| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,476,694 | T→C | 5.1% | N8444D (AAC→GAC) | ebh ← | extracellular matrix binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,476,694 | 0 | T | C | 5.1% | 240.7 / 2.8 | 79 | N8444D (AAC→GAC) | ebh | extracellular matrix binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (39/36); new base C (2/2); total (41/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.96e-01 | |||||||||||
TTCATTGATAATATTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTGTTTTAG > CP000730/1476554‑1476831 | ttCATTGATAATATTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGTTCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGAGCTATTTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGtt < 2:128325/141‑1 (MQ=255) ttGATAATATTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGc < 2:763899/141‑1 (MQ=255) taataTTTTTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTAt < 1:136329/141‑1 (MQ=255) taataTTATTTGAGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTCTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTGTCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCCTTGCTTGGGTAACCGAAt > 2:693092/1‑141 (MQ=255) actcacatgtGCGGCGTGAACAGCTTAATCATCGTTTTGTTCCGCTTGTTGATCTTCTTTGATATATTTGCCATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATTCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTAtt < 1:62445/132‑1 (MQ=255) aataTTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTAtt > 1:752455/1‑141 (MQ=255) aataTTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTAtt > 1:47193/1‑141 (MQ=255) atatTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTCTTc > 2:199777/1‑141 (MQ=255) attattTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGATCTGATTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTTGTTAAGTGTATTCGc > 2:509421/1‑141 (MQ=255) ttGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCAtttt > 2:714551/1‑141 (MQ=255) ttGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTGTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTGGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGTTTGCTTAAGCGGAATCGCAtttt > 2:77572/1‑141 (MQ=255) ggCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTGTTCGCATTTTGTTc > 2:196505/1‑141 (MQ=255) ggCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTc > 1:710945/1‑141 (MQ=255) ttGAACAGCTTGTTCATATTTTTGTTGCTCTGGTTTACCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAAt < 1:211043/141‑1 (MQ=255) gAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAAttt > 2:199366/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTGTTCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtga < 1:15928/141‑1 (MQ=255) aCAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATTTATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGAATTGCTCGGTTAGGCGTGTTCGCATTTTGTTCAATTtga > 2:366629/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtga > 1:630765/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtga > 2:486964/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTCAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtga > 2:487159/1‑141 (MQ=255) aCAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTCAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtga > 2:487161/1‑141 (MQ=255) aGCTTGAACAAAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATAAATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTCAACGTGTTCGCTTTTTGTTCAAtttacta > 2:678550/1‑137 (MQ=255) aGCTCGATCATAGTTTTGGTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTCGTTTCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTtgatg < 1:764088/141‑1 (MQ=255) ttgcttaTAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTCGATATCTTTGCTTTTTTCTTGAGTTGCTCCCTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCTCATTTTGTTCAATTTGATGAAc < 1:601614/135‑1 (MQ=255) ttGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAAc < 1:632344/141‑1 (MQ=255) tGAGCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACt < 1:219569/141‑1 (MQ=255) tAGTTTTGTTGCTCTTGTTTATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGtt < 1:417964/141‑1 (MQ=255) aGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTa < 1:233361/141‑1 (MQ=255) gTTTTGTTGCTCGGGTTGATCTTCGTTGATAGATTTGCTATTGGCTTTAGTTGCTGCGGTATCGTGAATGCTCTGTCTTGAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTAc < 1:664998/141‑1 (MQ=255) ttgttgTTCTGGTTGTCCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTTGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTaa < 2:289989/141‑1 (MQ=255) gttgCTCGGGTTGATCTTCGTTGACATCGTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAg > 2:749354/1‑141 (MQ=255) gCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGTACTGCAGTTACTAAAGTTg > 2:168997/1‑141 (MQ=255) ctctGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGc > 1:278185/1‑141 (MQ=255) tGGTTTATCTTCGTTGATATATTTGCTATTCGCTTTAGTCGCTGCGCTATCTTGAATGCTCAGTCTTAAACCATACATTTCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTCGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAgaaccagc < 2:118086/141‑8 (MQ=255) tGGTTGATCTTCGTTGATACCAGTTCGATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGc > 2:551340/1‑141 (MQ=255) ggTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGCCTCAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCt < 1:179742/141‑1 (MQ=255) ttGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGTTCTGGCCTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGt < 1:564192/141‑1 (MQ=255) ttGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGt > 1:635987/1‑141 (MQ=255) tGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTCAATGCACTGTCATAAACGATTCACTGCTCGGTTAAGCGTATTCGCTTTTGGTTCAATTGCATGAACTGCAGCTCCTGAAGTCGCGGCTGTa > 2:124825/1‑141 (MQ=255) tGATCTTCGTTGATATATTTCCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAAATGCAGTTACTAAAGTTGCAGATGTa > 1:467031/1‑141 (MQ=255) aTCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTGATCTTGAATGATTTATAATTAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGGTACTAAAGTTGCAGCTGTGAc > 1:529178/1‑141 (MQ=255) tCTTCGTTGATATATATGCTTTATGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACt > 2:751038/1‑141 (MQ=255) tCTTCGTTGATATAGTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGTTGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACt < 2:471072/141‑1 (MQ=255) ttCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTg < 2:647184/141‑1 (MQ=255) atatatTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCtttt < 2:668532/141‑1 (MQ=255) tatatTTGCTATTTGCTTTCGTAGCGGCGGTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGCACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTa > 2:356503/1‑141 (MQ=255) ttgctatttgctTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTTTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCt < 2:210926/141‑1 (MQ=255) ttgctatttgctTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCt < 1:451939/141‑1 (MQ=255) ttttgctTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGGTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGtttt < 2:457145/140‑1 (MQ=255) tgctTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTg > 2:735546/1‑141 (MQ=255) gctTTAGTTGCTGCGCTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTgg > 1:574844/1‑140 (MQ=255) ctTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTAGATGACCTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGATGTTTTTTGAg > 2:196048/1‑141 (MQ=255) tttAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTTTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAgg < 1:216988/141‑1 (MQ=255) gTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCa > 1:199775/1‑141 (MQ=255) ctgcGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTTGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTa < 2:685573/141‑1 (MQ=255) tgcGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTaa < 1:750725/141‑1 (MQ=255) tcgtgaggttGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAg < 2:777303/133‑1 (MQ=255) cGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGc > 1:159155/1‑141 (MQ=255) tATCTTGAATGCTCTTTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCTTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTg < 2:4988/141‑1 (MQ=255) tATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTg < 2:298994/141‑1 (MQ=255) tCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGtt > 2:715978/1‑141 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2:777527/141‑1 (MQ=255) aaaCCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAAttgcttgc < 1:618612/141‑1 (MQ=255) cATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCg < 2:514953/141‑1 (MQ=255) aTGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGc < 2:630765/141‑1 (MQ=255) aTGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGc < 1:486964/141‑1 (MQ=255) aTGCATTGCTTGGTCAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGc < 1:487161/141‑1 (MQ=255) aTGCATTGCTTGGTCAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGc < 1:487159/141‑1 (MQ=255) gCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCAt > 1:414401/1‑141 (MQ=255) aTTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTCCGTCACAttt > 2:563549/1‑141 (MQ=255) ttGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTg > 1:677426/1‑141 (MQ=255) tGGTTAAGGGGTTTCGCCTTTTGCTACATGTGATGAACTGCATTTACTAAAGTTGCAGCTGGAACTTGGTCTCTTAATGCTCTTTTTCGAGGTTCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTGTTTTa < 2:273700/141‑1 (MQ=255) ggTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTGttttgg > 1:94271/1‑139 (MQ=255) ggTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTGTTTTAg > 1:656745/1‑141 (MQ=255) ggTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTGGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGGCGCATTTGTTTTAg > 2:591009/1‑141 (MQ=255) | TTCATTGATAATATTATTTGCGGCTTGAACAGCTTGATCATAGTTTTGTTGCTCTGGTTGATCTTCGTTGATATATTTGCTATTTGCTTTAGTTGCTGCGTTATCTTGAATGCTCTGTCTTAAACCATGCATTGCTTGGTTAAGCGTATTCGCATTTTGTTCAATTTGATGAACTGCAGTTACTAAAGTTGCAGCTGTAACTTGGTCTTTTAATGCTGTTTTTTGAGGATCATTTAAGCTTGTTAAAGCATCAATTGCTTGCGTCGCATTTGTTTTAG > CP000730/1476554‑1476831 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |