| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP000730 | 2,343,438 | C→T | 32.9% | intergenic (+114/+250) | USA300HOU_2200 → / ← alsD | hypothetical protein/acetolactate decarboxylase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP000730 | 2,343,438 | 0 | C | T | 32.9% | 91.7 / 55.7 | 79 | intergenic (+114/+250) | USA300HOU_2200/alsD | hypothetical protein/acetolactate decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/27); new base T (12/13); total (36/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.52e-01 | |||||||||||
AAACAGATACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGTAATTAT > CP000730/2343298‑2343576 | aaaCAGATACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATAc < 1:521604/141‑1 (MQ=255)aaaCAGATACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATAc < 2:521850/141‑1 (MQ=255) gATACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAg < 1:399784/141‑1 (MQ=255) aTACGAATTGTAGTTAAATACTAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGt < 1:657079/141‑1 (MQ=255) aTACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGt < 1:41926/141‑1 (MQ=255) tACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTTTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTa > 2:321969/1‑141 (MQ=255) tACAAATTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAAGAGTa < 2:629973/141‑1 (MQ=255) aTTGTAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGACAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAAttt > 1:862123/1‑141 (MQ=255) tAGTTAAATAATAATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTATTAACAGATTGGCCTTTACAATATTTAATTTtatt > 1:152393/1‑140 (MQ=255) aGTTCAATAAAAATTTGAAAATAGTTTTATAGGTCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTatat < 1:112875/141‑1 (MQ=255) aGTTAAATAATTATTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTatat < 1:543671/141‑1 (MQ=255) gTTAAATAATAATTTGAACATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATg > 2:776178/1‑141 (MQ=255) aataatTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGCATTTTTACTTTTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAgtgtgt < 1:432663/141‑1 (MQ=255) ataatTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTa < 1:461698/141‑1 (MQ=255) ataatTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTa < 1:776427/141‑1 (MQ=255) ataatTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAAATTTATATTATTATGTa < 2:886322/141‑1 (MQ=255) atTTGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATCGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACca < 2:748131/141‑1 (MQ=255) tttGAAAATAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACcac < 1:714155/141‑1 (MQ=255) aaaTAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTAGCACAAttt > 2:692284/1‑141 (MQ=255) aaaTAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTGTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAAttt < 2:129623/141‑1 (MQ=255) aaTAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTta > 2:397843/1‑141 (MQ=255) aaTAGTTTTAGAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTta < 1:77104/141‑1 (MQ=255) aaTAGTTTTAGAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTta < 2:576567/141‑1 (MQ=255) aTAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAGTTTGATATGAGTGTGTACCACAATTtat < 1:577239/141‑1 (MQ=255) aTAGTTTTATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTtat < 1:624354/141‑1 (MQ=255) ttATAGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTa < 2:489295/141‑1 (MQ=255) tataGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTTTAATCTaa > 2:787635/1‑141 (MQ=255) tataGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTaa > 2:386923/1‑141 (MQ=255) ataGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTaaa < 1:806222/141‑1 (MQ=255) ataGGGCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTaaa < 2:434576/141‑1 (MQ=255) ggCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATa > 1:422571/1‑141 (MQ=255) gCAAGCGCTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATaa > 2:584038/1‑141 (MQ=255) cgcTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATCGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCa > 2:299327/1‑141 (MQ=255) cTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTCGTAACAGAGTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCaaa > 2:548163/1‑141 (MQ=255) cTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCaaa > 2:580738/1‑141 (MQ=255) cTGAAAAATTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGAGTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCaaa > 2:907722/1‑141 (MQ=255) cTGAAAAATTGGCGATTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAAGCGATTAGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAAAAGCaaa > 2:548015/1‑141 (MQ=255) aTTTGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCGTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCaac < 2:804224/141‑2 (MQ=255) aTTGGCGTTTGTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCaaa > 2:32544/1‑141 (MQ=255) ggCGTTTCTCTTTTTAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAatat < 2:743613/141‑1 (MQ=255) gTTAGTCTTTTTAATTATTGAACTTGTAAATTATGGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAGAATTTCGATGAGTGTCTACCACACTTTATAATCTAAACATAAAAGaaagactgcaacatcag > 2:166406/1‑127 (MQ=255) ttAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCtaata < 1:862274/141‑1 (MQ=255) tAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCtaataa < 2:734637/141‑1 (MQ=255) tAGTTATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCtaataa < 1:820524/141‑1 (MQ=255) tATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGCGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACACCCAACCTCCAATATCTG‑GAACCTAATAAATcc > 2:145255/1‑141 (MQ=255) tATTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATcc > 2:145280/1‑141 (MQ=255) ttttttcTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTATCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATccc > 2:255808/7‑141 (MQ=255) aTTGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAATTATCTG‑GAACCTAATAAATacc > 1:83411/1‑141 (MQ=255) ttGAACTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATcccc < 1:635302/141‑1 (MQ=255) cTTGTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCact > 1:745452/1‑141 (MQ=255) gTAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATGACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCactacc > 2:433658/1‑140 (MQ=255) tAAATTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTg > 2:89211/1‑141 (MQ=255) agttattGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAAGAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCt < 2:399021/139‑1 (MQ=255) aaTTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCt < 1:776178/141‑1 (MQ=255) aaTTATTGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATACCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCt > 2:282886/1‑141 (MQ=255) tattGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAAt > 1:244683/1‑141 (MQ=255) attGTTGTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATa > 2:268370/1‑141 (MQ=255) ttgttgTTTGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAg < 1:397843/141‑1 (MQ=255) ttGCTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAggg < 2:201302/141‑1 (MQ=255) cTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGTGatt < 1:618138/141‑1 (MQ=255) cTTCTCGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGatt > 2:161921/1‑141 (MQ=255) tctcGTAGTAACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGcttta > 1:8521/1‑141 (MQ=255) cGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTCAATTTTAGATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATGAATCCCCTCACTACTACTAATAGTGAAGGGatttattt > 2:680203/1‑141 (MQ=255) cGTAGTAACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACACTTTATACTCTAGACATAACAGCAACTCTAAAATATCTA‑GTACCTAGTACATCCCCTCACTACTGCTAATTGTGCAGGAatgtatgt > 2:25884/1‑139 (MQ=255) gagtaACAGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGAtttatttta < 1:797628/140‑1 (MQ=255) agtaACAGATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGAtttattttat < 2:220028/141‑1 (MQ=255) cAGAGTGGCCGATAGAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGGGACACAAGTTATAAGCTAAACATAACAGCACATCTCGAAT‑TATGCGACACTAATAGAGCCCCCAGGTGCGGCTAATAGTGAAGCGATTTATTTTATTACtt < 2:878245/141‑1 (MQ=255) aGATTGGCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTa < 1:708801/141‑1 (MQ=255) gATTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAg > 1:837697/1‑141 (MQ=255) aTTGGCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGa < 1:419142/141‑1 (MQ=255) ttGGCCTATAAAATAGTCAATTTTATATGCGTGTGCACCACTATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGAc < 2:862123/141‑1 (MQ=255) ggCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCCCTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTTTTTCTTAGACGt < 2:530717/141‑1 (MQ=255) ggCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGt < 1:321969/141‑1 (MQ=255) ggCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGt < 2:35390/141‑1 (MQ=255) ggCCTATATAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAACTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTCATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGt < 1:696265/141‑1 (MQ=255) ggCCTATACAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGt > 1:589417/1‑141 (MQ=255) ccTAAAAAATAGTAAATTTTATATGAGTGTGTACCACAATTTATAATCTAAACATAACAGCAAATCTCAAATATCTG‑GAACCTAATAAATCCCCTCACTACTGCTAATAGTGAAGGGATTTATTTTATTACTTAGACGTaa < 2:6510/141‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |