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(MQ=9) atGCATTGAGCTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGAGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGATCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCACTTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATaaa‑aaagctgat > 1:152901/1‑133 (MQ=11) tATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGCAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCGAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAC‑TAGCTAATTACAAATGGCGt < 1:207613/140‑1 (MQ=255) atTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCaa > 1:212882/1‑140 (MQ=40) gtggtgTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGaa < 1:113510/140‑1 (MQ=40) ggtgTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGaaaa > 1:89838/1‑140 (MQ=40) cGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCa > 1:303455/1‑140 (MQ=40) | TATGAACTATTTCAGATATAAACAATTTAACAAGGATGTTATCACTGTAGCCGTTGGCTACTATCTAAGATATGCATTGAGTTATCGTGATATATCTGAAATATTAAGGGAACGTGGTGTAAACGTTCATCATTCAACGGTCTACCGTTGGGTTCAAGAATATGCCCCAATTTTATATCAAATTTGGAAGAAAAAGCATAAA‑AAGCTAATTACAAATGGCGTATTGATGAGACGTACATCAAAATAAAAGGAAAATGGAGCTATTTATATCGTGCCA > CP000730/76214‑76490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |