/140‑1 (MQ=255) cATGAATTGACGAATTTGTTTAGATATGCTTAAAACTTAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGaaa < 2:134898/140‑1 (MQ=255) aTGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCCATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGaaaa < 1:41420/140‑1 (MQ=255) aaTTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAatat > 2:74933/1‑140 (MQ=255) attttcTCATTTATTTATAGATTCTTAAAACTCAATATCACGCATTTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAatata < 2:362498/135‑1 (MQ=255) ttGACTCATTTATTTAAGTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGAATTATTTGGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAatatat < 2:438819/140‑1 (MQ=255) aCTCATTTATTTCAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCCATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGc < 2:552931/140‑1 (MQ=255) aCTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGc < 2:669544/140‑1 (MQ=255) cATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGa > 2:478150/1‑140 (MQ=255) cATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGa < 1:526892/140‑1 (MQ=255) tatttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATgg < 1:177008/140‑1 (MQ=255) tatttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATgg < 2:664325/140‑1 (MQ=255) tattgaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTACGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAGTgg < 1:522351/140‑1 (MQ=255) atttaATGATGCTTAAAACTTCATATCAAGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAATATTCTAAGATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGTGGAATGGt < 2:145351/140‑1 (MQ=255) atttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGt < 1:320726/140‑1 (MQ=255) atttaAATATGCTTAAAACTAAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGt < 1:530323/140‑1 (MQ=255) tttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTg < 1:112886/140‑1 (MQ=255) tttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTg < 1:368904/140‑1 (MQ=255) ttaAGTATTCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGa < 2:645318/140‑1 (MQ=255) ttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGa < 1:297328/140‑1 (MQ=255) ttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGa < 1:686484/140‑1 (MQ=255) ttaAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGa < 1:340236/140‑1 (MQ=255) taAATATGCTTAAATCTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGaa < 1:635900/140‑1 (MQ=255) taAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGaa < 1:354908/140‑1 (MQ=255) taAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAAGTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGaa > 2:124298/1‑140 (MQ=255) aaaTATGCTTAAAAGTAAATATTACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAAc < 2:717817/140‑1 (MQ=255) aaaTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAAc < 1:199155/140‑1 (MQ=255) aaTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATCTTAATTATTTAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACa > 2:621959/1‑140 (MQ=255) aaTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGTTGATTGAAAATATATGGCGGAATGATGATCa > 1:308053/1‑140 (MQ=255) aaTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTTAAAATATATGGCGGATTGGTGAACa > 2:554738/1‑140 (MQ=255) aaTATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACa > 1:105899/1‑140 (MQ=255) tatGCTTAAAACTTAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAAt < 1:305535/140‑1 (MQ=255) tacgCTAAAAACTCACTATCACACAATTAAAATGGACTTTTTACGATCATTTTGTTCTTAAATAATAATTATTGAAATAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTACGTGATTTAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAAt < 2:474270/137‑1 (MQ=255) atGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAAtt < 2:589882/140‑1 (MQ=255) tGCTTAAAACTCACTATCACGCAGTTACAATAGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATCATTGAATTAAAATAGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGACTGTTGAACAATTc > 2:156665/1‑140 (MQ=255) tGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTc < 2:43096/140‑1 (MQ=255) tGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATAATAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCGGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTc < 2:26352/140‑1 (MQ=255) gCTTAAAACTCAATATCACGTAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTATTATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCa < 2:442317/140‑1 (MQ=255) aaaCTCAATATCACGCAATTAAAATTGCATTTTTAGGATTCTTTTAGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAAGTGATTGAAAAGATATGGTGGAATGGTGAACACTTAAAGTAt > 2:133696/1‑140 (MQ=255) aCTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTAttt < 1:22948/140‑1 (MQ=255) cacAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGTTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTta < 1:422485/138‑1 (MQ=255) tCAATATCACGTAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTtat < 2:29598/140‑1 (MQ=255) tCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTtat < 1:165095/140‑1 (MQ=255) cAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTtata > 2:354502/1‑140 (MQ=255) catatCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGAATTTCCAGGGTTTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATaa < 2:329341/139‑1 (MQ=255) aaTATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGAGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTACaa > 2:488302/1‑140 (MQ=255) tatCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATc < 2:232755/140‑1 (MQ=255) ataaCGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCt < 2:149033/137‑1 (MQ=255) tCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCtt < 1:262384/140‑1 (MQ=255) tCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCtt < 1:5046/140‑1 (MQ=255) tCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCtt < 2:531416/140‑1 (MQ=255) taCGCAAGTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCGTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCttt < 1:18174/139‑1 (MQ=255) aTTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACttt > 2:133924/1‑140 (MQ=255) ttGACTTTTTATGATTATTTGGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGt < 1:662615/140‑1 (MQ=255) tGACTTTTTAGGATTAATTTGCTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATATATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTa > 1:373039/1‑140 (MQ=255) gACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTACTCTTTATCCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTAt < 1:527988/140‑1 (MQ=255) gACTTTTTAAGATTATTTTTCTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTTATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATGCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTAt < 1:216529/140‑1 (MQ=255) cTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATCATAGAATTCCACTTGTAATCCAACTTAAGAAATTAGCGGATTGAAAATATATGGCGGAATGAGGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATtg > 2:716820/1‑140 (MQ=255) ttattTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGAGAACAACTCATTTAATTATTATCTTTCACTTTACTATGTATCGTGTTTaacaa > 2:75033/1‑140 (MQ=255) tAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAACATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGa < 1:124298/140‑1 (MQ=255) tAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGa < 2:532906/140‑1 (MQ=255) aaaTATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGAt < 1:354502/140‑1 (MQ=255) aaaTATAAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATCGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGAt < 2:400738/140‑1 (MQ=255) tattGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCt < 1:621466/140‑1 (MQ=255) ttGAATTAAAATTGTTATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtat < 1:668861/140‑1 (MQ=255) ttGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtat < 2:521781/140‑1 (MQ=255) ttGAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtat < 1:356263/140‑1 (MQ=255) ttGAATGAAAATGGTAAGGATTATTGAGAAATTAGGTGTTTGAAAATATATGGCGGAGTCGTGAACAATGCATGTATTTTTAATCTTTCACTTTACTATGGATTGTGTGTAGGAACATTTTTATCGATTAGTTCCCCtat < 2:291700/140‑1 (MQ=255) gAATTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtatta < 2:578062/140‑1 (MQ=255) aaaTTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtatta < 2:208655/139‑1 (MQ=255) aaTTAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCtattat < 1:384365/140‑1 (MQ=255) tAAAATTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTAttattta < 2:199338/140‑1 (MQ=255) aaaaTTGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTAttatttat < 2:609180/140‑1 (MQ=255) ttGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGAcg > 1:572859/1‑139 (MQ=255) ttGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAACGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACa > 1:89887/1‑140 (MQ=255) tGTAATATTTATTCAGAAATTAGGTGGTTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCTCTATTATTTATGaaca > 2:505878/1‑137 (MQ=255) tAATATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTTCCCTATTATTTATGACAata > 2:705821/1‑140 (MQ=255) aaTATTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACAatat < 2:4031/140‑1 (MQ=255) atatTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACAATATg < 2:308053/140‑1 (MQ=255) atatTTATTCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAAAGATTAGTTCTTCTATTATTTATGACAAGATg > 1:78230/1‑140 (MQ=255) tattCAGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACAATATGCAGtc < 1:660621/140‑1 (MQ=255) | TAAATTATTTTACATGAATTGACTCATTTATTTAAATATGCTTAAAACTCAATATCACGCAATTAAAATTGACTTTTTAGGATTATTTTGGTCTTAAATATTAATTATTGAATTAAAATTGTAATATTTATTCGGAAATTAGGTGATTGAAAATATATGGCGGAATGGTGAACAATTCATGTATTTATAATCTTTCACTTTACTATGTATTGTGTTTAACAACATTATTAGCGATTAGTTCCCCTATTATTTATGACAATATGCAGTC > CP000730/1944537‑1944804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |