| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | CP000730 | 76,353 | 0 | G | A | 48.5% | 70.2 / inf | 340 | intergenic (+411/‑723) | USA300HOU_0072/USA300HOU_0075 | universal stress protein/lysophospholipase |
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Only 100 of 340 total aligned reads displayed.
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(MQ=255) tAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCCAATTTGGGAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACATACA‑Caaaagt > 2:513467/1‑139 (MQ=14) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 2:606795/1‑141 (MQ=40) aaGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATa > 2:340738/1‑141 (MQ=38) agcGTGGTGTAAACGTGCATCATAGAACGGAATACTGGTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGATGTACATCAAAATAAAAgg < 1:514170/139‑1 (MQ=14) tcatcaTTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTCGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTta > 2:74668/1‑141 (MQ=255) atcatTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTtata > 1:589112/1‑141 (MQ=38) ttCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGt < 1:545556/141‑1 (MQ=39) aaaCGGTCCACCGTTGGGTTCAAGAACATGCCCCAATTTTATATCAAATTGGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGc < 2:353690/140‑1 (MQ=255) cGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCAt < 1:235743/141‑1 (MQ=39) | ATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCA‑TAAAAAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCAT > CP000730/76215‑76491 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |