| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,502,114 | A→C | 4.7% | H213P (CAT→CCT) | USA300HOU_2364 → | AraC transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,502,114 | 0 | A | C | 4.7% | 240.6 / 4.5 | 85 | H213P (CAT→CCT) | USA300HOU_2364 | AraC transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/41); new base C (2/2); total (42/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.56e-01 | |||||||||||
AAAGATATAGCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACAC > CP000730/2501975‑2502253 | aaaGATATAGCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACAt < 2:494877/141‑1 (MQ=255)aaaGATATAGCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACAt < 1:74169/141‑1 (MQ=255) gATATAGCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCt < 2:263885/141‑1 (MQ=255) atggCGTTGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACCTTCTAtt < 2:767/138‑1 (MQ=255) ggCGATGCATAGCAACATCTCTTATTCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTAc < 2:256323/140‑1 (MQ=255) atcGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTAc < 2:20476/139‑1 (MQ=255) gCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACa > 2:275590/1‑141 (MQ=255) gCGATGCATTGCAACATCTATGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTAAGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACa > 2:478275/1‑141 (MQ=255) aTGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACt > 1:591385/1‑141 (MQ=255) tcATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGt < 2:270909/140‑1 (MQ=255) ttGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTGATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATCAATTTTAATGATTATTTTACAGGTATTAAACTTGTTAACTCCTTCATTTTATTACTTTCTACAATACATTTTATTACAAATGTTTc > 1:450106/1‑141 (MQ=255) ttGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTgaatt > 1:674431/1‑137 (MQ=255) cAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACCTTCTATTACa > 2:242602/1‑130 (MQ=255) cAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACCTTCTATTACa < 1:242602/130‑1 (MQ=255) aTCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAACTGTGGCTATTCCGTCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTg > 1:331918/1‑141 (MQ=255) aTCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAAAGGCAGGTATTTAAGACTTTCTACAAAAAATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTg > 1:677634/1‑141 (MQ=255) aTCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTCCGATCT‑TTGAGTCTCAATGTAGGGGCCAATTTTGTACGTATTAAACTTGTTATCGCCATCTATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTg < 2:664673/141‑1 (MQ=255) ttctGAACCATATTGTTCTAATCTTTTTTTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGc < 2:155947/140‑1 (MQ=255) ctGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATGT‑TTGAGTTTGAATTTTAAAGATTATTTTACACGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCg < 1:298640/141‑1 (MQ=255) ctGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCg < 2:678975/141‑1 (MQ=255) aaTCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTTTTTTT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGTccttgt > 2:353376/1‑137 (MQ=255) aaTCATATTGTTCTAATCTTATTATT‑GTTGTGGTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACTAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTAAAACTGTTTCTGAAttttccgttt > 2:149413/1‑133 (MQ=255) atTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACa > 1:664897/1‑141 (MQ=255) ttAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATa < 2:227493/140‑1 (MQ=255) ttAATCTTTTTGTTCGATAT‑TGGAGTATGAATTTTAAAGAGTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATa < 1:170475/140‑1 (MQ=255) cTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATa < 2:571727/141‑1 (MQ=255) aaTCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCCGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACa > 1:395976/1‑141 (MQ=255) aTCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTTAATTGGCCGGTTTTAACAGTCAtcaaa > 2:187451/1‑137 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTAGAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAAt > 2:354873/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGTATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAAt > 2:416052/1‑141 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTGTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAAt < 1:147096/141‑1 (MQ=255) cTTTTTGTTCGATAT‑CTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTGCAAAACAATCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAAt > 1:512278/1‑141 (MQ=255) ttGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTg > 1:276130/1‑141 (MQ=255) gTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCa > 1:100388/1‑141 (MQ=255) gTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCa > 1:639898/1‑141 (MQ=255) ttCTATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAAAAGTCATACAAATTTTGCaa > 2:409624/1‑141 (MQ=255) ttCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCaa > 2:653750/1‑141 (MQ=255) tat‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCaa < 1:526233/141‑1 (MQ=255) tat‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCaa < 1:526610/141‑1 (MQ=255) tGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATCCAAATTTTGCAAATCAATTTa > 2:540579/1‑141 (MQ=255) aGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAg > 1:637489/1‑141 (MQ=255) aTGAATTTTAAAGATTAGTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAAGTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAAt < 2:449686/141‑1 (MQ=255) gAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTAATTTCTGCAAGACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTACAAGGCATACCAATTTTGCAGATAAGTTTatcgattc > 1:576814/1‑134 (MQ=255) ttttAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTACGAATTACtt > 1:557192/1‑141 (MQ=255) ttAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGc < 1:556230/141‑1 (MQ=255) tAAAGAGTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCa < 2:141755/141‑1 (MQ=255) ttttACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTcc > 2:240125/1‑141 (MQ=255) ttACAAGTATTAAACTTGTTAACCCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAATTCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTa > 2:631960/1‑141 (MQ=255) aCAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTaaa < 1:593961/141‑1 (MQ=255) aCAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTaaa < 1:611980/141‑1 (MQ=255) aGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAg < 2:638570/141‑1 (MQ=255) tATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGtt > 1:213468/1‑141 (MQ=255) tATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGtt > 1:213517/1‑141 (MQ=255) aaCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAATAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGtt > 2:160595/1‑141 (MQ=255) aCTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTTCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTc < 2:677982/141‑1 (MQ=255) ttGGTAACCCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTTTTACAACTTTTTCCGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATAAAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTTCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTccc < 2:395976/141‑3 (MQ=255) tGTTAACGCCGTCAATTTAGTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTTTTTCTGCAGTGGCCGGTTTGAACAGTCATACAAGTCTGGCAAAGCAATTTAAGAAGTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACt < 2:92880/141‑1 (MQ=255) tGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACt > 1:621388/1‑141 (MQ=255) gTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACCTTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTc > 1:661871/1‑141 (MQ=255) ttAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCg < 2:90380/141‑1 (MQ=255) aCGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGttt > 1:94058/1‑141 (MQ=255) cGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTc > 2:10366/1‑141 (MQ=255) cGCCATCAATTCATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTc > 1:291582/1‑141 (MQ=255) aTCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAg > 2:667145/1‑141 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTGTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa > 2:320663/1‑141 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCGAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACCCGTTTCCAAGATTa < 1:363289/141‑1 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa < 1:70303/141‑1 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa < 1:70543/141‑1 (MQ=255) aTTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa < 1:615649/141‑1 (MQ=255) aTTTATTACGTTCTACAAAACATTCTAGTACAACTGTTTCTGAGTTGGCCGGGTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTGAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTa > 2:686148/1‑141 (MQ=255) tttATTACTTTTGACAAAACATTCTATTACGACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTAc < 2:439852/141‑1 (MQ=255) tttATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTAc < 2:34815/141‑1 (MQ=255) tattaCTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAAGAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAACATTACTg < 2:490016/141‑1 (MQ=255) cTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAacca < 1:168636/141‑1 (MQ=255) ttCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAaccacc > 1:633544/1‑141 (MQ=255) tctcCAAAACATTACTTTACAACGATTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTCGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAAccacca < 2:450106/141‑1 (MQ=255) aaaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATa < 2:9243/141‑1 (MQ=255) aaaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATa > 2:32538/1‑141 (MQ=255) aaaCATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATa > 1:398409/1‑141 (MQ=255) cATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCTGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATacac < 2:77247/141‑1 (MQ=255) cATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAACCAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATacac < 2:610184/141‑1 (MQ=255) cATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATacac < 2:379373/141‑1 (MQ=255) cATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATacac < 2:208560/141‑1 (MQ=255) cATTCCATTACAACTGTTTCTGAATTGGACGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGCTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATacac < 1:394219/141‑1 (MQ=255) cATCCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATATTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTACTAAACAGTTCCGTCCACTAGCATTCCACAGTACTGCACCACCACACATacac > 2:283127/1‑141 (MQ=255) | AAAGATATAGCGATGCATTGCAACATCTCTGAATCATATTGTTCTAATCTTTTTGTTCGATAT‑TTGAGTATGAATTTTAAAGATTATTTTACAAGTATTAAACTTGTTAACGCCATCAATTTATTACTTTCTACAAAACATTCTATTACAACTGTTTCTGAATTGGCCGGTTTTAACAGTCATACAAATTTTGCAAATCAATTTAAGAATTACTTGCATTTTAGTCCTAAACAGTTCCGTTCACTCGTTTCCAAGATTACTGAACCACCACAAATACAC > CP000730/2501975‑2502253 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |