| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,279,705 | G→A | 100% | intergenic (+1373/+6659) | mtlD → / ← glmM | mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase/phosphoglucosamine mutase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,279,705 | 0 | G | A | 100.0% | 285.6 / ‑6.5 | 95 | intergenic (+1373/+6659) | mtlD/glmM | mannitol‑1‑phosphate 5‑dehydrogenase/phosphoglucosamine mutase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base A (51/40); total (52/43) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTGCTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGT > CP000730/2279568‑2279841 | ttGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTTTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtg < 1:65733/141‑1 (MQ=255)ttGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtg < 1:516644/141‑1 (MQ=255)ttGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtg < 1:315454/141‑1 (MQ=255) gtgCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCTATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCAT‑TTCACTTAAAACCTGCATGAGCTTTCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACtgtt > 2:746072/1‑141 (MQ=255) ccGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTGGCGGTTTATCATTTGCATCAACATTTGCTGATGTTACTgttgtt > 1:15233/1‑141 (MQ=255) ccGTTATTAGGTGATTCTACTGCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATAGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTCGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTgttgtt > 2:570890/1‑141 (MQ=255) ttattaGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCa > 1:631791/1‑141 (MQ=255) taGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTg > 2:562479/1‑141 (MQ=255) gtttGATTCTACTTTTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGt < 2:776510/139‑1 (MQ=255) tttGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCTTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGtt < 1:136579/140‑1 (MQ=255) gTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGtt < 2:454670/141‑1 (MQ=255) aCTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTCATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATCAGCTTGCGGTTTATCATTTCCATCAGCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCAGCTGTTGCCGCAtga > 2:568473/1‑139 (MQ=255) aCTTCTGGTTTACTAGCTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCa < 2:514298/141‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCTATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCAc < 2:670657/141‑1 (MQ=255) cTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCAc < 2:704526/141‑1 (MQ=255) tCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCCTTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACta > 1:741117/1‑141 (MQ=255) tCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATTAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCTCCTGTTGCTGCATCACtt > 2:742027/1‑140 (MQ=255) tCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACta < 1:324879/141‑1 (MQ=255) tGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGCCTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACtatt > 1:768327/1‑141 (MQ=255) tGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCCCCTCACtatt > 2:350968/1‑141 (MQ=255) gTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACtattat > 2:545703/1‑141 (MQ=255) aCTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTgg > 2:136838/1‑141 (MQ=255) cTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATGAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCTTCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGgt < 1:500219/141‑1 (MQ=255) ttACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTCTTATTTGGtgttg > 1:93434/1‑141 (MQ=255) aTCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCgg > 1:483636/1‑141 (MQ=255) tCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTCTTATTTGGTGTTGTCggg > 2:136657/1‑140 (MQ=255) cGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGgag > 2:270447/1‑141 (MQ=255) gTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGgaga > 2:369861/1‑141 (MQ=255) tATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGGTGTTACTGTTGTGTCACCTGTTTCCGCATCAGCATTTTTTGGTGTTGTCggggcag > 2:492632/1‑136 (MQ=255) tATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCTGCCTCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAg > 2:35568/1‑141 (MQ=255) ccaataggcGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCCCTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAcgcg > 2:201135/9‑141 (MQ=255) cctttGTCGGACTGTTTGTTTATTCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGt < 2:184310/138‑1 (MQ=255) ccATTGTCGGACCGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGt < 2:149583/141‑1 (MQ=255) ccATTGGCGGGCTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGTTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCGGTTGCTGATGTTACTGTCGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGt < 2:509232/141‑1 (MQ=255) ttttCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTg < 2:35128/138‑1 (MQ=255) ttGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTg < 2:458369/141‑1 (MQ=255) ttGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTg > 2:447466/1‑141 (MQ=255) gTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTGTTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCt > 1:273505/1‑141 (MQ=255) gACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGc > 1:714069/1‑141 (MQ=255) aCTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGcc > 2:447530/1‑141 (MQ=255) cTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCa > 1:586909/1‑141 (MQ=255) tgtttgttGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTCTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCAt < 1:473984/141‑1 (MQ=255) ttgATGCATCTACAC‑TAGTATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTg < 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c‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGATGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACg > 1:332865/1‑141 (MQ=255) c‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACg > 1:698598/1‑141 (MQ=255) c‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATAATTCGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACg > 2:512762/1‑141 (MQ=255) aaTTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAg < 1:317334/141‑1 (MQ=255) aTTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAgg < 1:746072/141‑1 (MQ=255) tttattaGCTTGTGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTCCTTTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTg < 1:63940/140‑1 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2:275793/141‑1 (MQ=255) gCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTa > 2:399680/1‑141 (MQ=255) cTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAt > 1:496986/1‑141 (MQ=255) cTTGCGGTTTATCATGTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAt < 1:188028/141‑1 (MQ=255) ttGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAtt > 2:344811/1‑141 (MQ=255) tGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAttt > 2:229899/1‑141 (MQ=255) gtggTTTTTCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAtttt < 2:681005/139‑1 (MQ=255) cGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTGCTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTAttttt > 2:649897/1‑140 (MQ=255) cGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTc < 2:767259/141‑1 (MQ=255) ggTTTATCATTTGTATCATCAGTGGCTGAGGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATCCGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCt > 2:151292/1‑141 (MQ=255) ggTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCt > 2:443766/1‑141 (MQ=255) tATCCTTTGCATCATCAGTTGCTGAGGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTGGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGgtg < 1:124759/141‑1 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1:525648/1‑141 (MQ=255) tttGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCa > 1:674420/1‑141 (MQ=255) tttGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTAGTCTCAGATACGTTTGGTTGTCAAGTATTTTCTGGTGTTGCa > 2:447941/1‑141 (MQ=255) ttGCATCATCAGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCAt > 1:425407/1‑141 (MQ=255) tgcactatcaGTTCAGGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCAtt < 1:262265/135‑1 (MQ=255) catcaGTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCAt > 2:482880/1‑141 (MQ=255) gTTGCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTCTTGCATTAGCATTTGaa < 2:586909/141‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGTTACTGTGGTTTCCCCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGaa < 1:286259/141‑1 (MQ=255) gCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAAttt < 1:270447/141‑1 (MQ=255) gCTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAAttt > 1:706859/1‑141 (MQ=255) ttGATGTTGCTTTTTTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTg < 2:602842/140‑1 (MQ=255) ttGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTTTTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTg < 2:640101/140‑1 (MQ=255) cTGTTGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTg < 2:730969/141‑1 (MQ=255) cTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTg < 1:313500/141‑1 (MQ=255) cTGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTg < 1:99728/141‑1 (MQ=255) tgatgaTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGc < 1:208450/141‑1 (MQ=255) tGATTTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAAGTTGc < 2:537438/141‑1 (MQ=255) tGATGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCTCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGc < 2:238989/141‑1 (MQ=255) tGTTACTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCGCTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATGCGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGt > 2:110889/1‑141 (MQ=255) | TTGTGCCGTTATTAGTTGATTCTACTTCTGGTTTACTAGTTACATCGTTATCCATTGTCGGACTGTTTGTTGATGCATCTACAC‑TAGAATTGTTATTAGCTTGCGGTTTATCATTTGCATCATCAGTTGCTGATGTTGCTGTTGTTTCACCTGTTGCCGCATCACTATTATTTGGTGTTGTCGGAGAAGCGTCTGCTTTGCCATTAGCTGTCGTCTCAGATACGTTAGGTTGTCCAGTATTTTCTGGTGTTGCATTAGCATTTGAATTTGCTGT > CP000730/2279568‑2279841 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |