| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 1,103,793 | G→T | 8.5% | A67S (GCG→TCG) | phdB → | pyruvate dehydrogenase (acetyl‑transferring) beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 1,103,793 | 0 | G | T | 8.5% | 192.4 / 6.2 | 70 | A67S (GCG→TCG) | phdB | pyruvate dehydrogenase (acetyl‑transferring) beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (38/26); new base T (4/2); total (42/28) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
GTTTTAATTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTAAAACTG > CP000730/1103664‑1103925 | tttttAAGTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGAAAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAAGAATGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCtt < 2:635395/140‑1 (MQ=255)gTTTTAATTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCTATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCtt < 2:450453/141‑1 (MQ=255)gTTTTAATTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTGGCTGAATCAGGTATGGGTGGTTTAGCGATGGGTCtg > 1:293997/1‑140 (MQ=255) ttttAATTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGGAGTACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTGTTGGTGGTTTAGCGGTGGGTCTTg > 2:158874/1‑141 (MQ=255) tAAGTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAg < 2:469551/141‑1 (MQ=255) ataTTTTTGGTGAAGACGTGGGTGCTAACGGGGGTGTTTACCGAGATCATGAAGGACTACAAAAAG‑CCTTCGGTGAAGATCGAGTACTCGATACACCTTTCGCTGAATCAGGTATTGGTGCTTTAGCGATGGGTCTTGCAg < 1:487395/139‑1 (MQ=255) tttttGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTg > 2:648029/1‑141 (MQ=255) ttGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAg > 2:89606/1‑141 (MQ=255) ttGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAg < 1:429192/141‑1 (MQ=255) ttGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGAGGGGTCTTGCAGtgtacg > 2:226739/1‑136 (MQ=255) tggttgaGACGTTGGTGTTAACTGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGAGTGAGAAATG‑GGTTTGGTGATGATAGAGTATTCGATGCACCTTTAGTTAATTCAGGTATTGGTGGTTGAGCGGTGTGTGTTGCGGTTGGAgg > 2:534526/7‑141 (MQ=255) tGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAgg > 1:629491/1‑141 (MQ=255) tGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGCGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AAATTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGAGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGaacg > 2:677985/1‑139 (MQ=255) ggTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGa < 1:412016/141‑1 (MQ=255) ggTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGGTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGa > 1:338948/1‑141 (MQ=255) gtaaGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGAtt < 2:515928/139‑1 (MQ=255) ggAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTGTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGAtt < 2:329509/140‑1 (MQ=255) gAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATCCACCTTTACCCGAACCAGGTATGGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATtc > 1:226395/1‑141 (MQ=255) gAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTATCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATtc > 1:547652/1‑141 (MQ=255) aggcGTTGGTGTTACCGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AAGTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATtccg < 1:288031/138‑1 (MQ=255) aGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTAAGTGTTACTCGATGATTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATtccg < 1:534549/141‑1 (MQ=255) aaCGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGGTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGaa > 2:690195/1‑141 (MQ=255) gtgtTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAAt > 1:587587/1‑141 (MQ=255) tgtTTTCCGCGTTACTGAAGGACT‑CAAAAAGCAATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAAtt > 1:510140/1‑141 (MQ=255) ttttCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGGAGATAGAGTGTTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGACGGATTCCGTCCGGTTATGGGGGTGCAAtttt > 2:2753/1‑139 (MQ=255) ttttCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTAAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCt > 1:447667/1‑141 (MQ=255) tgtTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTATCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGCTTCCGTCGGGGTATGGAAGTACAATTCTTGGGttt > 1:189228/1‑141 (MQ=255) tgtTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGttt > 1:563537/1‑141 (MQ=255) tgtTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTGTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTATCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCATCCGGTTATGGAAGTACATTTCTTAGGttt > 2:441097/1‑141 (MQ=255) tgtTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTAGTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGttt > 2:348225/1‑141 (MQ=255) gtTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGAGGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACCATTCTTAGGTTTc < 1:538251/141‑1 (MQ=255) cAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACCATTCTTAGGTTTCGTCTTCGAAGTAttt > 2:436409/1‑141 (MQ=255) aaaaaG‑AATTTGGTGAAGATTGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATACTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTg > 1:421153/1‑141 (MQ=255) aaaaaG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGCATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACACGTCCTAGGTCTCGTATTCGAAGTAGTTg > 2:693133/1‑141 (MQ=255) agg‑AATTTGTTGAAGATAGAGTATTCGCTACGCCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATg < 2:528100/139‑1 (MQ=255) aaG‑TATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACATTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTTCGGTTGTGGTAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATatgatg > 2:507519/1‑141 (MQ=255) aaG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACGATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGCTg > 2:28722/1‑141 (MQ=255) aaG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATg > 1:269715/1‑141 (MQ=255) g‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCg < 1:603758/141‑1 (MQ=255) aaaTTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCg < 2:170151/140‑1 (MQ=255) aaTTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGa < 1:404788/141‑1 (MQ=255) aaTTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGa < 1:479478/141‑1 (MQ=255) ttGGTGAAGGTAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAAGCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTCGGTCTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTg < 2:667541/141‑1 (MQ=255) ttGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTg > 1:678635/1‑141 (MQ=255) gTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGGTGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTg > 1:11355/1‑141 (MQ=255) gTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCTAAGTATTTGATGCGATTGCTg > 1:72737/1‑141 (MQ=255) gTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTTATGCGATTGCTg > 2:118225/1‑141 (MQ=255) gAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTg < 1:111636/139‑1 (MQ=255) gAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGa < 1:293728/141‑1 (MQ=255) gAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGa > 2:156227/1‑141 (MQ=255) gAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGGTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTg > 2:111636/1‑139 (MQ=255) gAAGACAGAGGATCCGATACACATTTACTTGAAGCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCGTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGa < 1:256411/141‑1 (MQ=255) gATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACaa > 2:184413/1‑141 (MQ=255) agagTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTCGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAAtt > 1:16347/1‑141 (MQ=255) gATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACt > 1:520110/1‑141 (MQ=255) tACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCg > 2:30412/1‑141 (MQ=255) cacCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGtt < 2:269715/141‑1 (MQ=255) ccTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTc > 2:524455/1‑141 (MQ=255) tGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTGGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAACTTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAgg > 2:587431/1‑141 (MQ=255) aagaaGGTATTGGTGGTTTAGCGATCGGTCTTGCATTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCg < 2:99668/137‑1 (MQ=255) aGGTATTGGTGGTTTATCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTAc > 2:165551/1‑141 (MQ=255) ttcagctgttgtTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTAGTCGTTTCCGTTCAGGGGGTACt > 2:180645/11‑141 (MQ=255) ggTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGGAGTTGAGGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTGAGGTTTCGTATTCGAAGTGGTTGAGGCGTTTGCTGAACAAATAGCACGTACTCGTTTCCGTACGGGCGCTAca > 2:301237/1‑140 (MQ=255) ggatgggtggtTTATCGATTGGTTTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATGCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTa < 2:17720/136‑1 (MQ=255) ggaTTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTGCGTTCAGGCGGTACTa < 1:348225/139‑1 (MQ=255) gTATTGGTGGTTTGGCGGTGGGTTTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTa < 2:74298/141‑1 (MQ=255) gTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTa < 2:563537/141‑1 (MQ=255) gTATTGGGGGTTTGGGGTTGGGTTTTGCAGTGGTAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTa < 2:74326/141‑1 (MQ=255) ttGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTaaaa > 2:9498/1‑141 (MQ=255) gtggtTTATCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTAAAACTg < 1:165551/141‑1 (MQ=255) | GTTTTAATTTTTGGTGAAGACGTTGGTGTTAACGGCGGTGTTTTCCGTGTTACTGAAGGACTACAAAAAG‑AATTTGGTGAAGATAGAGTATTCGATACACCTTTAGCTGAATCAGGTATTGGTGGTTTAGCGATGGGTCTTGCAGTTGAAGGATTCCGTCCGGTTATGGAAGTACAATTCTTAGGTTTCGTATTCGAAGTATTTGATGCGATTGCTGGACAAATTGCACGTACTCGTTTCCGTTCAGGCGGTACTAAAACTG > CP000730/1103664‑1103925 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 13 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |