| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,856,087 | T→A | 100% | P80P (CCT→CCA) | USA300HOU_2698 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,856,087 | 0 | T | A | 100.0% | 227.3 / ‑6.5 | 77 | P80P (CCT→CCA) | USA300HOU_2698 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base A (33/42); minor base G (0/1); total (34/43) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
ATGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCTAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTAATT > CP000730/2855953‑2856222 | aTGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGt < 1:506998/141‑1 (MQ=255) tGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCACCTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGACGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaaca > 1:445760/1‑141 (MQ=255) tGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGCTGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaaca > 2:352887/1‑141 (MQ=255) ggCGTCGGTCCTAAAGCTAGAGCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTcaacaa < 2:13117/141‑1 (MQ=255) cttGGTCCTCAAGCTTGAGCAATATTCGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGTAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATg < 2:152126/140‑1 (MQ=255) ttcgTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAATTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCAGGCGCCAAAACGTCAACAAATGa < 1:166704/138‑1 (MQ=255) ggTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATa < 2:203237/141‑1 (MQ=255) gTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGGGTCATGCAGACATGCGCCAAACCAGCAATAAATGATAg > 2:393942/1‑141 (MQ=255) ccTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGAt > 1:180750/1‑141 (MQ=255) ccTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATACAATCATGCGCCAAAACGTCACCAAATGATAGAt > 1:15163/1‑141 (MQ=255) aaaGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGAtttt > 1:661116/1‑141 (MQ=255) gCTATATCAATATTGGGACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAGCGGAAGTTCAGTCCTCATTACCTTTTAAGTTAACACGAGATGTGTAATGCAAACATGCGCCAAAACGACAACAAACGAACGATTTtaca > 2:527938/1‑139 (MQ=255) atatCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACCTTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGACACCAACTGATCGATTTTATAgtt > 1:502975/1‑141 (MQ=255) atCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAgttgt > 2:274517/1‑141 (MQ=255) atCAATATTGGAACAAGCGTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAGAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTTTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAgttgt < 2:160998/141‑1 (MQ=255) tCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAAAAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTAAACAAATGATAGATTTTATAgttgtt > 2:260347/1‑141 (MQ=255) atatTGGACCAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAATACGTAAGTTCATTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTAca < 2:129548/141‑1 (MQ=255) atatTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTAca > 2:460663/1‑141 (MQ=255) tatTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTAcag < 1:131177/141‑1 (MQ=255) atTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTAcagc < 1:527098/141‑1 (MQ=255) tGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGCTCTTATAGTTGTTAcagcag > 2:95228/1‑141 (MQ=255) ggaataacgattATTTCATCACCATATACATCTTAAAACGGAAGGTCAGTAAGAATTACCTGTACAGATAACTGTAGAGGTGTCATGCAGTCAGGAGACCAAGCGTCCACAAATGATAGATTTTATAGATGTTACcgcagc > 2:198001/11‑141 (MQ=255) ggAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACagcagc > 2:217069/1‑141 (MQ=255) aaCAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCAt < 1:325693/141‑1 (MQ=255) aCAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAACCGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCAtt > 1:55574/1‑141 (MQ=255) cAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTa < 1:255774/141‑1 (MQ=255) aaGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAg < 2:105726/141‑1 (MQ=255) aaGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAg < 2:608938/141‑1 (MQ=255) gCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAGCGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTGTGAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCGGCGTTAGat > 1:344447/1‑141 (MQ=255) gCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGGAGGTCAGTCATCATTACATTTTAAGTTAAAAGGAGATGTGTCATGCAAACATGCGCCAACACGTCAACAAATGATAGCTTTTATAGTCGTTACagcggcgtgaggg > 2:517212/1‑134 (MQ=255) cTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTTTAGTTGTTACAGCAGCATTAGata > 2:72658/1‑141 (MQ=255) tttATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACTGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCCATCACGCGCCGAAACGTCAACAAACCATCGATTTTATAGTCGTTACAGCAGCATTAGatat < 2:490952/141‑1 (MQ=255) tttATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGatat < 2:351598/141‑1 (MQ=255) ctctttcgcaaCCAACTAAATTTCTAAACGTACGTTCCCACATCATTATGCTATAAGTCAACAGGAGATGTGTCATGCAATCACGAGCCAAGACGTCAATAAATGATAGTTTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATAtt < 2:405732/131‑1 (MQ=255) tATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTg < 1:632160/141‑1 (MQ=255) gCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGCTGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAattatt > 2:201652/1‑141 (MQ=255) cACCAACTACATTTTTAAACGGAAGTTCAGTCATCATAACTTTATAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAACGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAAtcatta < 1:471706/141‑1 (MQ=255) ccAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTAGTTCCAGCAGACTTATATATTGAATTATTACg > 1:179752/1‑141 (MQ=255) aCTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTc < 2:180750/141‑1 (MQ=255) cATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTg > 2:590223/1‑141 (MQ=255) cATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGGGGTTATAACAGCATTAGATAATGAATTGATACGATCACTg > 1:494681/1‑141 (MQ=255) acgtacgTTCAGTTATCATTCCCCTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTacaaca < 1:198001/135‑1 (MQ=255) aCGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTacaaca < 1:217069/141‑1 (MQ=255) cGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATCTTGACTTCTTACGTTCCCTGCTTaccacac > 2:642258/1‑140 (MQ=255) gAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGaa < 2:647737/141‑1 (MQ=255) ttCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGGGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAattta < 1:304939/141‑1 (MQ=255) aGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATCGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAatttattt < 2:493613/141‑1 (MQ=255) tcatcaTTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTgg < 1:512341/141‑1 (MQ=255) atcatTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCCGCATTAGAGATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTc < 1:520176/141‑1 (MQ=255) atcatTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTc < 1:95964/141‑1 (MQ=255) catTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTTTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTg < 1:379025/141‑1 (MQ=255) tACCTTTTTAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTGCGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTcc < 2:573537/141‑1 (MQ=255) aCCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTccc > 2:419535/1‑141 (MQ=255) ccTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGCTAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTAACTGGTTACAACAGACTTTATTTGGTCTGTCCCt < 1:140390/141‑1 (MQ=255) cTTTTGAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTg < 2:28349/141‑1 (MQ=255) ttttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTgg > 2:626822/1‑141 (MQ=255) ttaagttaagAGGAGATGTGCCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGcc < 1:311985/141‑1 (MQ=255) ttAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGcc > 1:289418/1‑141 (MQ=255) tAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCg < 1:437622/141‑1 (MQ=255) aaCAGGGGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATCTTGAATCATTATGTTCATTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGATTTGa < 2:501114/141‑1 (MQ=255) aCAGGAGATGTTACATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTTCCTGGCCGCTTTGAc < 1:245202/141‑1 (MQ=255) cAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCATGGCCGCTTTGACa > 2:187752/1‑141 (MQ=255) agaTGTGTCATGGAACCATCCGCCAAAACGTCAACAAATGATCGATTTTATAGCTGTTAGAGCAGCATTAGATATTGCATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTCTTTGGTCTGTCCCTGGTCGCTTTGACAtata < 2:172115/141‑1 (MQ=255) gtgtgTCATGCAATCAGGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACg < 1:95228/140‑1 (MQ=255) gtgtCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGa > 2:172563/1‑141 (MQ=255) gtgtCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGa > 1:47853/1‑141 (MQ=255) ttgcATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGAGAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGAc < 1:98131/138‑1 (MQ=255) tgtCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGAc < 2:581762/141‑1 (MQ=255) ggtaaTGCAATCATGCTCCAAAACGTCCACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGAc < 2:511019/137‑1 (MQ=255) tCATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATCCGGACCt > 1:536276/1‑141 (MQ=255) cATGCAATCATGCGCCACAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCAGCTTTGACATATACGGACCta > 2:546060/1‑140 (MQ=255) cATGCAATCATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGAAccgc > 2:329555/1‑139 (MQ=255) tCATGCGCCAAAAAGGCAACAAATGCTAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATCTATTTGGTCTGTACCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATAtt < 2:502975/141‑1 (MQ=255) cATGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTa > 2:131267/1‑141 (MQ=255) aaTGCGCCAAAACGTCAACAAAGGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATCGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTa < 1:508093/140‑1 (MQ=255) aTGCGCCAAAACGTCAACAAATGATAGAGTTTATAGTTGTTAAAGTTATTGGAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTaa < 1:482899/141‑1 (MQ=255) gcgcCAAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTAAtt > 1:43558/1‑141 (MQ=255) | ATGCATGGCGTTGGTCCTAAAGCTATATCAATATTGGAACAAGCTTTATTTCAGCACCAACTACATTTTAAAACGGAAGTTCAGTCATCATTACCTTTTAAGTTAACAGGAGATGTGTCATGCAATCATGCGCCTAAACGTCAACAAATGATAGATTTTATAGTTGTTACAGCAGCATTAGATATTGAATTATTACGTTCACTGGTTACAACAGAATTTATTTGGTCTGTCCCTGGCCGCTTTGACATATACGGACCTCAAATATTAATT > CP000730/2855953‑2856222 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |