| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,856,087 | T→A | 100% | P80P (CCT→CCA) | USA300HOU_2698 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,856,087 | 0 | T | A | 100.0% | 258.1 / ‑6.5 | 85 | P80P (CCT→CCA) | USA300HOU_2698 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (47/37); minor base C (1/0); total (48/37) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
GATGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCTAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTAA > CP000730/2855952‑2856220 | gaTGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAAc < 1:689742/140‑1 (MQ=255) aTGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACg > 1:476881/1‑140 (MQ=255) cATGGCGGTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTCATAGAAGATGTGTCATGCAATAATGAGCCAAAAAGtta > 2:392397/1‑138 (MQ=255) aTGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaa < 2:531486/140‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCGGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGAAGAGGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaac > 1:421873/1‑140 (MQ=255) ggCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaaca > 2:718745/1‑140 (MQ=255) gTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAAt < 1:683648/140‑1 (MQ=255) gTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAAt < 1:614517/140‑1 (MQ=255) tGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGa < 2:279687/140‑1 (MQ=255) ggTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGAt > 1:394535/1‑140 (MQ=255) ccTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAGAACGTCAACAAATGATAGa > 1:182802/1‑140 (MQ=255) aaaGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAGCAAATGATAGAttt > 2:427248/1‑140 (MQ=255) aggcatatCAATATTGTAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAGGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTta < 2:487180/136‑1 (MQ=255) cTATAACAATATTGGAACAATCTTTATTTCATCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTtata < 1:227102/140‑1 (MQ=255) tataTCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAg < 2:379501/140‑1 (MQ=255) aaTATTGGAACAAGCTTTATTTAAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTa > 2:530248/1‑140 (MQ=255) atatTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATACGCCAAAACGTCAACAAAAGATAGACTTTATAATTGATA‑‑‑c > 1:148780/1‑140 (MQ=255) atatTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTAATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGGTGTGTCATGCAATCATGCGCCCAAACGCCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGCTA‑‑‑c > 2:562966/1‑140 (MQ=255) tatTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑ca > 1:201936/1‑140 (MQ=255) atTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑cag < 2:222642/140‑1 (MQ=255) ggAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAAACATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑cagcag > 1:264442/1‑140 (MQ=255) 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2:494272/1‑140 (MQ=255) tATTTCAGCACCAACTTCATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATAtt > 1:360860/1‑140 (MQ=255) tATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCAAAAACGTTAACAATTGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATAtt < 2:476881/140‑1 (MQ=255) tATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATACAATCATGCGCCAAAACGTCAACAATTGATAGATTTTCTAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAAATAtt > 1:321193/1‑140 (MQ=255) gCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAattat > 1:125295/1‑140 (MQ=255) ccAACTAAATTTTAAAACGGAAGTTTAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATGGGTGTGA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTAc < 1:208111/140‑1 (MQ=255) aCATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCAc < 1:382637/140‑1 (MQ=255) ttttAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCAc < 2:54241/140‑1 (MQ=255) tttAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGt > 1:392555/1‑140 (MQ=255) tttAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATATAAAAGAAGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACATTCACTGGt > 1:280715/1‑140 (MQ=255) tAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTa > 2:186541/1‑140 (MQ=255) aaaCGGAAGTTCAGTCCGCATTACCTTTTAAGTTACAAGGAAATGTGTCATGCAAGCAGGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTGA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGTTTaca > 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ttCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAattt > 1:211959/1‑140 (MQ=255) cattcatttttACTTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTTATGCTATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGACTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAatttat < 1:134534/131‑1 (MQ=255) cAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTATAAATGAaattat > 2:346587/1‑140 (MQ=255) tcatcaTTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTCTTTg > 1:143080/1‑140 (MQ=255) catcatTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTCAAACAGAAGTTCTTTgg > 2:571712/1‑140 (MQ=255) catTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGATTACAACAGAATTTATTTGGTCt > 1:421024/1‑140 (MQ=255) ttACCTTTTAAGTTACCAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGt < 2:221784/140‑1 (MQ=255) ttACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGt < 2:641871/140‑1 (MQ=255) tttcTTTTAAGTTAGCAGGAGATGTGGCATGCAATTATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTGCACTGGTTACAACAGAATGTATTTGGTCTGTc < 2:147288/137‑1 (MQ=255) tACCTTTTAAGTCAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAATAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTc < 1:437898/140‑1 (MQ=255) ccTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTccc < 1:515385/140‑1 (MQ=255) cTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCt < 1:131885/140‑1 (MQ=255) cTTGTAAGTTAACAGGAGATGTGTAGTGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCt < 2:427924/140‑1 (MQ=255) ttttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCTCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTg < 1:589956/140‑1 (MQ=255) tttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAATAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTgg < 1:530248/140‑1 (MQ=255) ttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGc < 2:649775/140‑1 (MQ=255) ttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGc < 1:130963/140‑1 (MQ=255) tcaGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGcc < 1:362958/138‑1 (MQ=255) gaGTTAACAGGGGATGTGTCATGCAATCATGCTCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTGTTTGGTCTGTCCCTGGCCg < 2:407789/139‑1 (MQ=255) ttAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCtt < 1:718745/140‑1 (MQ=255) ttAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCtt < 1:576598/140‑1 (MQ=255) aaCAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGGTATTATAGTTTTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTg > 2:541/1‑140 (MQ=255) aaCAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTg > 2:379004/1‑140 (MQ=255) aaCAGGAGATGTGTCATGCAATCAAGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTg > 1:465951/1‑140 (MQ=255) aGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACa > 2:287046/1‑140 (MQ=255) ggAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACat > 2:635699/1‑140 (MQ=255) ggAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGGCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACat > 2:514562/1‑140 (MQ=255) tgtgTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGCAAtatagg > 2:604168/1‑138 (MQ=255) tgtgTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACg < 2:174412/140‑1 (MQ=255) tgtgTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTAATTGATGCGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACg < 1:533925/140‑1 (MQ=255) gtgtCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGGCATATACgg > 2:73659/1‑140 (MQ=255) gtgtCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACgg > 1:475086/1‑140 (MQ=255) tttCATGCCATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTTGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGGCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGa < 1:392397/138‑1 (MQ=255) 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1:104659/140‑1 (MQ=255) tCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGAAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAatat > 2:637102/1‑140 (MQ=255) cATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATAtt < 1:186541/140‑1 (MQ=255) tGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTAACATATACGGACATCAAATATTaa > 2:647558/1‑140 (MQ=255) | GATGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCTAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTA‑‑‑CAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTAA > CP000730/2855952‑2856220 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |