| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,454,551 | G→T | 4.3% | M23I (ATG→ATT) | USA300HOU_2315 → | hypothetical membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,454,551 | 0 | G | T | 4.3% | 278.9 / 3.4 | 93 | M23I (ATG→ATT) | USA300HOU_2315 | hypothetical membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (45/44); new base T (2/2); total (47/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.33e-02 | |||||||||||
CGGCTTGTAATATGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGCA > CP000730/2454416‑2454689 | ctgCTTGTAATATGTATAATTGTTAATAAAAGATATGTTGCTTGTTACCTAATTGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGt < 1:245071/138‑1 (MQ=255)cGGCTTGTAAGATGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGt < 2:452512/140‑1 (MQ=255) gTAATATGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCa > 2:64011/1‑140 (MQ=255) aaTATGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATCATGAAGAACAATAAACTTTCTGGTTATCAATGGGCAATGACGATTTTCGGCTACCTGGACATGGCAAGGTCGTTATCCAtt > 2:499580/1‑140 (MQ=255) tatGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATTGCGTTATCCATTAt > 1:610774/1‑140 (MQ=255) atGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATg > 1:254927/1‑140 (MQ=255) atGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATg < 1:79686/140‑1 (MQ=255) gTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCAAATGGAGGTTAAATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCTTTTTgtt > 2:300117/1‑138 (MQ=255) aaTTGTTACTAAAAGATATTCTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCaga > 1:443401/1‑140 (MQ=255) aTTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCagag < 2:144298/140‑1 (MQ=255) ttGTTACTAAAATATATTTTGCTTGTTTCCTAATGGAGGTTACATTTCATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAAGGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAgaga < 1:343816/140‑1 (MQ=255) ttGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAgaga < 1:7171/140‑1 (MQ=255) tGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGAt < 2:46966/140‑1 (MQ=255) gTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTGTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCAATTATGCGCAGAGAtt > 2:458538/1‑140 (MQ=255) gTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTAGCCATTATGCCCAGAGAtt > 2:366126/1‑140 (MQ=255) tACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTTTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTc > 2:238449/1‑140 (MQ=255) tACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTc > 1:702202/1‑140 (MQ=255) tACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTAAATGGGCAATGAGGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATGTc > 2:620571/1‑140 (MQ=255) cTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGTCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCa > 2:212182/1‑140 (MQ=255) cTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCa > 2:646039/1‑140 (MQ=255) tAAAAGTTATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAGATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAg > 2:458429/1‑140 (MQ=255) tAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGCCGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAg > 2:489042/1‑140 (MQ=255) aaGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAACTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCt < 2:399557/140‑1 (MQ=255) gttatTTTGCTTGTTACCTAATGGAGTTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCtat < 1:217543/138‑1 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAGTGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAAtt < 2:4673/140‑1 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGTTTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAAtt < 2:593393/140‑1 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCtctattg > 2:288350/1‑137 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAAtt < 1:392923/140‑1 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTATCTAAtt > 1:128539/1‑140 (MQ=255) ttttGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGACGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAAtt > 1:469184/1‑140 (MQ=255) tgattGTTACATAAGGGGGGGTACATTTACTGAAGAAGAAAAAGATTCCTGGCTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGGCTTCTGTGTCATTACAATGGCGTGATACCTTATGCGAAGAGATTTCCAGTCTATAATTTgt > 2:669216/4‑140 (MQ=255) gCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGgtg < 1:428701/140‑1 (MQ=255) gCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTATGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGgtg > 1:712137/1‑140 (MQ=255) gCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTACGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAACTgagc > 2:540664/1‑137 (MQ=255) gCTTGTGACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGgtg < 1:13627/140‑1 (MQ=255) tACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATCAGGATTGTCGTCTTCTGTGTCATTACAATGGCGTGATCCAGTATGCGCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAac < 2:206239/140‑1 (MQ=255) aCCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAaca > 2:589936/1‑140 (MQ=255) aaTGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACttt > 2:219134/1‑140 (MQ=255) aaTGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACttt < 1:518324/140‑1 (MQ=255) tGGAGGTTACATATAATGAATAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTGATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTtat < 1:616132/140‑1 (MQ=255) gaagTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTatat < 2:141428/137‑1 (MQ=255) gAGGTTACAGATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCTTTATCCATTATGCTCAGATATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTatat < 2:220755/140‑1 (MQ=255) aGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATAtt > 1:152221/1‑140 (MQ=255) ggTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTAGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATAttt > 1:570253/1‑140 (MQ=255) tACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGaa > 2:638110/1‑140 (MQ=255) aCATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAg < 2:305744/140‑1 (MQ=255) aCATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAg > 2:488592/1‑140 (MQ=255) tatatAATGATGAACAATAAAATTTTTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGt < 1:308772/139‑1 (MQ=255) cATATTATGAAGAACATTAAAATTTCTTGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGt < 1:33345/140‑1 (MQ=255) ataATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTAc < 2:405582/140‑1 (MQ=255) taATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATCGGCAATGACGATATTCGACTTCTTTTTCATAACAATGGCGTCATCTATTATGCTCTGAGTTTACCAGTCTAGAAGTTGTGTCTAACATTTTATTTTTGTATTTACa < 2:355293/140‑1 (MQ=255) gaagcaCAATAAGTGTTCTGGTTTTCAATGGGTAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATc < 2:112101/140‑1 (MQ=255) gaaCAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTAATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCAAATCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATATAg > 2:244921/1‑140 (MQ=255) aaccacaaaaTTTCTTGTTTTCCATGGGCCATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGTTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGc < 2:415360/134‑1 (MQ=255) aaCAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGCTCTAGc > 1:487830/1‑140 (MQ=255) aaaaaaaTTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCAcc < 2:565751/137‑1 (MQ=255) aaTAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCAcc < 2:104571/140‑1 (MQ=255) aaTAAAATTTCTGGATTTCAATGGGCAATGACGAATATCGACTTCTTTGTCATCACAATGGCGTTATCCATTATGCACCAAGATTTCAAGTAGATAATTCGGATCACACACTTTCTATTTGTAGTTACAGATATAGccac > 2:55299/1‑137 (MQ=255) aTAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCa > 1:146818/1‑140 (MQ=255) aTAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTAAAGACATAGccgca < 2:608706/140‑5 (MQ=255) aTAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAATTACACATCTAGCAACa < 2:608633/140‑1 (MQ=255) tAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTCCAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGACGATAATTAGTGTCAAACACTTTAAATTTGAAGTTACAAATCTAGCACCAt > 1:639920/1‑140 (MQ=255) tAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCNTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGAACTTGCACCAt > 2:374710/1‑140 (MQ=255) tAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGAGTTTCGTCTTCTTGGTCATTACAATGGCGTTATCCCTTAGTCGCAGAGATTCCTAATCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCAt < 1:169941/140‑1 (MQ=255) aaaaTTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTAACAGATCTAGCACCAtt > 2:464270/1‑140 (MQ=255) aaTTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTaa > 2:103639/1‑140 (MQ=255) tttCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACGATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAAtt < 2:496703/140‑1 (MQ=255) ttCTGGTTTTCAATGGTCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATtg < 1:470889/140‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATTCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATtgct < 1:387555/140‑1 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ttttCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCaa > 1:382657/1‑140 (MQ=255) aaTGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCAtt > 2:344631/1‑140 (MQ=255) tGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTg > 1:255023/1‑140 (MQ=255) ggCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACATATCTAGCCCCATCAATTTCTGCAATCCTTTGta > 1:131115/1‑140 (MQ=255) aaTGCCTATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATAc < 2:560465/140‑1 (MQ=255) aaTGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATAc < 2:404083/140‑1 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1:374348/138‑1 (MQ=255) tCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTc > 2:44758/1‑140 (MQ=255) cATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTcc < 1:589936/140‑1 (MQ=255) aTGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGc < 1:406489/140‑1 (MQ=255) aTGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGc < 1:120976/140‑1 (MQ=255) tGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTTGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGCa < 2:429603/140‑1 (MQ=255) tGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGCa > 2:523238/1‑140 (MQ=255) | CGGCTTGTAATATGTATAATTGTTACTAAAAGATATTTTGCTTGTTACCTAATGGAGGTTACATATAATGAAGAACAATAAAATTTCTGGTTTTCAATGGGCAATGACGATTTTCGTCTTCTTTGTCATTACAATGGCGTTATCCATTATGCTCAGAGATTTCCAGTCTATAATTGGTGTCAAACACTTTATATTTGAAGTTACAGATCTAGCACCATTAATTGCTGCAATCATTTGTATACTCGTTTTCAAATATAAAAAGGTCCAACTTGCA > CP000730/2454416‑2454689 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |