| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,360,799 | A→G | 100% | G66G (GGT→GGC) | adk ← | adenylate kinase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,360,799 | 0 | A | G | 100.0% | 99.1 / ‑6.5 | 37 | G66G (GGT→GGC) | adk | adenylate kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (16/18); total (19/18) | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: E-value score below prediction cutoff. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
| Rejected as polymorphism: Variant not supported by required number of reads on each strand. | |||||||||||
TGATGACAGCATCAATGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATACCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAATGTGGGGTATTGGGAATTTCTTGA > CP000730/2360663‑2360935 | tgatgaCAGCATTAATGTTTCTGTCAAGCTCAGAGATTATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCt < 2:275788/140‑1 (MQ=255) gatgaCAGCATCAATGTTTACCTGCACCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTa > 1:354306/1‑140 (MQ=255) gCATCAATGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCaa > 1:294733/1‑139 (MQ=255) aTCAATGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCGACAGTCACtt < 2:159111/140‑1 (MQ=255) tCAATGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTtc < 1:287847/140‑1 (MQ=255) aTGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCCCTtcatc > 2:337762/1‑140 (MQ=255) cTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATGTAATAAAAAGCCTTTTTTTGGATGGTCTTCAGAACTTCTTTCTTTAACGATTCTTACAGTCACTTAATGAgggca > 2:83327/1‑137 (MQ=255) atcTCAGACATAACATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTGGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTc < 1:333108/138‑1 (MQ=255) aGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAACTTCTTCACTTAACAAGACCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTc > 1:274745/1‑140 (MQ=255) cAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGccc < 2:255090/140‑2 (MQ=255) cAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATAAGGAACTAATTCGCCa < 1:176578/140‑1 (MQ=255) cATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTAATCAGGAACTAATTCGCCACGGt > 1:20397/1‑140 (MQ=255) atatTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCTTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTAGCAAAGGTCCat > 1:109533/1‑140 (MQ=255) tAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACt < 1:277768/140‑1 (MQ=255) aaTGCCGCAGCTTGCATGGTTGGTCTTGGGAAGCCATCGAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATGCTTTCCGTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACtt < 1:312849/140‑1 (MQ=255) tCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTGGACACGGTCCATATAAGAATTAGctta > 2:103655/1‑139 (MQ=255) tCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCCCGGCCCAAATAAGACTTAGcttc > 1:92979/1‑140 (MQ=255) tGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTAcc < 1:42125/140‑1 (MQ=255) tGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCGTCAGTAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACACTCCCTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAATACTAAGCTTCTTTAcc > 2:37711/1‑140 (MQ=255) gCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGAAATTAACAAACACGTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTCCCt > 1:350686/1‑140 (MQ=255) aTTGTTCTTGGGAAGCCATCTGATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTc < 1:71921/140‑1 (MQ=255) ttGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCa > 2:269244/1‑140 (MQ=255) tCTTGGGAAGCCATCTAATAAAGATCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTAAAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGttt < 1:95951/140‑1 (MQ=255) cTTGGGAAGCCATCTAATAATAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTAAGTttc > 1:225298/1‑140 (MQ=255) cTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTttc > 1:251570/1‑140 (MQ=255) aGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTTAGTTTCTTCtttt > 1:7760/1‑140 (MQ=255) gCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTta < 2:319116/140‑1 (MQ=255) aaGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGaa > 2:59948/1‑140 (MQ=255) ttttttGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTAATAGCTTTTCTGCACATgcc > 1:106451/1‑138 (MQ=255) gCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCCGt > 1:357109/1‑140 (MQ=255) aTCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATTCATATGCTGAACATGTCACCAGTTg > 2:249016/1‑140 (MQ=255) tCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTCATTCGCCCCGGTCCATATAAGACTTCGCTTCTTTACCTATTTCGGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAAtgtg < 1:70800/140‑1 (MQ=255) tCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAAtgtg < 2:320218/140‑1 (MQ=255) tCAGAAATTCTTTCCTTAACGATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATCCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCCCCAGTTGAAAtgtc < 2:314110/140‑2 (MQ=255) gtcTTATCGAGGCCGACAGTCACTTCATCTGGACCTAATTTGCCACGGTCCATATAACACTTAGCTTCTTTACCTCATTCCGTTTCTTCTTTAATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAATGTGGGGTATTGGGaa < 2:87639/138‑1 (MQ=255) gctttAACGATGCCTACAGTCTCTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATCGCTCTAGTTGAGATGTGGGGTATTGGGaa < 2:148083/137‑1 (MQ=255) gATGCCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAATGTGGGGTATTGGGAATTTCTTGa < 1:341207/140‑1 (MQ=255) | TGATGACAGCATCAATGTTTCTGTCAAGCTCAGACATAATATTATTTAATGCCTCAGCTTGCTCGATTGTTCTTGGGAAGCCATCTAATAAAAAGCCTTTTTTTGCATCGTCTTCAGAAATTCTTTCCTTAACGATACCTACAGTCACTTCATCAGGAACTAATTCGCCACGGTCCATATAAGACTTAGCTTCTTTACCTAATTCAGTTTCTTCTTTTATAGCTTTTCTGAACATGTCACCAGTTGAAATGTGGGGTATTGGGAATTTCTTGA > CP000730/2360663‑2360935 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |